IRF2BPL

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2CS3

Ідентифікатори

Символи

IRF2BPL, C14orf4, EAP1, interferon regulatory factor 2 binding protein like, enhanced at puberty protein 1, NEDAMSS

Зовнішні ІД

OMIM: 611720 MGI: 2442463 HomoloGene: 11555 GeneCards: IRF2BPL

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • міжклітинний простір • ubiquitin ligase complex
Біологічний процес	• GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • development of secondary female sexual characteristics • нейробіологія розвитку • Убіквітин-залежний протеоліз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


64207


238330

Ensembl


ENSG00000119669


ENSMUSG00000034168

UniProt


Q9H1B7


Q8K3X4

RefSeq (мРНК)


NM_024496


NM_145836

RefSeq (білок)


NP_078772


NP_665835

Локус (UCSC)

Хр. 14: 77.02 – 77.03 Mb

Хр. 12: 86.93 – 86.93 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

IRF2BPL (англ. Interferon regulatory factor 2 binding protein like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 796 амінокислот, а молекулярна маса — 82 659^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSAAQVSSSR	RQSCYLCDLP	RMPWAMIWDF	SEPVCRGCVN	YEGADRIEFV
IETARQLKRA	HGCFQDGRSP	GPPPPVGVKT	VALSAKEAAA	AAAAAAAAAA
AAQQQQQQQQ	QQQQQQQQQQ	QQQQQQQLNH	VDGSSKPAVL	AAPSGLERYG
LSAAAAAAAA	AAAAVEQRSR	FEYPPPPVSL	GSSSHTARLP	NGLGGPNGFP
KPTPEEGPPE	LNRQSPNSSS	AAASVASRRG	THGGLVTGLP	NPGGGGGPQL
TVPPNLLPQT	LLNGPASAAV	LPPPPPHALG	SRGPPTPAPP	GAPGGPACLG
GTPGVSATSS	SASSSTSSSV	AEVGVGAGGK	RPGSVSSTDQ	ERELKEKQRN
AEALAELSES	LRNRAEEWAS	KPKMVRDTLL	TLAGCTPYEV	RFKKDHSLLG
RVFAFDAVSK	PGMDYELKLF	IEYPTGSGNV	YSSASGVAKQ	MYQDCMKDFG
RGLSSGFKYL	EYEKKHGSGD	WRLLGDLLPE	AVRFFKEGVP	GADMLPQPYL
DASCPMLPTA	LVSLSRAPSA	PPGTGALPPA	APSGRGAAAS	LRKRKASPEP
PDSAEGALKL	GEEQQRQQWM	ANQSEALKLT	MSAGGFAAPG	HAAGGPPPPP
PPLGPHSNRT	TPPESAPQNG	PSPMAALMSV	ADTLGTAHSP	KDGSSVHSTT
ASARRNSSSP	VSPASVPGQR	RLASRNGDLN	LQVAPPPPSA	HPGMDQVHPQ
NIPDSPMANS	GPLCCTICHE	RLEDTHFVQC	PSVPSHKFCF	PCSRESIKAQ
GATGEVYCPS	GEKCPLVGSN	VPWAFMQGEI	ATILAGDVKV	KKERDP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Scior T., Luna F., Koch W., Sanchez-Ruiz J.F. (2007). In silico analysis identifies a C3HC4-RING finger domain of a putative E3 ubiquitin-protein ligase located at the C-terminus of a polyglutamine-containing protein. Braz. J. Med. Biol. Res. 40: 293—299. PMID 17334524 DOI:10.1590/S0100-879X2007000300002

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14282 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H1B7 (англ.) . Архів оригіналу за 3 лютого 2017. Процитовано 11 вересня 2017.