KEGG

KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes
Type databank
Taal Engels
Eigenaar Universiteit van Kioto
Opgericht 1995
Status actief
Link www.kegg.jp
Portaal  Portaalicoon   Media

KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) is een verzameling vrije databases die betrekking hebben op genomen, systeembiologie, ziekten, geneesmiddelen en biochemische stoffen. KEGG wordt gebruikt voor onderzoek en educatie in de bioinformatica, inclusief data-analyse in genomica, metagenomica, metabolomica en andere omics-gebieden, modellering en simulatie in systeembiologie en ontwikkeling van geneesmiddelen.

Het KEGG-databaseproject werd in 1995 gelanceerd door Minoru Kanehisa, professor aan het Institute for Chemical Research, Universiteit van Kioto, tijdens het toen lopende Japanse menselijkgenoomproject.[1][2] Hij voorzag de behoefte aan een geautomatiseerde informatiebron die gebruikt kon worden voor de biologische interpretatie van genoomsequentiegegevens en begon aan de ontwikkeling van de KEGG PATHWAY-database. Hierin werd experimentele kennis over metabolisme en verschillende andere functies van de cel vastgelegd.[3]

Zie ook

  • Gene Ontology
  • UniProt

Externe link

  • Officiële website

Bronnen

  1. (en) Kanehisa M, Goto S (2000). KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes. Nucleic Acids Res 28 (1): 27–30. PMID 10592173. PMC 102409. DOI: 10.1093/nar/28.1.27.
  2. (en) Kanehisa M (1997). A database for post-genome analysis. Trends Genet 13 (9): 375–6. PMID 9287494. DOI: 10.1016/S0168-9525(97)01223-7.
  3. (en) Kanehisa M, Goto S, Hattori M, Aoki-Kinoshita KF, Itoh M, Kawashima S, Katayama T, Araki M, Hirakawa M (2006). From genomics to chemical genomics: new developments in KEGG. Nucleic Acids Res 34 (Database issue): D354–7. PMID 16381885. PMC 1347464. DOI: 10.1093/nar/gkj102.