HDGF

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1RI0, 2NLU

Ідентифікатори

Символи

HDGF, HMG1L2, hepatoma-derived growth factor, heparin binding growth factor

Зовнішні ІД

OMIM: 600339 MGI: 1194494 HomoloGene: 3306 GeneCards: HDGF

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • DNA binding • transcription corepressor binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • growth factor activity • heparin binding • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • transcription repressor complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• IRE1-mediated unfolded protein response • проліферація • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0006928 клітинний процес • regulation of signaling receptor activity • cellular response to interleukin-7
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3068


15191

Ensembl


ENSG00000143321


ENSMUSG00000004897

UniProt


P51858


P51859

RefSeq (мРНК)

NM_001126050 NM_001126051 NM_004494 NM_001319186 NM_001319187
NM_001319188


NM_008231 NM_001331051 NM_001331052

RefSeq (білок)

NP_001119522 NP_001119523 NP_001306115 NP_001306116 NP_001306117
NP_004485


NP_001317980 NP_001317981 NP_032257

Локус (UCSC)

Хр. 1: 156.74 – 156.77 Mb

Хр. 3: 87.81 – 87.82 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HDGF (англ. Heparin binding growth factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 240 амінокислот, а молекулярна маса — 26 788^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSRSNRQKEY	KCGDLVFAKM	KGYPHWPARI	DEMPEAAVKS	TANKYQVFFF
GTHETAFLGP	KDLFPYEESK	EKFGKPNKRK	GFSEGLWEIE	NNPTVKASGY
QSSQKKSCVE	EPEPEPEAAE	GDGDKKGNAE	GSSDEEGKLV	IDEPAKEKNE
KGALKRRAGD	LLEDSPKRPK	EAENPEGEEK	EAATLEVERP	LPMEVEKNST
PSEPGSGRGP	PQEEEEEEDE	EEEATKEDAE	APGIRDHESL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, факторів росту, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ДНК, з молекулою гепарину. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Beranova-Giorgianni S., Zhao Y., Desiderio D.M., Giorgianni F. (2006). Phosphoproteomic analysis of the human pituitary. Pituitary. 9: 109—120. PMID 16807684 DOI:10.1007/s11102-006-8916-x
Yang J., Everett A.D. (2007). Hepatoma-derived growth factor binds DNA through the N-terminal PWWP domain. BMC Mol. Biol. 8: 101—101. PMID 17974029 DOI:10.1186/1471-2199-8-101
Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4856 (англ.) . Архів оригіналу за 29 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P51858 (англ.) . Архів оригіналу за 7 травня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.