Cadhérine E

CDH1
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

1O6S, 2O72, 2OMT, 2OMU, 2OMV, 2OMX, 2OMY, 2OMZ, 3FF7, 3FF8, 3L6X, 3L6Y, 4ZT1, 4ZTE

Identifiants
AliasesCDH1
IDs externesOMIM: 192090 MGI: 88354 HomoloGene: 20917 GeneCards: CDH1
Position du gène (Homme)
Chromosome 16 humain
Chr.Chromosome 16 humain[1]
Chromosome 16 humain
Localisation génomique pour CDH1
Localisation génomique pour CDH1
Locus16q22.1Début68,737,292 bp[1]
Fin68,835,537 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 8 (souris)
Chr.Chromosome 8 (souris)[2]
Chromosome 8 (souris)
Localisation génomique pour CDH1
Localisation génomique pour CDH1
Locus8 D3|8 53.18 cMDébut107,329,983 bp[2]
Fin107,396,878 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • muqueuse jéjunale

  • palpebral conjunctiva

  • cellule épithéliale bronchiale

  • duodénum

  • vulve

  • pénis humain

  • follicule pileux

  • cavité buccale

  • îlot de Langerhans

  • rectum
Fortement exprimé dans
  • epithelium of stomach

  • left colon

  • strie vasculaire

  • mucous cell of stomach

  • glande submandibulaire

  • antre du pylore

  • left lung lobe

  • iléon

  • conjunctival fornix

  • molaire
Plus de données d'expression de référence
BioGPS


Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • Calcium liaison ionique
  • liaison protéique
  • ankyrin binding
  • gamma-catenin binding
  • beta-catenin binding
  • GTPase activating protein binding
  • liaison ion métal
  • cell adhesion molecule binding
  • cadherin binding
  • identical protein binding
  • cytoskeletal protein binding
  • protein homodimerization activity
Composant cellulaire
  • apical junction complex
  • trans-Golgi network
  • région extracellulaire
  • perinuclear region of cytoplasm
  • cortical actin cytoskeleton
  • appareil de Golgi
  • Lamellipode
  • cytoplasmic side of plasma membrane
  • endosome
  • lateral plasma membrane
  • catenin complex
  • actin cytosquelette
  • flotillin complex
  • membrane
  • exosome
  • integral component of membrane
  • jonction cellulaire
  • cytoplasme
  • membrane plasmique
  • surface cellulaire
  • postsynapse
  • glutamatergic synapse
Processus biologique
  • negative regulation of cell-cell adhesion
  • régulation positive de la transcription dépendante de l'ADN
  • cellular response to lithium ion
  • adhésion cellulaire
  • extracellular matrix organization
  • cellular response to indole-3-methanol
  • extracellular matrix disassembly
  • Synaptogenèse
  • pituitary gland development
  • réponse à une substance toxique
  • response to organic substance
  • neuron projection development
  • adherens junction organization
  • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules
  • entry of bacterium into host cell
  • protein localization to plasma membrane
  • cell-cell adhesion
  • cell morphogenesis
  • cell-cell junction assembly
  • régulation de l'expression des gènes
  • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
  • negative regulation of cell migration
  • positive regulation of protein import into nucleus
  • cell-cell adhesion mediated by cadherin
  • regulation of protein catabolic process at postsynapse, modulating synaptic transmission
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

999

12550

Ensembl

ENSG00000039068

ENSMUSG00000000303

UniProt

P12830

P09803

RefSeq (mRNA)

NM_004360
NM_001317184
NM_001317185
NM_001317186

NM_009864

RefSeq (protéine)

NP_001304113
NP_001304114
NP_001304115
NP_004351

NP_033994

Localisation (UCSC)Chr 16: 68.74 – 68.84 MbChr 8: 107.33 – 107.4 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

La cadhérine E (ou ovomoruline ou cadhérine 1 ou CD324) est une protéine de type cadhérine dont le taux sanguin est un marqueur tumoral. Son gène est CDH1 situé sur le chromosome 16 humain.

Structure

Elle consiste en 5 séquences de cadhérine dans le domaine extracellulaire, un domaine transmembranaire, et un domaine intracellulaire qui lie la beta-caténine. La beta-caténine se lie à l'alpha-caténine qui à son tour se lie aux microfilaments d'actine, ce qui relie l’E-cadhérine au cytosquelette. Dans certains cas, la beta-caténine peut être remplacée par une gamma-caténine.

Rôles

La cadhérine E est présente dès les premières divisions cellulaires chez l'embryon de mammifère. C'est elle qui provoque la compaction au stade 8 cellules et contribue à former un premier épithélium à l'origine du trophectoderme (qui participera à la formation du placenta) qui se sépare de la masse cellulaire interne (à l'origine de l'embryon stricto sensu et de quelques annexes extra-embryonnaires). C'est la cadhérine E d'origine maternelle qui intervient ici puisque chez les embryons où le gène codant la cadhérine E n'est plus fonctionnel, ces événements se passent normalement.

La diminution ou la perte de l'expression de la cadhérine E (ou de la N-cadhérine dans les tissus nerveux) est associée aux transitions épithélio-mésenchymateuses qui permettent à des cellules épithéliales de devenir mésenchymateuses et de migrer (exemple : la gastrulation chez les amniotes, ou la formation des cellules de la crête neurale).

En cancérologie

La perte des cadhérines est souvent associée à la formation de métastases à partir des carcinomes (tumeurs des épithéliums). En effet, des cellules perdant l'expression des cadhérines perdent en même temps leur « inhibition de contact » et la perturbation de la liaison cadhérine E - caténine est probablement un élément de la cancérogenèse[5].

Son absence peut servir de marqueur de l'existence d'un cancer du sein lobulaire invasif (cette absence est rare dans les cancers non lobulaires[6]. Elle est exprimée de manière plus importante en cas de métastases[7].


Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000039068 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000000303 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. Wijnhoven BP, Dinjens WN, Pignatelli M., E-cadherin-catenin cell-cell adhesion complex and human cancer, Br J Surg, 2000;87:992-1005
  6. Singhai R, Patil VW, Jaiswal SR et al. [ http://www.najms.org/article.asp?issn=1947-2714;year=2011;volume=3;issue=5;spage=227;epage=233;aulast=Singhai E-Cadherin as a diagnostic biomarker in breast cancer], North Am J Med Sci, 2011;3:227-33
  7. Kowalski PJ, Rubin MA, Kleer CG, E-cadherin expression in primary carcinomas of the breast and its distant metastases, Breast Cancer Res, 2003;5:217-22
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