CDC5L

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2DIM, 2DIN

Ідентифікатори

Символи

CDC5L, CDC5, CDC5-LIKE, CEF1, PCDC5RP, dJ319D22.1, cell division cycle 5 like

Зовнішні ІД

OMIM: 602868 MGI: 1918952 HomoloGene: 13291 GeneCards: CDC5L

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • protein phosphatase 1 binding • leucine zipper domain binding • WD40-repeat domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription corepressor binding • protein kinase binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• цитоплазма • nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • мембрана • Prp19 complex • нуклеоплазма • protein-DNA complex • perinuclear region of cytoplasm • DNA replication factor A complex • spliceosomal complex • клітинне ядро • U2-type catalytic step 2 spliceosome
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • cellular response to nerve growth factor stimulus • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • mRNA processing • cellular response to fibroblast growth factor stimulus • transcription, DNA-templated • cellular response to interleukin-2 • cellular response to prolactin • cellular response to DNA damage stimulus • cellular response to wortmannin • GO:0007067 мітоз • клітинний цикл • GO:0100026 Репарація ДНК • диференціація клітин • Сплайсинг РНК • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


988


71702

Ensembl


ENSG00000096401


ENSMUSG00000023932

UniProt


Q99459


Q6A068

RefSeq (мРНК)


NM_001253


NM_152810

RefSeq (білок)


NP_001244


NP_690023

Локус (UCSC)

Хр. 6: 44.39 – 44.45 Mb

Хр. 17: 45.7 – 45.74 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDC5L (англ. Cell division cycle 5 like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 802 амінокислот, а молекулярна маса — 92 251^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPRIMIKGGV	WRNTEDEILK	AAVMKYGKNQ	WSRIASLLHR	KSAKQCKARW
YEWLDPSIKK	TEWSREEEEK	LLHLAKLMPT	QWRTIAPIIG	RTAAQCLEHY
EFLLDKAAQR	DNEEETTDDP	RKLKPGEIDP	NPETKPARPD	PIDMDEDELE
MLSEARARLA	NTQGKKAKRK	AREKQLEEAR	RLAALQKRRE	LRAAGIEIQK
KRKRKRGVDY	NAEIPFEKKP	ALGFYDTSEE	NYQALDADFR	KLRQQDLDGE
LRSEKEGRDR	KKDKQHLKRK	KESDLPSAIL	QTSGVSEFTK	KRSKLVLPAP
QISDAELQEV	VKVGQASEIA	RQTAEESGIT	NSASSTLLSE	YNVTNNSVAL
RTPRTPASQD	RILQEAQNLM	ALTNVDTPLK	GGLNTPLHES	DFSGVTPQRQ
VVQTPNTVLS	TPFRTPSNGA	EGLTPRSGTT	PKPVINSTPG	RTPLRDKLNI
NPEDGMADYS	DPSYVKQMER	ESREHLRLGL	LGLPAPKNDF	EIVLPENAEK
ELEEREIDDT	YIEDAADVDA	RKQAIRDAER	VKEMKRMHKA	VQKDLPRPSE
VNETILRPLN	VEPPLTDLQK	SEELIKKEMI	TMLHYDLLHH	PYEPSGNKKG
KTVGFGTNNS	EHITYLEHNP	YEKFSKEELK	KAQDVLVQEM	EVVKQGMSHG
ELSSEAYNQV	WEECYSQVLY	LPGQSRYTRA	NLASKKDRIE	SLEKRLEINR
GHMTTEAKRA	AKMEKKMKIL	LGGYQSRAMG	LMKQLNDLWD	QIEQAHLELR
TFEELKKHED	SAIPRRLECL	KEDVQRQQER	EKELQHRYAD	LLLEKETLKS
KF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Bernstein H.S., Coughlin S.R. (1997). Pombe Cdc5-related protein. A putative human transcription factor implicated in mitogen-activated signaling. J. Biol. Chem. 272: 5833—5837. PMID 9038199 DOI:10.1074/jbc.272.9.5833
Groenen P.M.A., Vanderlinden G., Devriendt K., Fryns J.-P., Van de Ven W.J.M. (1998). Rearrangement of the human CDC5L gene by a t(6;19)(p21;q13.1) in a patient with multicystic renal dysplasia. Genomics. 49: 218—229. PMID 9598309 DOI:10.1006/geno.1998.5254
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hirayama T., Shinozaki K. (1996). A cdc5+ homolog of a higher plant, Arabidopsis thaliana. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 13371—13376. PMID 8917598 DOI:10.1073/pnas.93.23.13371
Bernstein H.S., Coughlin S.R. (1998). A mammalian homolog of fission yeast Cdc5 regulates G2 progression and mitotic entry. J. Biol. Chem. 273: 4666—4671. PMID 9468527 DOI:10.1074/jbc.273.8.4666
Burns C.G., Ohi R., Krainer A.R., Gould K.L. (1999). Evidence that Myb-related CDC5 proteins are required for pre-mRNA splicing. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 13789—13794. PMID 10570151 DOI:10.1073/pnas.96.24.13789

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1743 (англ.) . Архів оригіналу за 16 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q99459 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.