AMY2A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1B2Y, 1BSI, 1CPU, 1HNY, 1KB3, 1KBB, 1KBK, 1KGU, 1KGW, 1KGX, 1U2Y, 1U30, 1U33, 1XCW, 1XCX, 1XD0, 1XD1, 1XGZ, 1XH0, 1XH1, 1XH2, 2CPU, 2QMK, 2QV4, 3BAI, 3BAJ, 3BAK, 3BAW, 3BAX, 3BAY, 3CPU, 3IJ7, 3IJ8, 3IJ9, 3OLD, 3OLE, 3OLG, 3OLI, 4GQQ, 4GQR, 4W93, 4X9Y, 5EMY

Ідентифікатори

Символи

AMY2A, AMY2, AMY2B, PA, amylase, alpha 2A (pancreatic), amylase alpha 2A (pancreatic), amylase alpha 2A

Зовнішні ІД

OMIM: 104650 MGI: 88019 HomoloGene: 20179 GeneCards: AMY2A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• chloride ion binding • calcium ion binding • каталітична активність • GO:0103025 alpha-amylase activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • hydrolase activity, acting on glycosyl bonds • cation binding
Клітинна компонента	• extracellular region • екзосома • міжклітинний простір
Біологічний процес	• carbohydrate catabolic process • polysaccharide digestion • обмін речовин • carbohydrate metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


279


11722

Ensembl


ENSG00000243480


ENSMUSG00000074264

UniProt


P04746


P00687

RefSeq (мРНК)


NM_000699


NM_001110505 NM_007446

RefSeq (білок)


NP_000690


NP_001103975 NP_031472

Локус (UCSC)

Хр. 1: 103.62 – 103.63 Mb

Хр. 3: 113.35 – 113.4 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

AMY2A (англ. Amylase, alpha 2A (pancreatic)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 511 амінокислот, а молекулярна маса — 57 707^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKFFLLLFTI	GFCWAQYSPN	TQQGRTSIVH	LFEWRWVDIA	LECERYLAPK
GFGGVQVSPP	NENVAIYNPF	RPWWERYQPV	SYKLCTRSGN	EDEFRNMVTR
CNNVGVRIYV	DAVINHMCGN	AVSAGTSSTC	GSYFNPGSRD	FPAVPYSGWD
FNDGKCKTGS	GDIENYNDAT	QVRDCRLTGL	LDLALEKDYV	RSKIAEYMNH
LIDIGVAGFR	LDASKHMWPG	DIKAILDKLH	NLNSNWFPAG	SKPFIYQEVI
DLGGEPIKSS	DYFGNGRVTE	FKYGAKLGTV	IRKWNGEKMS	YLKNWGEGWG
FVPSDRALVF	VDNHDNQRGH	GAGGASILTF	WDARLYKMAV	GFMLAHPYGF
TRVMSSYRWP	RQFQNGNDVN	DWVGPPNNNG	VIKEVTINPD	TTCGNDWVCE
HRWRQIRNMV	IFRNVVDGQP	FTNWYDNGSN	QVAFGRGNRG	FIVFNNDDWS
FSLTLQTGLP	AGTYCDVISG	DKINGNCTGI	KIYVSDDGKA	HFSISNSAED
PFIAIHAESK	L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, глікозидаз. Задіяний у такому біологічному процесі як вуглеводний обмін. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, хлоридом. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Gumucio D.L., Wiebauer K., Caldwell R.M., Samuelson L.C., Meisler M.H. (1988). Concerted evolution of human amylase genes. Mol. Cell. Biol. 8: 1197—1205. PMID 2452973 DOI:10.1128/MCB.8.3.1197
Qian M., Haser R., Buisson G., Duee E., Payan F. (1994). The active center of a mammalian alpha-amylase. Structure of the complex of a pancreatic alpha-amylase with a carbohydrate inhibitor refined to 2.2-A resolution. Biochemistry. 33: 6284—6294. PMID 8193143 DOI:10.1021/bi00186a031
Brayer G.D., Luo Y., Withers S.G. (1995). The structure of human pancreatic alpha-amylase at 1.8-A resolution and comparisons with related enzymes. Protein Sci. 4: 1730—1742. PMID 8528071 DOI:10.1002/pro.5560040908

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:477 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P04746 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.