APOL1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук для людей: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 7L6K, 7LF7, 7LFA, 7LFB, 7LFD | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | APOL1, APO-L, APOL, APOL-I, FSGS4, apolipoprotein L1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607254, 603743 GeneCards: APOL1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
focal segmental glomerulosclerosis 4, susceptibility to, focal segmental glomerulosclerosis[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chloride channel activity • lipid binding |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • intrinsic component of membrane • blood microparticle • very-low-density lipoprotein particle • high-density lipoprotein particle • міжклітинний простір • endoplasmic reticulum lumen |
---|
Біологічний процес | • lipoprotein metabolic process • steroid metabolic process • lipid transport • вроджений імунітет • cholesterol metabolic process • Цитоліз • рецептор-опосередкований ендоцитоз • killing of cells of other organism • lipid metabolism • посттрансляційна модифікація • chloride transmembrane transport • GO:0015915 транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001136540 NM_001136541 NM_003661 NM_145343 NM_145344
| NM_001362927 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001130012 NP_001130013 NP_003652 NP_663318 NP_001349856 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 36.25 – 36.27 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [2] | н/д |
---|
Вікідані |
|
APOL1 (англ. Apolipoprotein L1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 398 амінокислот, а молекулярна маса — 43 974[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEGAALLRVS | | VLCIWMSALF | | LGVGVRAEEA | | GARVQQNVPS | | GTDTGDPQSK |
PLGDWAAGTM | | DPESSIFIED | | AIKYFKEKVS | | TQNLLLLLTD | | NEAWNGFVAA |
AELPRNEADE | | LRKALDNLAR | | QMIMKDKNWH | | DKGQQYRNWF | | LKEFPRLKSE |
LEDNIRRLRA | | LADGVQKVHK | | GTTIANVVSG | | SLSISSGILT | | LVGMGLAPFT |
EGGSLVLLEP | | GMELGITAAL | | TGITSSTMDY | | GKKWWTQAQA | | HDLVIKSLDK |
LKEVREFLGE | | NISNFLSLAG | | NTYQLTRGIG | | KDIRALRRAR | | ANLQSVPHAS |
ASRPRVTEPI | | SAESGEQVER | | VNEPSILEMS | | RGVKLTDVAP | | VSFFLVLDVV |
YLVYESKHLH | | EGAKSETAEE | | LKKVAQELEE | | KLNILNNNYK | | ILQADQEL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм ліпідів, транспорт, метаболізм холестеролу, транспорт ліпідів, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.
Література
- Page N.M., Butlin D.J., Lomthaisong K., Lowry P.J. (2001). The human apolipoprotein L gene cluster: identification, classification, and sites of distribution. Genomics. 74: 71—78. PMID 11374903 DOI:10.1006/geno.2001.6534
- Monajemi H., Fontijn R.D., Pannekoek H., Horrevoets A.J.G. (2002). The apolipoprotein L gene cluster has emerged recently in evolution and is expressed in human vascular tissue. Genomics. 79: 539—546. PMID 11944986 DOI:10.1006/geno.2002.6729
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Duchateau P.N., Pullinger C.R., Cho M.H., Eng C., Kane J.P. (2001). Apolipoprotein L gene family: tissue-specific expression, splicing, promoter regions; discovery of a new gene. J. Lipid Res. 42: 620—630. PMID 11290834
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з APOL1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:618 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O14791 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |