LGMN

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4N6N, 4N6O, 4FGU, 4AWB, 4AWA, 4AW9

Ідентифікатори

Символи

LGMN, AEP, LGMN1, PRSC1, legumain

Зовнішні ІД

OMIM: 602620 MGI: 1330838 HomoloGene: 38075 GeneCards: LGMN

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cysteine-type peptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • cysteine-type endopeptidase activity • tau protein binding
Клітинна компонента	• late endosome • apical part of cell • lysosomal lumen • лізосома • екзосома • endolysosome lumen • extracellular region • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm
Біологічний процес	• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • negative regulation of ERBB signaling pathway • renal system process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • vitamin D metabolic process • negative regulation of multicellular organism growth • vacuolar protein processing • receptor catabolic process • протеоліз • toll-like receptor signaling pathway • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • response to acidic pH • пам'ять • positive regulation of cell population proliferation • associative learning • negative regulation of gene expression • cellular response to hepatocyte growth factor stimulus • positive regulation of mitotic cell cycle • cellular response to calcium ion • positive regulation of monocyte chemotaxis • dendritic spine organization • activation of cysteine-type endopeptidase activity • self proteolysis • positive regulation of long-term synaptic potentiation • cellular response to amyloid-beta • positive regulation of endothelial cell chemotaxis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5641


19141

Ensembl


ENSG00000100600


ENSMUSG00000021190

UniProt


Q99538


O89017

RefSeq (мРНК)


NM_001008530 NM_005606 NM_001363696 NM_001363699


NM_011175 NM_001378875

RefSeq (білок)


NP_001008530 NP_005597 NP_001350625 NP_001350628


NP_035305 NP_001365804

Локус (UCSC)

Хр. 14: 92.7 – 92.75 Mb

Хр. 12: 102.36 – 102.41 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LGMN (англ. Legumain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 433 амінокислот, а молекулярна маса — 49 411^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVWKVAVFLS	VALGIGAVPI	DDPEDGGKHW	VVIVAGSNGW	YNYRHQADAC
HAYQIIHRNG	IPDEQIVVMM	YDDIAYSEDN	PTPGIVINRP	NGTDVYQGVP
KDYTGEDVTP	QNFLAVLRGD	AEAVKGIGSG	KVLKSGPQDH	VFIYFTDHGS
TGILVFPNED	LHVKDLNETI	HYMYKHKMYR	KMVFYIEACE	SGSMMNHLPD
NINVYATTAA	NPRESSYACY	YDEKRSTYLG	DWYSVNWMED	SDVEDLTKET
LHKQYHLVKS	HTNTSHVMQY	GNKTISTMKV	MQFQGMKRKA	SSPVPLPPVT
HLDLTPSPDV	PLTIMKRKLM	NTNDLEESRQ	LTEEIQRHLD	ARHLIEKSVR
KIVSLLAASE	AEVEQLLSER	APLTGHSCYP	EALLHFRTHC	FNWHSPTYEY
ALRHLYVLVN	LCEKPYPLHR	IKLSMDHVCL	GHY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у лізосомі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chen J.-M., Fortunato M., Barrett A.J. (2000). Activation of human prolegumain by cleavage at a C-terminal asparagine residue. Biochem. J. 352: 327—334. PMID 11085925 DOI:10.1042/bj3520327
Halfon S., Patel S., Vega F., Zurawski S., Zurawski G. (1998). Autocatalytic activation of human legumain at aspartic acid residues. FEBS Lett. 438: 114—118. PMID 9821970 DOI:10.1016/S0014-5793(98)01281-2
Dall E., Brandstetter H. (2013). Mechanistic and structural studies on legumain explain its zymogenicity, distinct activation pathways, and regulation. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 110: 10940—10945. PMID 23776206 DOI:10.1073/pnas.1300686110
Tanaka T., Inazawa J., Nakamura Y. (1996). Molecular cloning of a human cDNA encoding putative cysteine protease (PRSC1) and its chromosome assignment to 14q32.1. Cytogenet. Cell Genet. 74: 120—123. PMID 8893817

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9472 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q99538 (англ.) . Архів оригіналу за 28 лютого 2017. Процитовано 11 вересня 2017.