60S рибосомный белок L12

60S рибосомный белок L12
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

4V6X, 5AJ0, 3J92, 4V5Z, 5A8L

Идентификаторы
ПсевдонимыRPL12, L12, ribosomal protein L12
Внешние IDOMIM: 180475 MGI: 98002 HomoloGene: 128047 GeneCards: RPL12
Расположение гена (человек)
9-я хромосома человека
Хр.9-я хромосома человека[1]
9-я хромосома человека
Расположение в геноме RPL12
Расположение в геноме RPL12
Локус9q33.3Начало127,447,674 bp[1]
Конец127,451,406 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
2-я хромосома мыши
Хр.2-я хромосома мыши[2]
2-я хромосома мыши
Расположение в геноме RPL12
Расположение в геноме RPL12
Локус2|2 BНачало32,851,571 bp[2]
Конец32,855,357 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • olfactory zone of nasal mucosa

  • skin of abdomen

  • skin of leg

  • lactiferous gland
Наибольшая экспрессия в
  • ventricular zone
Дополнительные справочные данные
BioGPS


Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • связывание с белками плазмы
  • structural constituent of ribosome
  • rRNA binding
  • RNA binding
  • large ribosomal subunit rRNA binding
Компонент клетки
  • цитозоль
  • экзосома
  • мембрана
  • cytosolic large ribosomal subunit
  • фокальные контакты
  • рибосома
  • внеклеточный матрикс
  • клеточное ядро
  • ядрышко
  • цитоплазма
  • постсинаптическое уплотнение
  • large ribosomal subunit
Биологический процесс
  • translational initiation
  • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
  • нонсенс-опосредованный распад
  • ribosomal large subunit assembly
  • viral transcription
  • Биосинтез белка
  • rRNA processing
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

6136

269261

Ensembl

ENSG00000197958

ENSMUSG00000038900

UniProt

P30050

P35979

RefSeq (мРНК)

NM_000976

NM_009076

RefSeq (белок)

NP_000967

NP_033102

Локус (UCSC)Chr 9: 127.45 – 127.45 MbChr 2: 32.85 – 32.86 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

60S рибосомальный белок L12 - рибосомальный белок, который в геноме человека кодируется геном RPL12.[5][6]

Функция

Рибосомы, клеточные органеллы, обеспечивающие синтез белка (трансляцию), состоят из двух субъединиц: малой - с коэффициентом седиментации - 40S и большой - 60S субъединицы. Эти субъединицы образованы 4 видами РНК и около 80 структурно различными белками. Ген RPL12 кодирует рибосомальный белок, являющийся компонентом 60S субъединицы. Белок принадлежит к L11P семейству рибосомных белков. RPL12 локализуется в цитоплазме клетки. Белок связывает непосредственно 26S рРНК. Ген RPL12 котранскрибируется с мякРНК U65, ген которой расположен в четвёртом интроне гена RPL12. Как это характерно для генов, кодирующих рибосомальные белки, в разных частях генома располагаются несколько процессируемых псевдогенов.

Взаимодействие

Показано, что RPL12 взаимодействует с CDC5L.[7]

См. также

Ссылки

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000197958 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038900 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Chu W., Presky D. H., Swerlick R. A., Burns D. K. The primary structure of human ribosomal protein L12 (англ.) // Nucleic Acids Res : journal. — 1993. — March (vol. 21, no. 3). — P. 749. — doi:10.1093/nar/21.3.749. — PMID 8441690. — PMC 309184.
  6. Entrez Gene: RPL12 ribosomal protein L12  (неопр.).
  7. Ajuh P., Kuster B., Panov K., Zomerdijk J. C., Mann M., Lamond A. I. Functional analysis of the human CDC5L complex and identification of its components by mass spectrometry (англ.) // EMBO J. : journal. — 2000. — December (vol. 19, no. 23). — P. 6569—6581. — doi:10.1093/emboj/19.23.6569. — PMID 11101529. — PMC 305846.

Дальнейшее чтение