LRIF1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | LRIF1, C1orf103, RIF1, ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1, HBiX1, FSHD3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 615354 MGI: 2445214 HomoloGene: 10160 GeneCards: LRIF1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • retinoic acid receptor binding |
---|
Клітинна компонента | • nuclear matrix • клітинне ядро • центр організації мікротрубочок • Тільце Барра • хромосома |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • dosage compensation by inactivation of X chromosome |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b3/PBB_GE_C1orf103_220235_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_C1orf103_220235_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001039478 NM_001039488 NM_001286685 NM_028081 NM_177309 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001034567 NP_001034577 NP_001273614 NP_082357 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 110.95 – 110.96 Mb | Хр. 3: 106.59 – 106.64 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LRIF1 (англ. Ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 769 амінокислот, а молекулярна маса — 84 568[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSNNLRRVFL | | KPAEENSGNA | | SRCVSGCMYQ | | VVQTIGSDGK | | NLLQLLPIPK |
SSGNLIPLVQ | | SSVMSDALKG | | NTGKPVQVTF | | QTQISSSSTS | | ASVQLPIFQP |
ASSSNYFLTR | | TVDTSEKGRV | | TSVGTGNFSS | | SVSKVQSHGV | | KIDGLTMQTF |
AVPPSTQKDS | | SFIVVNTQSL | | PVTVKSPVLP | | SGHHLQIPAH | | AEVKSVPASS |
LPPSVQQKIL | | ATATTSTSGM | | VEASQMPTVI | | YVSPVNTVKN | | VVTKNFQNIY |
PKPVTEIAKP | | VILNTTQIPK | | NVATETQLKG | | GQHSQAAPVK | | WIFQDNLQPF |
TPSLVPVKSS | | NNVASKILKT | | FVDRKNLGDN | | TINMPPLSTI | | DPSGTRSKNM |
PIKDNALVMF | | NGKVYLLAKK | | GTDVLPSQID | | QQNSVSPDTP | | VRKDTLQTVS |
SSPVTEISRE | | VVNIVLAKSK | | SSQMETKSLS | | NTQLASMANL | | RAEKNKVEKP |
SPSTTNPHMN | | QSSNYLKQSK | | TLFTNPIFPV | | GFSTGHNAPR | | KVTAVIYARK |
GSVLQSIEKI | | SSSVDATTVT | | SQQCVFRDQE | | PKIHNEMAST | | SDKGAQGRND |
KKDSQGRSNK | | ALHLKSDAEF | | KKIFGLTKDL | | RVCLTRIPDH | | LTSGEGFDSF |
SSLVKSGTYK | | ETEFMVKEGE | | RKQQNFDKKR | | KAKTNKKMDH | | IKKRKTENAY |
NAIINGEANV | | TGSQLLSSIL | | PTSDVSQHNI | | LTSHSKTRQE | | KRTEMEYYTH |
EKQEKGTLNS | | NAAYEQSHFF | | NKNYTEDIFP | | VTPPELEETI | | RDEKIRRLKQ |
VLREKEAALE | | EMRKKMHQK |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- Li H.J., Haque Z.K., Chen A., Mendelsohn M. (2007). RIF-1, a novel nuclear receptor corepressor that associates with the nuclear matrix. J. Cell. Biochem. 102: 1021—1035. PMID 17455211 DOI:10.1002/jcb.21340
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30299 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q5T3J3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |