Ku70

XRCC6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1JEQ, 1JEY, 1JJR, 3RZX

Ідентифікатори

Символи

XRCC6, X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6, CTC75, CTCBF, G22P1, KU70, ML8, TLAA, X-ray repair cross complementing 6

Зовнішні ІД

OMIM: 152690 MGI: 95606 HomoloGene: 37483 GeneCards: XRCC6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • double-stranded telomeric DNA binding • telomeric DNA binding • GO:0008026 helicase activity • 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity • GO:0004003 DNA helicase activity • protein C-terminus binding • каталітична активність • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lyase activity • hydrolase activity • ATP binding • DNA binding • double-stranded DNA binding • damaged DNA binding • RNA binding • cyclin binding • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • nuclear telomere cap complex • мембрана • transcription regulator complex • хромосома • нуклеоплазма • nonhomologous end joining complex • клітинне ядро • Ku70:Ku80 complex • цитоплазма • extracellular region • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • protein-DNA complex • ядерце • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• double-strand break repair via classical nonhomologous end joining • protein heterotetramerization • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of smooth muscle cell proliferation • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • DNA ligation • establishment of integrated proviral latency • обмін речовин • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • double-strand break repair via nonhomologous end joining • telomere maintenance • positive regulation of type I interferon production • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • DNA duplex unwinding • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular hyperosmotic salinity response • brain development • DNA recombination • neutrophil degranulation • cellular response to gamma radiation • cellular response to X-ray • positive regulation of protein kinase activity • activation of innate immune response • процес імунної системи • вроджений імунітет
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2547


14375

Ensembl


ENSG00000196419


ENSMUSG00000022471

UniProt


P12956


P23475

RefSeq (мРНК)


NM_001469 NM_001288976 NM_001288977 NM_001288978


NM_010247

RefSeq (білок)

NP_001275905 NP_001275906 NP_001275907 NP_001460 NP_001275905.1
NP_001460.1


NP_034377

Локус (UCSC)

Хр. 22: 41.62 – 41.66 Mb

Хр. 15: 81.87 – 81.92 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

Ku70 (англ. X-ray repair cross complementing 6) – білок, який кодується геном XRCC6, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 609 амінокислот, а молекулярна маса — 69 843^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGWESYYKT	EGDEEAEEEQ	EENLEASGDY	KYSGRDSLIF	LVDASKAMFE
SQSEDELTPF	DMSIQCIQSV	YISKIISSDR	DLLAVVFYGT	EKDKNSVNFK
NIYVLQELDN	PGAKRILELD	QFKGQQGQKR	FQDMMGHGSD	YSLSEVLWVC
ANLFSDVQFK	MSHKRIMLFT	NEDNPHGNDS	AKASRARTKA	GDLRDTGIFL
DLMHLKKPGG	FDISLFYRDI	ISIAEDEDLR	VHFEESSKLE	DLLRKVRAKE
TRKRALSRLK	LKLNKDIVIS	VGIYNLVQKA	LKPPPIKLYR	ETNEPVKTKT
RTFNTSTGGL	LLPSDTKRSQ	IYGSRQIILE	KEETEELKRF	DDPGLMLMGF
KPLVLLKKHH	YLRPSLFVYP	EESLVIGSST	LFSALLIKCL	EKEVAALCRY
TPRRNIPPYF	VALVPQEEEL	DDQKIQVTPP	GFQLVFLPFA	DDKRKMPFTE
KIMATPEQVG	KMKAIVEKLR	FTYRSDSFEN	PVLQQHFRNL	EALALDLMEP
EQAVDLTLPK	VEAMNKRLGS	LVDEFKELVY	PPDYNPEGKV	TKRKHDNEGS
GSKRPKVEYS	EEELKTHISK	GTLGKFTVPM	LKEACRAYGL	KSGLKKQELL
EALTKHFQD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, гідролаз, активаторів, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Griffith A.J., Craft J., Evans J., Mimori T., Hardin J.A. (1992). Nucleotide sequence and genomic structure analyses of the p70 subunit of the human Ku autoantigen: evidence for a family of genes encoding Ku (p70)-related polypeptides. Mol. Biol. Rep. 16: 91—97. PMID 1608402 DOI:10.1007/BF00419754
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Oderwald H., Hughes M.J., Jost J.-P. (1996). Non-histone protein 1 (NHP1) is a member of the Ku protein family which is upregulated in differentiating mouse myoblasts and human promyelocytes. FEBS Lett. 382: 313—318. PMID 8605992 DOI:10.1016/0014-5793(96)00189-5
Jin S., Weaver D.T. (1997). Double-strand break repair by Ku70 requires heterodimerization with Ku80 and DNA binding functions. EMBO J. 16: 6874—6885. PMID 9362500 DOI:10.1093/emboj/16.22.6874
West R.B., Yaneva M., Lieber M.R. (1998). Productive and nonproductive complexes of Ku and DNA-dependent protein kinase at DNA termini. Mol. Cell. Biol. 18: 5908—5920. PMID 9742108 DOI:10.1128/MCB.18.10.5908
Chan D.W., Ye R., Veillette C.J., Lees-Miller S.P. (1999). DNA-dependent protein kinase phosphorylation sites in Ku 70/80 heterodimer. Biochemistry. 38: 1819—1828. PMID 10026262 DOI:10.1021/bi982584b

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4055 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2018. Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, P12956 (англ.) . Архів оригіналу за 10 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.