RIG-I

DDX58
사용 가능한 구조 PDB 동원체 검색: PDBe RCSB PDB ID 코드 목록 2LWD, 2LWE, 2QFB, 2QFD, 2RMJ, 2YKG, 3LRN, 3LRR, 3NCU, 3OG8, 3ZD6, 3ZD7, 4AY2, 4BPB, 4NQK, 4ON9, 4P4H, 5E3H, 5F98, 5F9F, 5F9H
식별자
다른 이름	DDX58, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 58, RIGI, RLR-1, SGMRT2, RIG-I, DEXD/H-box helicase 58, RIG1
외부 ID	OMIM: 609631 MGI: 2442858 HomoloGene: 32215 GeneCards: DDX58
유전자 위치 (인간) 염색체 9번 염색체[1] 자리 9p21.1 시작 32,455,302 bp[1] 끝 32,526,208 bp[1]
유전자 위치 (쥐) 염색체 4번 염색체 (쥐)[2] 자리 4|4 A5 시작 40,203,773 bp[2] 끝 40,239,828 bp[2]
RNA 발현 패턴 Bgee 인간 쥐(동원체) 최상위 발현 buccal mucosa cell skin of thigh tendon of biceps brachii 백혈구 단핵구 혈액 아킬레스건 과립구 internal globus pallidus superficial temporal artery 최상위 발현 과립구 mesenteric lymph nodes lumbar spinal ganglion otolith organ 타원주머니 공장 비장 머리덮개뼈 epithelium of small intestine 수정란 추가 참조 발현 데이터 BioGPS 추가 참조 발현 데이터
유전자 온톨로지 분자 함수 nucleotide binding helicase activity zinc ion binding 금속 이온 결합 단백질 결합 single-stranded RNA binding identical protein binding RNA binding double-stranded RNA binding double-stranded DNA binding 가수분해효소 활성 ATP binding nucleic acid binding ubiquitin protein ligase binding 세포 성분 세포질 cell projection 세포막 bicellular tight junction 세포막 ruffle membrane 세포연접 actin cytoskeleton 세포골격 세포액 생물학적 과정 regulation of cell migration response to exogenous dsRNA positive regulation of interferon-alpha production 면역 과정 response to virus cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway in response to virus positive regulation of gene expression positive regulation of granulocyte macrophage colony-stimulating factor production positive regulation of interleukin-8 production positive regulation of interleukin-6 production negative regulation of type I interferon production detection of virus viral process 선천면역 positive regulation of transcription by RNA polymerase II RIG-I signaling pathway regulation of type III interferon production positive regulation of defense response to virus by host positive regulation of interferon-beta production protein deubiquitination positive regulation of response to cytokine stimulus cellular response to exogenous dsRNA defense response to virus positive regulation of DNA-binding transcription factor activity positive regulation of myeloid dendritic cell cytokine production 출처: Amigo / QuickGO
동원체 종 인간 쥐 앙트레 23586 230073 앙상블 ENSG00000107201 ENSMUSG00000040296 유니프롯 O95786 Q6Q899 RefSeq (mRNA) NM_014314 NM_172689 RefSeq(단백질) NP_055129 NP_766277 위치(UCSC) Chr 9: 32.46 – 32.53 Mb Chr 4: 40.2 – 40.24 Mb PubMed 검색 [3] [4]
위키데이터
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RIG-I(retinoic acid-inducible gene I, 레티노산 유도성 유전자 I)은 I형 인터페론(IFN1) 반응의 유도를 중재할 수 있는 세포질 패턴인식수용체(PRR)이다. RIG-I는 바이러스에 감염된 세포를 인식하는 선천 면역 체계의 필수 분자이다. 이러한 바이러스에는 웨스트 나일 바이러스, 일본 뇌염 바이러스, 인플루엔자 A, 센다이 바이러스, 플라비바이러스 및 코로나바이러스가 포함될 수 있다.

RIG-I는 바이러스의 면역자극 RNA와 다른 기원의 RNA에 의해 활성화되는 ATP 의존성 DExD/H 박스 RNA 헬리카제이다. RIG-I는 5' 트리- 또는 디-포스페이트 말단 또는 5' 7-메틸 구아노신(m7G) 캡(cap-0)이 있는 세포질에서 짧은 이중 가닥 RNA(dsRNA)를 인식하지만 5' 트리- 또는 디-포스페이트 끝이 있는 RNA는 인식하지 않는다. 리보스 2'-O-메틸 변형을 갖는 m7G 캡(cap-1). 이는 바이러스 감염 중에 생성되는 경우가 많지만 숙주에서 유래할 수도 있다. dsRNA에 의해 활성화되면 N-말단 카스파제 활성화 및 모집 도메인(CARD)이 이동하여 미토콘드리아 항바이러스 신호전달 단백질(MAVS)에 부착된 CARD와 결합하여 IFN1의 신호전달 경로를 활성화한다.

타입-I IFN은 세 가지 주요 기능을 가지고 있다. 즉, 바이러스가 인근 세포로 확산되는 것을 제한하고, 염증 반응을 포함한 선천적 면역 반응을 촉진하며, 적응 면역 체계를 활성화하는 데 도움을 준다. 다른 연구에 따르면 암세포와 같은 다양한 미세 환경에서 RIG-I는 바이러스 인식 이외의 더 많은 기능을 가지고 있는 것으로 나타났다. RIG-I 오솔로그는 포유류, 거위, 오리, 일부 물고기 및 일부 파충류에서 발견된다. RIG-I는 다양한 선천성 면역체계 세포를 포함한 대부분의 세포에 존재하며 일반적으로 비활성 상태이다. 삭제되거나 기능하지 않는 RIG-I 유전자를 갖도록 설계된 녹아웃 마우스는 건강하지 않으며 일반적으로 배아에서 죽는다. 살아남는다면 생쥐는 심각한 발달 장애를 갖게 된다. 인터페론 유전자 STING의 자극제는 RIG-I 신호 전달 및 관련 자가면역의 과잉 활성화를 피하기 위해 N 말단을 결합하여 RIG-I에 길항한다.