Nucléoporine 88

NUP88
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

7R5J, 7R5K, 7TDZ, 7VOP

Identifiants
AliasesNUP88
IDs externesOMIM: 602552 MGI: 104900 HomoloGene: 1901 GeneCards: NUP88
Position du gène (Homme)
Chromosome 17 humain
Chr.Chromosome 17 humain[1]
Chromosome 17 humain
Localisation génomique pour NUP88
Localisation génomique pour NUP88
Locus17p13.2Début5,360,963 bp[1]
Fin5,419,676 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 11 (souris)
Chr.Chromosome 11 (souris)[2]
Chromosome 11 (souris)
Localisation génomique pour NUP88
Localisation génomique pour NUP88
Locus11 B4|11 43.21 cMDébut70,833,884 bp[2]
Fin70,860,799 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • ovocyte

  • right lobe of liver

  • secondary oocyte

  • sperme

  • left lobe of thyroid gland

  • right lobe of thyroid gland

  • tendon calcanéen

  • thymus

  • muscle gastrocnémien

  • éminence ganglionnaire
Fortement exprimé dans
  • secondary oocyte

  • medial ganglionic eminence

  • spermatocyte

  • paroi abdominale

  • ventricule droit

  • tube séminifère

  • spermatide

  • Vésicule vitelline

  • maxillary prominence

  • ganglion cervical supérieur
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • transporter activity
  • structural constituent of nuclear pore
Composant cellulaire
  • cytosol
  • pore nucléaire
  • nucléoplasme
  • noyau
  • host cell
Processus biologique
  • mRNA transport
  • protein import into nucleus
  • protein transport
  • viral process
  • mRNA export from nucleus
  • mitose
  • ribosomal large subunit export from nucleus
  • ribosomal small subunit export from nucleus
  • nucleocytoplasmic transport
  • protein export from nucleus
  • regulation of glycolytic process
  • tRNA export from nucleus
  • Sumoylation
  • viral transcription
  • regulation of gene silencing by miRNA
  • intracellular transport of virus
  • regulation of cellular response to heat
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

4927

19069

Ensembl

ENSG00000108559

ENSMUSG00000040667

UniProt

Q99567

Q8CEC0

RefSeq (mRNA)

NM_002532
NM_001320653

NM_001083331
NM_001276406
NM_172394

RefSeq (protéine)

NP_001307582
NP_002523

NP_001076800
NP_001263335
NP_765982

Localisation (UCSC)Chr 17: 5.36 – 5.42 MbChr 11: 70.83 – 70.86 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

La nucléoporine 88 est une porine dont le gène est NUP88 situe sur le chromosome 17 humain.

Rôles

Elle fait partie du complexe protéique formant la pore nucléaire[5] d'où elle tire son nom[6]. Son poids moléculaire est de 88 Kdaltons. Elle joue un rôle dans la mitose et favoriserait la formation de cellules à plusieurs noyaux[7] ainsi qu'une aneuploïdie en favorisant la protéolyse du PLK1[8].

En médecine

Elle est présente dans beaucoup de cellules cancéreuses mais peu dans les cellules des tumeurs bénignes. Les autres nucléoporines n'ont pas cette spécificité[6].

Sa présence est corrélée avec des formes plus agressives du cancer colorectal[9].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000108559 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040667 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. Xu S, Powers MA, Nuclear pore proteins and cancer, Semin Cell Dev Biol, 2009;20:620–630
  6. a et b Gould VE, Orucevic A, Zentgraf H, Gattuso P, Martinez N, Alonso A, Nup88 (karyoporin) in human malignant neoplasms and dysplasias: correlations of immunostaining of tissue sections, cytologic smears, and immunoblot analysis, Hum Pathol, 2002;33:536–544
  7. Hashizume C, Nakano H, Yoshida K, Wong RW, Characterization of the role of the tumor marker Nup88 in mitosis, Mol Cancer, 2010;9:119
  8. Naylor RM, Jeganathan KB, Cao X, van Deursen JM, Nuclear pore protein NUP88 activates anaphase-promoting complex to promote aneuploidy, J Clin Invest, 2016;126:543-559
  9. Emterling A, Skoglund J, Arbman G et al. Clinicopathological significance of Nup88 expression in patients with colorectal cancer, Oncology, 2003;64:361–369
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