60S рибосомный белок L12 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b5/Protein_RPL12_PDB_1wib.png/250px-Protein_RPL12_PDB_1wib.png) |
Доступные структуры |
---|
PDB | Поиск ортологов: PDBe RCSB |
---|
Список идентификаторов PDB |
---|
4V6X, 5AJ0, 3J92, 4V5Z, 5A8L |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | RPL12, L12, ribosomal protein L12 |
---|
Внешние ID | OMIM: 180475 MGI: 98002 HomoloGene: 128047 GeneCards: RPL12 |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
![2-я хромосома мыши](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/bb/Ideogram_house_mouse_chromosome_2.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_2.svg.png) | Хр. | 2-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 2|2 B | Начало | 32,851,571 bp[2] |
---|
Конец | 32,855,357 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - olfactory zone of nasal mucosa
- skin of abdomen
- skin of leg
- lactiferous gland
|
| | Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | ![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/ab/PBB_GE_RPL12_200809_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_RPL12_200809_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f0/PBB_GE_RPL12_214271_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_RPL12_214271_x_at_fs.png) | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - связывание с белками плазмы
- structural constituent of ribosome
- rRNA binding
- RNA binding
- large ribosomal subunit rRNA binding
| Компонент клетки | - цитозоль
- экзосома
- мембрана
- cytosolic large ribosomal subunit
- фокальные контакты
- рибосома
- внеклеточный матрикс
- клеточное ядро
- ядрышко
- цитоплазма
- постсинаптическое уплотнение
- large ribosomal subunit
| Биологический процесс | - translational initiation
- SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
- нонсенс-опосредованный распад
- ribosomal large subunit assembly
- viral transcription
- Биосинтез белка
- rRNA processing
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Chr 9: 127.45 – 127.45 Mb | Chr 2: 32.85 – 32.86 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
60S рибосомальный белок L12 - рибосомальный белок, который в геноме человека кодируется геном RPL12.[5][6]
Функция
Рибосомы, клеточные органеллы, обеспечивающие синтез белка (трансляцию), состоят из двух субъединиц: малой - с коэффициентом седиментации - 40S и большой - 60S субъединицы. Эти субъединицы образованы 4 видами РНК и около 80 структурно различными белками. Ген RPL12 кодирует рибосомальный белок, являющийся компонентом 60S субъединицы. Белок принадлежит к L11P семейству рибосомных белков. RPL12 локализуется в цитоплазме клетки. Белок связывает непосредственно 26S рРНК. Ген RPL12 котранскрибируется с мякРНК U65, ген которой расположен в четвёртом интроне гена RPL12. Как это характерно для генов, кодирующих рибосомальные белки, в разных частях генома располагаются несколько процессируемых псевдогенов.
Взаимодействие
Показано, что RPL12 взаимодействует с CDC5L.[7]
См. также
Ссылки
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000197958 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038900 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Chu W., Presky D. H., Swerlick R. A., Burns D. K. The primary structure of human ribosomal protein L12 (англ.) // Nucleic Acids Res : journal. — 1993. — March (vol. 21, no. 3). — P. 749. — doi:10.1093/nar/21.3.749. — PMID 8441690. — PMC 309184.
- ↑ Entrez Gene: RPL12 ribosomal protein L12 (неопр.).
- ↑ Ajuh P., Kuster B., Panov K., Zomerdijk J. C., Mann M., Lamond A. I. Functional analysis of the human CDC5L complex and identification of its components by mass spectrometry (англ.) // EMBO J. : journal. — 2000. — December (vol. 19, no. 23). — P. 6569—6581. — doi:10.1093/emboj/19.23.6569. — PMID 11101529. — PMC 305846.
Дальнейшее чтение