CNOT10 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CNOT10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10 |
---|
Зовнішні ІД | MGI: 1926143 HomoloGene: 41040 GeneCards: CNOT10 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • CCR4-NOT complex • гіалоплазма • мембрана • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • Сайленсинг генів • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of translation • transcription, DNA-templated • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • mRNA catabolic process • negative regulation of translation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001256741 NM_001256742 NM_015442 NM_001393366 NM_001393367
| NM_001393368 NM_001393369 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001243670 NP_001243671 NP_056257 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 32.69 – 32.77 Mb | Хр. 9: 114.59 – 114.64 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CNOT10 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 744 амінокислот, а молекулярна маса — 82 310[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAADKPADQG | | AEKHEGTGQS | | SGITDQEKEL | | STNAFQAFTS | | GNYDACLQHL |
ACLQDINKDD | | YKIILNTAVA | | EFFKSNQTTT | | DNLRQTLNQL | | KNQVHSAVEE |
MDGLDDVENS | | MLYYNQAVIL | | YHLRQYTEAI | | SVGEKLYQFI | | EPFEEKFAQA |
VCFLLVDLYI | | LTYQAEKALH | | LLAVLEKMIS | | QGNNNKNGKN | | ETGNNNNKDG |
SNHKAESGAL | | IEAAKSKIHQ | | YKVRAYIQMK | | SLKACKREIK | | SVMNTAGNSA |
PSLFLKSNFE | | YLRGNYRKAV | | KLLNSSNIAE | | HPGFMKTGEC | | LRCMFWNNLG |
CIHFAMSKHN | | LGIFYFKKAL | | QENDNVCAQL | | SAGSTDPGKK | | FSGRPMCTLL |
TNKRYELLYN | | CGIQLLHIGR | | PLAAFECLIE | | AVQVYHANPR | | LWLRLAECCI |
AANKGTSEQE | | TKGLPSKKGI | | VQSIVGQGYH | | RKIVLASQSI | | QNTVYNDGQS |
SAIPVASMEF | | AAICLRNALL | | LLPEEQQDPK | | QENGAKNSNQ | | LGGNTESSES |
SETCSSKSHD | | GDKFIPAPPS | | SPLRKQELEN | | LKCSILACSA | | YVALALGDNL |
MALNHADKLL | | QQPKLSGSLK | | FLGHLYAAEA | | LISLDRISDA | | ITHLNPENVT |
DVSLGISSNE | | QDQGSDKGEN | | EAMESSGKRA | | PQCYPSSVNS | | ARTVMLFNLG |
SAYCLRSEYD | | KARKCLHQAA | | SMIHPKEVPP | | EAILLAVYLE | | LQNGNTQLAL |
QIIKRNQLLP | | AVKTHSEVRK | | KPVFQPVHPI | | QPIQMPAFTT | | VQRK |
Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Mauxion F., Preve B., Seraphin B. (2013). C2ORF29/CNOT11 and CNOT10 form a new module of the CCR4-NOT complex. RNA Biol. 10: 267—276. PMID 23232451 DOI:10.4161/rna.23065
- Farber V., Erben E., Sharma S., Stoecklin G., Clayton C. (2013). Trypanosome CNOT10 is essential for the integrity of the NOT deadenylase complex and for degradation of many mRNAs. Nucleic Acids Res. 41: 1211—1222. PMID 23221646 DOI:10.1093/nar/gks1133
- Bawankar P., Loh B., Wohlbold L., Schmidt S., Izaurralde E. (2013). NOT10 and C2orf29/NOT11 form a conserved module of the CCR4-NOT complex that docks onto the NOT1 N-terminal domain. RNA Biol. 10: 228—244. PMID 23303381 DOI:10.4161/rna.23018
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23817 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9H9A5 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |