CDH4

Ідентифікатори

Символи

CDH4, CAD4, R-CAD, RCAD, cadherin 4

Зовнішні ІД

OMIM: 603006 MGI: 99218 HomoloGene: 48044 GeneCards: CDH4

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана • cell surface • catenin complex
Біологічний процес	• heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • адгезія клітин • positive regulation of axon extension • adherens junction organization • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • axon guidance • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion • GO:0000767 cell morphogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1002


12561

Ensembl


ENSG00000280641 ENSG00000179242


ENSMUSG00000000305

UniProt


P55283


P39038

RefSeq (мРНК)


NM_001794 NM_001252338 NM_001252339


NM_009867 NM_001316723

RefSeq (білок)


NP_001239267 NP_001239268 NP_001785


NP_001303652 NP_033997

Локус (UCSC)

Хр. 20: 61.25 – 61.94 Mb

Хр. 2: 179.08 – 179.54 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDH4 (англ. Cadherin 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 916 амінокислот, а молекулярна маса — 100 281^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTAGAGVLLL	LLSLSGALRA	HNEDLTTRET	CKAGFSEDDY	TALISQNILE
GEKLLQVKFS	SCVGTKGTQY	ETNSMDFKVG	ADGTVFATRE	LQVPSEQVAF
TVTAWDSQTA	EKWDAVVRLL	VAQTSSPHSG	HKPQKGKKVV	ALDPSPPPKD
TLLPWPQHQN	ANGLRRRKRD	WVIPPINVPE	NSRGPFPQQL	VRIRSDKDND
IPIRYSITGV	GADQPPMEVF	SIDSMSGRMY	VTRPMDREEH	ASYHLRAHAV
DMNGNKVENP	IDLYIYVIDM	NDNRPEFINQ	VYNGSVDEGS	KPGTYVMTVT
ANDADDSTTA	NGMVRYRIVT	QTPQSPSQNM	FTINSETGDI	VTVAAGLDRE
KVQQYTVIVQ	ATDMEGNLNY	GLSNTATAII	TVTDVNDNPP	EFTASTFAGE
VPENRVETVV	ANLTVMDRDQ	PHSPNWNAVY	RIISGDPSGH	FSVRTDPVTN
EGMVTVVKAV	DYELNRAFML	TVMVSNQAPL	ASGIQMSFQS	TAGVTISIMD
INEAPYFPSN	HKLIRLEEGV	PPGTVLTTFS	AVDPDRFMQQ	AVRYSKLSDP
ASWLHINATN	GQITTAAVLD	RESLYTKNNV	YEATFLAADN	GIPPASGTGT
LQIYLIDIND	NAPELLPKEA	QICEKPNLNA	INITAADADV	DPNIGPYVFE
LPFVPAAVRK	NWTITRLNGD	YAQLSLRILY	LEAGMYDVPI	IVTDSGNPPL
SNTSIIKVKV	CPCDDNGDCT	TIGAVAAAGL	GTGAIVAILI	CILILLTMVL
LFVMWMKRRE	KERHTKQLLI	DPEDDVRDNI	LKYDEEGGGE	EDQDYDLSQL
QQPEAMGHVP	SKAPGVRRVD	ERPVGAEPQY	PIRPMVPHPG	DIGDFINEGL
RAADNDPTAP	PYDSLLVFDY	EGSGSTAGSV	SSLNSSSSGD	QDYDYLNDWG
PRFKKLADMY	GGGEED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tanihara H., Sano K., Heimark R.L., St John T., Suzuki S. (1994). Cloning of five human cadherins clarifies characteristic features of cadherin extracellular domain and provides further evidence for two structurally different types of cadherin. Cell Adhes. Commun. 2: 15—26. PMID 7982033
Suzuki S., Sano K., Tanihara H. (1991). Diversity of the cadherin family: evidence for eight new cadherins in nervous tissue. Cell Regul. 2: 261—270. PMID 2059658

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CDH4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1763 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P55283 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.