LRPPRC

Ідентифікатори

Символи

LRPPRC, CLONE-23970, GP130, LRP130, LSFC, leucine rich pentatricopeptide repeat containing, MC4DN5

Зовнішні ІД

OMIM: 607544 MGI: 1919666 HomoloGene: 32695 GeneCards: LRPPRC

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded DNA binding • microtubule binding • ubiquitin protein ligase binding • beta-tubulin binding • actin filament binding • DNA binding • endonuclease activity • RNA binding
Клітинна компонента	• condensed nuclear chromosome • nuclear inner membrane • mitochondrial nucleoid • perinuclear region of cytoplasm • цитоплазма • цитоскелет • нуклеоплазма • мікротрубочка • nuclear outer membrane • мембрана • мітохондрія • клітинне ядро • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • mRNA transport • mitochondrion transport along microtubule • transcription, DNA-templated • negative regulation of mitochondrial RNA catabolic process • regulation of mitochondrial translation • GO:0016547 Редагування РНК • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10128


72416

Ensembl


ENSG00000138095


ENSMUSG00000024120

UniProt


P42704


Q6PB66

RefSeq (мРНК)


NM_133259


NM_028233

RefSeq (білок)


NP_573566


NP_082509

Локус (UCSC)

Хр. 2: 43.89 – 44 Mb

Хр. 17: 85.01 – 85.1 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LRPPRC (англ. Leucine rich pentatricopeptide repeat containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 394 амінокислот, а молекулярна маса — 157 905^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAALLRSARW	LLRAGAAPRL	PLSLRLLPGG	PGRLHAASYL	PAARAGPVAG
GLLSPARLYA	IAAKEKDIQE	ESTFSSRKIS	NQFDWALMRL	DLSVRRTGRI
PKKLLQKVFN	DTCRSGGLGG	SHALLLLRSC	GSLLPELKLE	ERTEFAHRIW
DTLQKLGAVY	DVSHYNALLK	VYLQNEYKFS	PTDFLAKMEE	ANIQPNRVTY
QRLIASYCNV	GDIEGASKIL	GFMKTKDLPV	TEAVFSALVT	GHARAGDMEN
AENILTVMRD	AGIEPGPDTY	LALLNAYAEK	GDIDHVKQTL	EKVEKSELHL
MDRDLLQIIF	SFSKAGYPQY	VSEILEKVTC	ERRYIPDAMN	LILLLVTEKL
EDVALQILLA	CPVSKEDGPS	VFGSFFLQHC	VTMNTPVEKL	TDYCKKLKEV
QMHSFPLQFT	LHCALLANKT	DLAKALMKAV	KEEGFPIRPH	YFWPLLVGRR
KEKNVQGIIE	ILKGMQELGV	HPDQETYTDY	VIPCFDSVNS	ARAILQENGC
LSDSDMFSQA	GLRSEAANGN	LDFVLSFLKS	NTLPISLQSI	RSSLLLGFRR
SMNINLWSEI	TELLYKDGRY	CQEPRGPTEA	VGYFLYNLID	SMSDSEVQAK
EEHLRQYFHQ	LEKMNVKIPE	NIYRGIRNLL	ESYHVPELIK	DAHLLVESKN
LDFQKTVQLT	SSELESTLET	LKAENQPIRD	VLKQLILVLC	SEENMQKALE
LKAKYESDMV	TGGYAALINL	CCRHDKVEDA	LNLKEEFDRL	DSSAVLDTGK
YVGLVRVLAK	HGKLQDAINI	LKEMKEKDVL	IKDTTALSFF	HMLNGAALRG
EIETVKQLHE	AIVTLGLAEP	STNISFPLVT	VHLEKGDLST	ALEVAIDCYE
KYKVLPRIHD	VLCKLVEKGE	TDLIQKAMDF	VSQEQGEMVM	LYDLFFAFLQ
TGNYKEAKKI	IETPGIRARS	ARLQWFCDRC	VANNQVETLE	KLVELTQKLF
ECDRDQMYYN	LLKLYKINGD	WQRADAVWNK	IQEENVIPRE	KTLRLLAEIL
REGNQEVPFD	VPELWYEDEK	HSLNSSSAST	TEPDFQKDIL	IACRLNQKKG
AYDIFLNAKE	QNIVFNAETY	SNLIKLLMSE	DYFTQAMEVK	AFAETHIKGF
TLNDAANSRL	IITQVRRDYL	KEAVTTLKTV	LDQQQTPSRL	AVTRVIQALA
MKGDVENIEV	VQKMLNGLED	SIGLSKMVFI	NNIALAQIKN	NNIDAAIENI
ENMLTSENKV	IEPQYFGLAY	LFRKVIEEQL	EPAVEKISIM	AERLANQFAI
YKPVTDFFLQ	LVDAGKVDDA	RALLQRCGAI	AEQTPILLLF	LLRNSRKQGK
ASTVKSVLEL	IPELNEKEEA	YNSLMKSYVS	EKDVTSAKAL	YEHLTAKNTK
LDDLFLKRYA	SLLKYAGEPV	PFIEPPESFE	FYAQQLRKLR	ENSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт мРНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі, мембрані, мітохондрії.

Література

Xu F., Morin C., Mitchell G., Ackerley C., Robinson B.H. (2004). The role of the LRPPRC (leucine-rich pentatricopeptide repeat cassette) gene in cytochrome oxidase assembly: mutation causes lowered levels of COX (cytochrome c oxidase) I and COX III mRNA. Biochem. J. 382: 331—336. PMID 15139850 DOI:10.1042/BJ20040469
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hou J., Wang F., McKeehan W.L. (1994). Molecular cloning and expression of the gene for a major leucine-rich protein from human hepatoblastoma cells (HepG2). In Vitro Cell. Dev. Biol. Anim. 30A: 111—114. PMID 8012652 DOI:10.1007/BF02631402
Mili S., Shu H.J., Zhao Y., Pinol-Roma S. (2001). Distinct RNP complexes of shuttling hnRNP proteins with pre-mRNA and mRNA: candidate intermediates in formation and export of mRNA. Mol. Cell. Biol. 21: 7307—7319. PMID 11585913 DOI:10.1128/MCB.21.21.7307-7319.2001
Liu L., McKeehan W.L. (2002). Sequence analysis of LRPPRC and its SEC1 domain interaction partners suggests roles in cytoskeletal organization, vesicular trafficking, nucleocytosolic shuttling, and chromosome activity. Genomics. 79: 124—136. PMID 11827465 DOI:10.1006/geno.2001.6679
Mili S., Pinol-Roma S. (2003). LRP130, a pentatricopeptide motif protein with a noncanonical RNA-binding domain, is bound in vivo to mitochondrial and nuclear RNAs. Mol. Cell. Biol. 23: 4972—4982. PMID 12832482 DOI:10.1128/MCB.23.14.4972-4982.2003

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15714 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, P42704 (англ.) . Архів оригіналу за 28 грудня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.