CAPRIN1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4WBE, 4WBP

Ідентифікатори

Символи

CAPRIN1, GPIAP1, GPIP137, GRIP137, M11S1, RNG105, p137GPI, cell cycle associated protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 601178 MGI: 1858234 HomoloGene: 4310 GeneCards: CAPRIN1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• cytoplasmic stress granule • дендрит (нейробіологія) • P-body • integral component of plasma membrane • cell projection • мембрана • цитоплазма • гіалоплазма • синапс
Біологічний процес	• диференціація клітин • negative regulation of translation • positive regulation of dendrite morphogenesis • positive regulation of dendritic spine morphogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4076


53872

Ensembl


ENSG00000135387


ENSMUSG00000027184

UniProt


Q14444


Q60865

RefSeq (мРНК)


NM_005898 NM_203364


NM_001111289 NM_001111290 NM_001111291 NM_001111292 NM_016739

RefSeq (білок)


NP_005889 NP_976240


NP_001104759 NP_001104760 NP_001104761 NP_001104762 NP_058019

Локус (UCSC)

Хр. 11: 34.05 – 34.1 Mb

Хр. 2: 103.59 – 103.63 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CAPRIN1 (англ. Cell cycle associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 709 амінокислот, а молекулярна маса — 78 366^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPSATSHSGS	GSKSSGPPPP	SGSSGSEAAA	GAGAAAPASQ	HPATGTGAVQ
TEAMKQILGV	IDKKLRNLEK	KKGKLDDYQE	RMNKGERLNQ	DQLDAVSKYQ
EVTNNLEFAK	ELQRSFMALS	QDIQKTIKKT	ARREQLMREE	AEQKRLKTVL
ELQYVLDKLG	DDEVRTDLKQ	GLNGVPILSE	EELSLLDEFY	KLVDPERDMS
LRLNEQYEHA	SIHLWDLLEG	KEKPVCGTTY	KVLKEIVERV	FQSNYFDSTH
NHQNGLCEEE	EAASAPAVED	QVPEAEPEPA	EEYTEQSEVE	STEYVNRQFM
AETQFTSGEK	EQVDEWTVET	VEVVNSLQQQ	PQAASPSVPE	PHSLTPVAQA
DPLVRRQRVQ	DLMAQMQGPY	NFIQDSMLDF	ENQTLDPAIV	SAQPMNPTQN
MDMPQLVCPP	VHSESRLAQP	NQVPVQPEAT	QVPLVSSTSE	GYTASQPLYQ
PSHATEQRPQ	KEPIDQIQAT	ISLNTDQTTA	SSSLPAASQP	QVFQAGTSKP
LHSSGINVNA	APFQSMQTVF	NMNAPVPPVN	EPETLKQQNQ	YQASYNQSFS
SQPHQVEQTE	LQQEQLQTVV	GTYHGSPDQS	HQVTGNHQQP	PQQNTGFPRS
NQPYYNSRGV	SRGGSRGARG	LMNGYRGPAN	GFRGGYDGYR	PSFSNTPNSG
YTQSQFSAPR	DYSGYQRDGY	QQNFKRGSGQ	SGPRGAPRGR	GGPPRPNRGM
PQMNTQQVN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів синтезу білка, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, клітинних відростках.

Література

Ellis J.A., Luzio J.P. (1995). Identification and characterization of a novel protein (p137) which transcytoses bidirectionally in Caco-2 cells. J. Biol. Chem. 270: 20717—20723. PMID 7657653 DOI:10.1074/jbc.270.35.20717
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Gessler M., Klant B., Tsaoussidou S., Ellis J.A., Luzio J.P. (1996). The gene encoding the GPI-anchored membrane protein p137GPI (M11S1) maps to human chromosome 11p13 and is highly conserved in the mouse. Genomics. 32: 169—170. PMID 8786113 DOI:10.1006/geno.1996.0099
Shiina N., Tokunaga M. (2010). RNA granule protein 140 (RNG140), a paralog of RNG105 localized to distinct RNA granules in neuronal dendrites in the adult vertebrate brain. J. Biol. Chem. 285: 24260—24269. PMID 20516077 DOI:10.1074/jbc.M110.108944

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6743 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q14444 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.