LRIF1

Ідентифікатори

Символи

LRIF1, C1orf103, RIF1, ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1, HBiX1, FSHD3

Зовнішні ІД

OMIM: 615354 MGI: 2445214 HomoloGene: 10160 GeneCards: LRIF1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • retinoic acid receptor binding
Клітинна компонента	• nuclear matrix • клітинне ядро • центр організації мікротрубочок • Тільце Барра • хромосома
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • dosage compensation by inactivation of X chromosome
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55791


321000

Ensembl


ENSG00000121931


ENSMUSG00000056260

UniProt


Q5T3J3


Q8CDD9

RefSeq (мРНК)


NM_001006945 NM_018372


NM_001039478 NM_001039488 NM_001286685 NM_028081 NM_177309

RefSeq (білок)


NP_001006946 NP_060842


NP_001034567 NP_001034577 NP_001273614 NP_082357

Локус (UCSC)

Хр. 1: 110.95 – 110.96 Mb

Хр. 3: 106.59 – 106.64 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LRIF1 (англ. Ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 769 амінокислот, а молекулярна маса — 84 568^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSNNLRRVFL	KPAEENSGNA	SRCVSGCMYQ	VVQTIGSDGK	NLLQLLPIPK
SSGNLIPLVQ	SSVMSDALKG	NTGKPVQVTF	QTQISSSSTS	ASVQLPIFQP
ASSSNYFLTR	TVDTSEKGRV	TSVGTGNFSS	SVSKVQSHGV	KIDGLTMQTF
AVPPSTQKDS	SFIVVNTQSL	PVTVKSPVLP	SGHHLQIPAH	AEVKSVPASS
LPPSVQQKIL	ATATTSTSGM	VEASQMPTVI	YVSPVNTVKN	VVTKNFQNIY
PKPVTEIAKP	VILNTTQIPK	NVATETQLKG	GQHSQAAPVK	WIFQDNLQPF
TPSLVPVKSS	NNVASKILKT	FVDRKNLGDN	TINMPPLSTI	DPSGTRSKNM
PIKDNALVMF	NGKVYLLAKK	GTDVLPSQID	QQNSVSPDTP	VRKDTLQTVS
SSPVTEISRE	VVNIVLAKSK	SSQMETKSLS	NTQLASMANL	RAEKNKVEKP
SPSTTNPHMN	QSSNYLKQSK	TLFTNPIFPV	GFSTGHNAPR	KVTAVIYARK
GSVLQSIEKI	SSSVDATTVT	SQQCVFRDQE	PKIHNEMAST	SDKGAQGRND
KKDSQGRSNK	ALHLKSDAEF	KKIFGLTKDL	RVCLTRIPDH	LTSGEGFDSF
SSLVKSGTYK	ETEFMVKEGE	RKQQNFDKKR	KAKTNKKMDH	IKKRKTENAY
NAIINGEANV	TGSQLLSSIL	PTSDVSQHNI	LTSHSKTRQE	KRTEMEYYTH
EKQEKGTLNS	NAAYEQSHFF	NKNYTEDIFP	VTPPELEETI	RDEKIRRLKQ
VLREKEAALE	EMRKKMHQK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Li H.J., Haque Z.K., Chen A., Mendelsohn M. (2007). RIF-1, a novel nuclear receptor corepressor that associates with the nuclear matrix. J. Cell. Biochem. 102: 1021—1035. PMID 17455211 DOI:10.1002/jcb.21340
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30299 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q5T3J3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.