3. etappe av Tour de France 2016 var en 223,5 km lang fellesstartetappe som gikk av stabelen 4. juli 2016. Etappen startet i Granville og endte i Angers. Mark Cavendish (Team Dimension Data) vant etappen foran André Greipel (Lotto-Soudal) og Bryan Coquard (Team Direct Énergie). Peter Sagan (Tinkoff) og Julian Alaphilippe (Etixx-Quick Step) beholdt henholdsvis den gule og den hvite trøyen, mens Cavendish overtok den grønne trøyen fra Sagan.