CHTF18

Ідентифікатори

Символи

CHTF18, C16orf41, C321D2.2, C321D2.3, C321D2.4, CHL12, Ctf18, RUVBL, chromosome transmission fidelity factor 18

Зовнішні ІД

OMIM: 613201 MGI: 2384887 HomoloGene: 32532 GeneCards: CHTF18

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • DNA binding • GO:0043142 single-stranded DNA helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • DNA clamp loader activity
Клітинна компонента	• мембрана • Ctf18 RFC-like complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• реплікація ДНК • клітинний цикл • positive regulation of DNA-directed DNA polymerase activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


63922


214901

Ensembl


ENSG00000127586


ENSMUSG00000019214

UniProt


Q8WVB6


Q8BIW9

RefSeq (мРНК)


NM_022092


NM_145409

RefSeq (білок)


NP_071375


NP_663384

Локус (UCSC)

Хр. 16: 0.79 – 0.8 Mb

Хр. 17: 25.94 – 25.95 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CHTF18 (англ. Chromosome transmission fidelity factor 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 975 амінокислот, а молекулярна маса — 107 383^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEDYEQELCG	VEDDFHNQFA	AELEVLAELE	GASTPSPSGV	PLFTAGRPPR
TFEEALARGD	AASSPAPAAS	VGSSQGGARK	RQVDADLQPA	GSLPHAPRIK
RPRLQVVKRL	NFRSEEMEEP	PPPDSSPTDI	TPPPSPEDLA	ELWGHGVSEA
AADVGLTRAS	PAARNPVLRR	PPILEDYVHV	TSTEGVRAYL	VLRADPMAPG
VQGSLLHVPW	RGGGQLDLLG	VSLASLKKQV	DGERRERLLQ	EAQKLSDTLH
SLRSGEEEAA	QPLGAPEEEP	TDGQDASSHC	LWVDEFAPRH	YTELLSDDFT
NRCLLKWLKL	WDLVVFGHER	PSRKPRPSVE	PARVSKEATA	PGKWKSHEQV
LEEMLEAGLD	PSQRPKQKVA	LLCGPPGLGK	TTLAHVIARH	AGYSVVEMNA
SDDRSPEVFR	TRIEAATQME	SVLGAGGKPN	CLVIDEIDGA	PVAAINVLLS
ILNRKGPQEV	GPQGPAVPSG	GGRRRRAEGG	LLMRPIICIC	NDQFAPSLRQ
LKQQAFLLHF	PPTLPSRLVQ	RLQEVSLRQG	MRADPGVLAA	LCEKTDNDIR
ACINTLQFLY	SRGQRELSVR	DVQATRVGLK	DQRRGLFSVW	QEVFQLPRAQ
RRRVGQDPAL	PADTLLLGDG	DAGSLTSASQ	RFYRVLHAAA	SAGEHEKVVQ
GLFDNFLRLR	LRDSSLGAVC	VALDWLAFDD	LLAGAAHHSQ	SFQLLRYPPF
LPVAFHVLFA	SSHTPRITFP	SSQQEAQNRM	SQMRNLIQTL	VSGIAPATRS
RATPQALLLD	ALCLLLDILA	PKLRPVSTQL	YSTREKQQLA	SLVGTMLAYS
LTYRQERTPD	GQYIYRLEPN	VEELCRFPEL	PARKPLTYQT	KQLIAREIEV
EKMRRAEASA	RVENSPQVDG	SPPGLEGLLG	GIGEKGVHRP	APRNHEQRLE
HIMRRAAREE	QPEKDFFGRV	VVRSTAVPSA	GDTAPEQDSV	ERRMGTAVGR
SEVWFRFNEG	VSNAVRRSLY	IRDLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Merkle C.J., Karnitz L.M., Henry-Sanchez J.T., Chen J. (2003). Cloning and characterization of hCTF18, hCTF8, and hDCC1. Human homologs of a Saccharomyces cerevisiae complex involved in sister chromatid cohesion establishment. J. Biol. Chem. 278: 30051—30056. PMID 12766176 DOI:10.1074/jbc.M211591200
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Shiomi Y., Masutani C., Hanaoka F., Kimura H., Tsurimoto T. (2007). A second proliferating cell nuclear antigen loader complex, Ctf18-replication factor C, stimulates DNA polymerase eta activity. J. Biol. Chem. 282: 20906—20914. PMID 17545166 DOI:10.1074/jbc.M610102200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18435 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8WVB6 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.