Каспаза-6

CASP6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2WDP, 3K7E, 3NKF, 3NR2, 3OD5, 3P45, 3P4U, 3QNW, 3S70, 3S8E, 3V6L, 3V6M, 4EJF, 4FXO, 4HVA, 4IYR, 4N5D, 4N6G, 4N7J, 4N7M, 4NBK, 4NBL, 4NBN

Ідентифікатори

Символи

CASP6, MCH2, Caspase 6, CSP-6

Зовнішні ІД

OMIM: 601532 MGI: 1312921 HomoloGene: 37455 GeneCards: CASP6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity • cysteine-type peptidase activity • endopeptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • identical protein binding • cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
Клітинна компонента	• гіалоплазма • нуклеоплазма • цитоплазма
Біологічний процес	• epithelial cell differentiation • протеоліз • GO:0097285 апоптоз • regulation of apoptotic process • execution phase of apoptosis • cellular response to staurosporine
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


839


12368

Ensembl


ENSG00000138794


ENSMUSG00000027997

UniProt


P55212


O08738

RefSeq (мРНК)


NM_001226 NM_032992


NM_009811

RefSeq (білок)


NP_001217 NP_116787


NP_033941

Локус (UCSC)

Хр. 4: 109.69 – 109.7 Mb

Хр. 3: 129.7 – 129.71 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CASP6 (англ. Caspase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 293 амінокислот, а молекулярна маса — 33 310^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSASGLRRG	HPAGGEENMT	ETDAFYKREM	FDPAEKYKMD	HRRRGIALIF
NHERFFWHLT	LPERRGTCAD	RDNLTRRFSD	LGFEVKCFND	LKAEELLLKI
HEVSTVSHAD	ADCFVCVFLS	HGEGNHIYAY	DAKIEIQTLT	GLFKGDKCHS
LVGKPKIFII	QACRGNQHDV	PVIPLDVVDN	QTEKLDTNIT	EVDAASVYTL
PAGADFLMCY	SVAEGYYSHR	ETVNGSWYIQ	DLCEMLGKYG	SSLEFTELLT
LVNRKVSQRR	VDFCKDPSAI	GKKQVPCFAS	MLTKKLHFFP	KSN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bartke T., Pohl C., Pyrowolakis G., Jentsch S. (2004). Dual role of BRUCE as an antiapoptotic IAP and a chimeric E2/E3 ubiquitin ligase. Mol. Cell. 14: 801—811. PMID 15200957 DOI:10.1016/j.molcel.2004.05.018
Fernandes-Alnemri T., Litwack G., Alnemri E.S. (1995). Mch2, a new member of the apoptotic Ced-3/Ice cysteine protease gene family. Cancer Res. 55: 2737—2742. PMID 7796396

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1507 (англ.) . Архів оригіналу за 13 червня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, P55212 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.