DDX58
DDX58 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | DDX58, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 58, RIGI, RLR-1, SGMRT2, RIG-I, DEXD/H-box helicase 58, RIG1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 609631 MGI: 2442858 HomoloGene: 32215 GeneCards: DDX58 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 9: 32.46 – 32.53 Mb | Хр. 4: 40.2 – 40.24 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
DDX58 (англ. DExD/H-box helicase 58) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 925 амінокислот, а молекулярна маса — 106 600[4].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MTTEQRRSLQ | AFQDYIRKTL | DPTYILSYMA | PWFREEEVQY | IQAEKNNKGP | ||||
MEAATLFLKF | LLELQEEGWF | RGFLDALDHA | GYSGLYEAIE | SWDFKKIEKL | ||||
EEYRLLLKRL | QPEFKTRIIP | TDIISDLSEC | LINQECEEIL | QICSTKGMMA | ||||
GAEKLVECLL | RSDKENWPKT | LKLALEKERN | KFSELWIVEK | GIKDVETEDL | ||||
EDKMETSDIQ | IFYQEDPECQ | NLSENSCPPS | EVSDTNLYSP | FKPRNYQLEL | ||||
ALPAMKGKNT | IICAPTGCGK | TFVSLLICEH | HLKKFPQGQK | GKVVFFANQI | ||||
PVYEQQKSVF | SKYFERHGYR | VTGISGATAE | NVPVEQIVEN | NDIIILTPQI | ||||
LVNNLKKGTI | PSLSIFTLMI | FDECHNTSKQ | HPYNMIMFNY | LDQKLGGSSG | ||||
PLPQVIGLTA | SVGVGDAKNT | DEALDYICKL | CASLDASVIA | TVKHNLEELE | ||||
QVVYKPQKFF | RKVESRISDK | FKYIIAQLMR | DTESLAKRIC | KDLENLSQIQ | ||||
NREFGTQKYE | QWIVTVQKAC | MVFQMPDKDE | ESRICKALFL | YTSHLRKYND | ||||
ALIISEHARM | KDALDYLKDF | FSNVRAAGFD | EIEQDLTQRF | EEKLQELESV | ||||
SRDPSNENPK | LEDLCFILQE | EYHLNPETIT | ILFVKTRALV | DALKNWIEGN | ||||
PKLSFLKPGI | LTGRGKTNQN | TGMTLPAQKC | ILDAFKASGD | HNILIATSVA | ||||
DEGIDIAQCN | LVILYEYVGN | VIKMIQTRGR | GRARGSKCFL | LTSNAGVIEK | ||||
EQINMYKEKM | MNDSILRLQT | WDEAVFREKI | LHIQTHEKFI | RDSQEKPKPV | ||||
PDKENKKLLC | RKCKALACYT | ADVRVIEECH | YTVLGDAFKE | CFVSRPHPKP | ||||
KQFSSFEKRA | KIFCARQNCS | HDWGIHVKYK | TFEIPVIKIE | SFVVEDIATG | ||||
VQTLYSKWKD | FHFEKIPFDP | AEMSK |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, противірусний захист, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, щільних контактах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Cui X.-F., Imaizumi T., Yoshida H., Borden E.C., Satoh K. (2004). Retinoic acid-inducible gene-I is induced by interferon-gamma and regulates the expression of interferon-gamma stimulated gene 15 in MCF-7 cells. Biochem. Cell Biol. 82: 401—405. PMID 15181474 DOI:10.1139/o04-041
- Seth R.B., Sun L., Ea C.-K., Chen Z.J. (2005). Identification and characterization of MAVS, a mitochondrial antiviral signaling protein that activates NF-kappaB and IRF 3. Cell. 122: 669—682. PMID 16125763 DOI:10.1016/j.cell.2005.08.012
- Zhao C., Denison C., Huibregtse J.M., Gygi S.P., Krug R.M. (2005). Human ISG15 conjugation targets both IFN-induced and constitutively expressed proteins functioning in diverse cellular pathways. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 10200—10205. PMID 16009940 DOI:10.1073/pnas.0504754102
- Kim M.J., Hwang S.Y., Imaizumi T., Yoo J.Y. (2008). Negative feedback regulation of RIG-I-mediated antiviral signaling by interferon-induced ISG15 conjugation. J. Virol. 82: 1474—1483. PMID 18057259 DOI:10.1128/JVI.01650-07
- Ishikawa H., Barber G.N. (2008). STING is an endoplasmic reticulum adaptor that facilitates innate immune signalling. Nature. 455: 674—678. PMID 18724357 DOI:10.1038/nature07317
Примітки
Див. також
- Хромосома 9
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |