DHX29 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | DHX29, DDX29, DEAH-box helicase 29, DExH-box helicase 29 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 612720 HomoloGene: 10387 GeneCards: DHX29 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • translation initiation factor activity • ATP binding • hydrolase activity • nucleotide binding • nucleic acid binding • GO:0008026 helicase activity • ribosomal small subunit binding • cadherin binding • RNA binding • RNA helicase activity • GO:0102490, GO:0102491, GO:0102489, GO:0102488, GO:0102487, GO:0102486, GO:0102485 hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides • GO:0034459 3'-5' RNA helicase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • eukaryotic 43S preinitiation complex • мітохондрія |
---|
Біологічний процес | • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • translational initiation • Біосинтез білків • positive regulation of translational initiation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_019030 NM_001345964 NM_001345965 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001332893 NP_001332894 NP_061903 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 55.26 – 55.31 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DHX29 (англ. DExH-box helicase 29) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 369 амінокислот, а молекулярна маса — 155 236[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGGKNKKHKA | | PAAAVVRAAV | | SASRAKSAEA | | GIAGEAQSKK | | PVSRPATAAA |
AAAGSREPRV | | KQGPKIYSFN | | STNDSSGPAN | | LDKSILKVVI | | NNKLEQRIIG |
VINEHKKQNN | | DKGMISGRLT | | AKKLQDLYMA | | LQAFSFKTKD | | IEDAMTNTLL |
YGGDLHSALD | | WLCLNLSDDA | | LPEGFSQEFE | | EQQPKSRPKF | | QSPQIQATIS |
PPLQPKTKTY | | EEDPKSKPKK | | EEKNMEVNMK | | EWILRYAEQQ | | NEEEKNENSK |
SLEEEEKFDP | | NERYLHLAAK | | LLDAKEQAAT | | FKLEKNKQGQ | | KEAQEKIRKF |
QREMETLEDH | | PVFNPAMKIS | | HQQNERKKPP | | VATEGESALN | | FNLFEKSAAA |
TEEEKDKKKE | | PHDVRNFDYT | | ARSWTGKSPK | | QFLIDWVRKN | | LPKSPNPSFE |
KVPVGRYWKC | | RVRVIKSEDD | | VLVVCPTILT | | EDGMQAQHLG | | ATLALYRLVK |
GQSVHQLLPP | | TYRDVWLEWS | | DAEKKREELN | | KMETNKPRDL | | FIAKLLNKLK |
QQQQQQQQHS | | ENKRENSEDP | | EESWENLVSD | | EDFSALSLES | | ANVEDLEPVR |
NLFRKLQSTP | | KYQKLLKERQ | | QLPVFKHRDS | | IVETLKRHRV | | VVVAGETGSG |
KSTQVPHFLL | | EDLLLNEWEA | | SKCNIVCTQP | | RRISAVSLAN | | RVCDELGCEN |
GPGGRNSLCG | | YQIRMESRAC | | ESTRLLYCTT | | GVLLRKLQED | | GLLSNVSHVI |
VDEVHERSVQ | | SDFLLIILKE | | ILQKRSDLHL | | ILMSATVDSE | | KFSTYFTHCP |
ILRISGRSYP | | VEVFHLEDII | | EETGFVLEKD | | SEYCQKFLEE | | EEEVTINVTS |
KAGGIKKYQE | | YIPVQTGAHA | | DLNPFYQKYS | | SRTQHAILYM | | NPHKINLDLI |
LELLAYLDKS | | PQFRNIEGAV | | LIFLPGLAHI | | QQLYDLLSND | | RRFYSERYKV |
IALHSILSTQ | | DQAAAFTLPP | | PGVRKIVLAT | | NIAETGITIP | | DVVFVIDTGR |
TKENKYHESS | | QMSSLVETFV | | SKASALQRQG | | RAGRVRDGFC | | FRMYTRERFE |
GFMDYSVPEI | | LRVPLEELCL | | HIMKCNLGSP | | EDFLSKALDP | | PQLQVISNAM |
NLLRKIGACE | | LNEPKLTPLG | | QHLAALPVNV | | KIGKMLIFGA | | IFGCLDPVAT |
LAAVMTEKSP | | FTTPIGRKDE | | ADLAKSALAM | | ADSDHLTIYN | | AYLGWKKARQ |
EGGYRSEITY | | CRRNFLNRTS | | LLTLEDVKQE | | LIKLVKAAGF | | SSSTTSTSWE |
GNRASQTLSF | | QEIALLKAVL | | VAGLYDNVGK | | IIYTKSVDVT | | EKLACIVETA |
QGKAQVHPSS | | VNRDLQTHGW | | LLYQEKIRYA | | RVYLRETTLI | | TPFPVLLFGG |
DIEVQHRERL | | LSIDGWIYFQ | | APVKIAVIFK | | QLRVLIDSVL | | RKKLENPKMS |
LENDKILQII | | TELIKTENN |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, факторів ініціації, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як біосинтез білків. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Pisareva V.P., Pisarev A.V., Komar A.A., Hellen C.U.T., Pestova T.V. (2008). Translation initiation on mammalian mRNAs with structured 5'UTRs requires DExH-box protein DHX29. Cell. 135: 1237—1250. PMID 19109895 DOI:10.1016/j.cell.2008.10.037
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15815 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 18 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q7Z478 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2016. Процитовано 18 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |