KHDRBS3

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KHDRBS3
Visualisation de la protéine Cristallisée KHDRBS3
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

5ELR, 5ELS, 5EMO, 5ELT, 5EL3

Identifiants
AliasesKHDRBS3
IDs externesOMIM: 610421 MGI: 1313312 HomoloGene: 4780 GeneCards: KHDRBS3
Position du gène (Souris)
Chromosome 15 (souris)
Chr.Chromosome 15 (souris)[1]
Chromosome 15 (souris)
Localisation génomique pour KHDRBS3
Localisation génomique pour KHDRBS3
Locus15 D3|15 30.36 cMDébut68,800,269 bp[1]
Fin68,973,060 bp[1]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • gyrus temporal moyen

  • cortex préfrontal

  • Brodmann area 9

  • secondary oocyte

  • Brodmann area 23

  • sperme

  • Brodmann area 46

  • gyrus cingulaire

  • cortex orbitofrontal

  • amygdale
Fortement exprimé dans
  • septum interventriculaire

  • cortex visuel

  • gyrus frontal supérieur

  • hippocampus proper

  • cortex préfrontal

  • gyrus précentral

  • Subiculum

  • Épithélium olfactif

  • molaire

  • gyrus cingulaire
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • SH3 domain binding
  • liaison protéique
  • liaison ARN
  • Fixation d'acide nucléique
  • protein domain specific binding
  • identical protein binding
Composant cellulaire
  • noyau
  • nucléoplasme
Processus biologique
  • regulation of transcription, DNA-templated
  • transcription, DNA-templated
  • mRNA processing
  • regulation of mRNA splicing, via spliceosome
  • protein complex oligomerization
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

10656

13992

Ensembl

n/a

ENSMUSG00000022332

UniProt

O75525

Q9R226

RefSeq (mRNA)

NM_006558

NM_010158

RefSeq (protéine)

NP_006549

NP_034288

Localisation (UCSC)n/aChr 15: 68.8 – 68.97 Mb
Publication PubMed[2][3]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

La KHDRBS3 (pour « KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 3 » en anglais) est une protéine codée par le gène KHDRBS3, présent sur le chromosome 8 humain et le chromosome 15 de la souris[4],[5],[6].

Interaction

La KHDRBS3 interagit avec la protéine SIAH1 (en)[7],[8].

Notes et références

  • (en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « KHDRBS3 » (voir la liste des auteurs).
  1. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022332 - Ensembl, May 2017
  2. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  3. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. (en) Venables JP, Vernet C, Chew SL, Elliott DJ, Cowmeadow RB, Wu J, Cooke HJ, Artzt K, Eperon IC, « T-STAR/ETOILE: a novel relative of SAM68 that interacts with an RNA-binding protein implicated in spermatogenesis », Hum Mol Genet, vol. 8, no 6,‎ , p. 959–69 (PMID 10332027, DOI 10.1093/hmg/8.6.959).
  5. (en) Lee J, Burr JG, « Salpalpha and Salpbeta, growth-arresting homologs of Sam68 », Gene, vol. 240, no 1,‎ , p. 133–47 (PMID 10564820, DOI 10.1016/S0378-1119(99)00421-7).
  6. (en) « Entrez Gene: KHDRBS3 KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 3 ».
  7. (en) Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M, « Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network », Nature, vol. 437, no 7062,‎ , p. 1173–8 (PMID 16189514, DOI 10.1038/nature04209).
  8. (en) Venables JP, Dalgliesh C, Paronetto MP, Skitt L, Thornton JK, Saunders PT, Sette C, Jones KT, Elliott DJ, « SIAH1 targets the alternative splicing factor T-STAR for degradation by the proteasome », Hum. Mol. Genet., vol. 13, no 14,‎ , p. 1525–34 (PMID 15163637, DOI 10.1093/hmg/ddh165).

Bibliographie

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  • (en) Venables JP, Elliott DJ, Makarova OV, Makarov EM, Cooke HJ, Eperon IC, « RBMY, a probable human spermatogenesis factor, and other hnRNP G proteins interact with Tra2beta and affect splicing. », Hum. Mol. Genet., vol. 9, no 5,‎ , p. 685–94 (PMID 10749975, DOI 10.1093/hmg/9.5.685)
  • (en) Stoss O, Olbrich M, Hartmann AM, Konig H, Memmott J, Andreadis A, Stamm S, « The STAR/GSG family protein rSLM-2 regulates the selection of alternative splice sites. », J. Biol. Chem., vol. 276, no 12,‎ , p. 8665–73 (PMID 11118435, DOI 10.1074/jbc.M006851200)
  • (en) Sugimoto Y, Morita R, Amano K, Shah PU, Pascual-Castroviejo I, Khan S, Delgado-Escueta AV, Yamakawa K, « T-STAR gene: fine mapping in the candidate region for childhood absence epilepsy on 8q24 and mutational analysis in patients. », Epilepsy Res., vol. 46, no 2,‎ , p. 139–44 (PMID 11463515, DOI 10.1016/S0920-1211(01)00274-1)
  • (en) Kool J, van Zaane W, van der Eb AJ, Terleth C, « Down-regulation of T-STAR, a growth inhibitory protein, after SV40-mediated immortalization. », Cell Growth Differ., vol. 12, no 11,‎ , p. 535–41 (PMID 11714634)
  • (en) Reddy TR, Suhasini M, Xu W, Yeh LY, Yang JP, Wu J, Artzt K, Wong-Staal F, « A role for KH domain proteins (Sam68-like mammalian proteins and quaking proteins) in the post-transcriptional regulation of HIV replication. », J. Biol. Chem., vol. 277, no 8,‎ , p. 5778–84 (PMID 11741900, DOI 10.1074/jbc.M106836200)
  • (en) Côté J, Boisvert FM, Boulanger MC, Bedford MT, Richard S, « Sam68 RNA binding protein is an in vivo substrate for protein arginine N-methyltransferase 1. », Mol. Biol. Cell, vol. 14, no 1,‎ , p. 274–87 (PMID 12529443, PMCID 140244, DOI 10.1091/mbc.E02-08-0484)
  • (en) Venables JP, Dalgliesh C, Paronetto MP, Skitt L, Thornton JK, Saunders PT, Sette C, Jones KT, Elliott DJ, « SIAH1 targets the alternative splicing factor T-STAR for degradation by the proteasome. », Hum. Mol. Genet., vol. 13, no 14,‎ , p. 1525–34 (PMID 15163637, DOI 10.1093/hmg/ddh165)
  • (en) Cohen CD, Doran PP, Blattner SM, Merkle M, Wang GQ, Schmid H, Mathieson PW, Saleem MA, Henger A, Rastaldi MP, Kretzler M, « Sam68-like mammalian protein 2, identified by digital differential display as expressed by podocytes, is induced in proteinuria and involved in splice site selection of vascular endothelial growth factor. », J. Am. Soc. Nephrol., vol. 16, no 7,‎ , p. 1958–65 (PMID 15901763, DOI 10.1681/ASN.2005020204)
  • (en) Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M, « Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network. », Nature, vol. 437, no 7062,‎ , p. 1173–8 (PMID 16189514, DOI 10.1038/nature04209)
  • (en) Zhang L, Guo L, Peng Y, Chen B, « Expression of T-STAR gene is associated with regulation of telomerase activity in human colon cancer cell line HCT-116. », World J. Gastroenterol., vol. 12, no 25,‎ , p. 4056–60 (PMID 16810759)
  • (en) Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M, « Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks. », Cell, vol. 127, no 3,‎ , p. 635–48 (PMID 17081983, DOI 10.1016/j.cell.2006.09.026)

Voir aussi

Liens internes

  • KHDRBS1 (en)
  • icône décorative Portail de la biologie cellulaire et moléculaire