LYST |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | LYST, lysosomal trafficking regulator, CHS, CHS1, Mauve |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606897 MGI: 107448 HomoloGene: 61 GeneCards: LYST |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Chediak-Higashi syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • microtubule cytoskeleton |
---|
Біологічний процес | • protein transport • pigmentation • melanosome organization • endosome to lysosome transport via multivesicular body sorting pathway • lysosome organization • defense response to bacterium • defense response to virus • leukocyte chemotaxis • natural killer cell mediated cytotoxicity • mast cell secretory granule organization • defense response to protozoan |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_000081 NM_001005736 NM_001301365 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 235.66 – 235.88 Mb | Хр. 13: 13.76 – 13.95 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LYST (англ. Lysosomal trafficking regulator) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 801 амінокислот, а молекулярна маса — 429 139[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSTDSNSLAR | | EFLTDVNRLC | | NAVVQRVEAR | | EEEEEETHMA | | TLGQYLVHGR |
GFLLLTKLNS | | IIDQALTCRE | | ELLTLLLSLL | | PLVWKIPVQE | | EKATDFNLPL |
SADIILTKEK | | NSSSQRSTQE | | KLHLEGSALS | | SQVSAKVNVF | | RKSRRQRKIT |
HRYSVRDARK | | TQLSTSDSEA | | NSDEKGIAMN | | KHRRPHLLHH | | FLTSFPKQDH |
PKAKLDRLAT | | KEQTPPDAMA | | LENSREIIPR | | QGSNTDILSE | | PAALSVISNM |
NNSPFDLCHV | | LLSLLEKVCK | | FDVTLNHNSP | | LAASVVPTLT | | EFLAGFGDCC |
SLSDNLESRV | | VSAGWTEEPV | | ALIQRMLFRT | | VLHLLSVDVS | | TAEMMPENLR |
KNLTELLRAA | | LKIRICLEKQ | | PDPFAPRQKK | | TLQEVQEDFV | | FSKYRHRALL |
LPELLEGVLQ | | ILICCLQSAA | | SNPFYFSQAM | | DLVQEFIQHH | | GFNLFETAVL |
QMEWLVLRDG | | VPPEASEHLK | | ALINSVMKIM | | STVKKVKSEQ | | LHHSMCTRKR |
HRRCEYSHFM | | HHHRDLSGLL | | VSAFKNQVSK | | NPFEETADGD | | VYYPERCCCI |
AVCAHQCLRL | | LQQASLSSTC | | VQILSGVHNI | | GICCCMDPKS | | VIIPLLHAFK |
LPALKNFQQH | | ILNILNKLIL | | DQLGGAEISP | | KIKKAACNIC | | TVDSDQLAQL |
EETLQGNLCD | | AELSSSLSSP | | SYRFQGILPS | | SGSEDLLWKW | | DALKAYQNFV |
FEEDRLHSIQ | | IANHICNLIQ | | KGNIVVQWKL | | YNYIFNPVLQ | | RGVELAHHCQ |
HLSVTSAQSH | | VCSHHNQCLP | | QDVLQIYVKT | | LPILLKSRVI | | RDLFLSCNGV |
SQIIELNCLN | | GIRSHSLKAF | | ETLIISLGEQ | | QKDASVPDID | | GIDIEQKELS |
SVHVGTSFHH | | QQAYSDSPQS | | LSKFYAGLKE | | AYPKRRKTVN | | QDVHINTINL |
FLCVAFLCVS | | KEAESDRESA | | NDSEDTSGYD | | STASEPLSHM | | LPCISLESLV |
LPSPEHMHQA | | ADIWSMCRWI | | YMLSSVFQKQ | | FYRLGGFRVC | | HKLIFMIIQK |
LFRSHKEEQG | | KKEGDTSVNE | | NQDLNRISQP | | KRTMKEDLLS | | LAIKSDPIPS |
ELGSLKKSAD | | SLGKLELQHI | | SSINVEEVSA | | TEAAPEEAKL | | FTSQESETSL |
QSIRLLEALL | | AICLHGARTS | | QQKMELELPN | | QNLSVESILF | | EMRDHLSQSK |
VIETQLAKPL | | FDALLRVALG | | NYSADFEHND | | AMTEKSHQSA | | EELSSQPGDF |
SEEAEDSQCC | | SFKLLVEEEG | | YEADSESNPE | | DGETQDDGVD | | LKSETEGFSA |
SSSPNDLLEN | | LTQGEIIYPE | | ICMLELNLLS | | ASKAKLDVLA | | HVFESFLKII |
RQKEKNVFLL | | MQQGTVKNLL | | GGFLSILTQD | | DSDFQACQRV | | LVDLLVSLMS |
SRTCSEELTL | | LLRIFLEKSP | | CTKILLLGIL | | KIIESDTTMS | | PSQYLTFPLL |
HAPNLSNGVS | | SQKYPGILNS | | KAMGLLRRAR | | VSRSKKEADR | | ESFPHRLLSS |
WHIAPVHLPL | | LGQNCWPHLS | | EGFSVSLWFN | | VECIHEAEST | | TEKGKKIKKR |
NKSLILPDSS | | FDGTESDRPE | | GAEYINPGER | | LIEEGCIHII | | SLGSKALMIQ |
VWADPHNATL | | IFRVCMDSND | | DMKAVLLAQV | | ESQENIFLPS | | KWQHLVLTYL |
QQPQGKRRIH | | GKISIWVSGQ | | RKPDVTLDFM | | LPRKTSLSSD | | SNKTFCMIGH |
CLSSQEEFLQ | | LAGKWDLGNL | | LLFNGAKVGS | | QEAFYLYACG | | PNHTSVMPCK |
YGKPVNDYSK | | YINKEILRCE | | QIRELFMTKK | | DVDIGLLIES | | LSVVYTTYCP |
AQYTIYEPVI | | RLKGQMKTQL | | SQRPFSSKEV | | QSILLEPHHL | | KNLQPTEYKT |
IQGILHEIGG | | TGIFVFLFAR | | VVELSSCEET | | QALALRVILS | | LIKYNQQRVH |
ELENCNGLSM | | IHQVLIKQKC | | IVGFYILKTL | | LEGCCGEDII | | YMNENGEFKL |
DVDSNAIIQD | | VKLLEELLLD | | WKIWSKAEQG | | VWETLLAALE | | VLIRADHHQQ |
MFNIKQLLKA | | QVVHHFLLTC | | QVLQEYKEGQ | | LTPMPREVCR | | SFVKIIAEVL |
GSPPDLELLT | | IIFNFLLAVH | | PPTNTYVCHN | | PTNFYFSLHI | | DGKIFQEKVR |
SIMYLRHSSS | | GGRSLMSPGF | | MVISPSGFTA | | SPYEGENSSN | | IIPQQMAAHM |
LRSRSLPAFP | | TSSLLTQSQK | | LTGSLGCSID | | RLQNIADTYV | | ATQSKKQNSL |
GSSDTLKKGK | | EDAFISSCES | | AKTVCEMEAV | | LSAQVSVSDV | | PKGVLGFPVV |
KADHKQLGAE | | PRSEDDSPGD | | ESCPRRPDYL | | KGLASFQRSH | | STIASLGLAF |
PSQNGSAAVG | | RWPSLVDRNT | | DDWENFAYSL | | GYEPNYNRTA | | SAHSVTEDCL |
VPICCGLYEL | | LSGVLLILPD | | VLLEDVMDKL | | IQADTLLVLV | | NHPSPAIQQG |
VIKLLDAYFA | | RASKEQKDKF | | LKNRGFSLLA | | NQLYLHRGTQ | | ELLECFIEMF |
FGRHIGLDEE | | FDLEDVRNMG | | LFQKWSVIPI | | LGLIETSLYD | | NILLHNALLL |
LLQILNSCSK | | VADMLLDNGL | | LYVLCNTVAA | | LNGLEKNIPM | | SEYKLLACDI |
QQLFIAVTIH | | ACSSSGSQYF | | RVIEDLIVML | | GYLQNSKNKR | | TQNMAVALQL |
RVLQAAMEFI | | RTTANHDSEN | | LTDSLQSPSA | | PHHAVVQKRK | | SIAGPRKFPL |
AQTESLLMKM | | RSVANDELHV | | MMQRRMSQEN | | PSQATETELA | | QRLQRLTVLA |
VNRIIYQEFN | | SDIIDILRTP | | ENVTQSKTSV | | FQTEISEENI | | HHEQSSVFNP |
FQKEIFTYLV | | EGFKVSIGSS | | KASGSKQQWT | | KILWSCKETF | | RMQLGRLLVH |
ILSPAHAAQE | | RKQIFEIVHE | | PNHQEILRDC | | LSPSLQHGAK | | LVLYLSELIH |
NHQGELTEEE | | LGTAELLMNA | | LKLCGHKCIP | | PSASTKADLI | | KMIKEEQKKY |
ETEEGVNKAA | | WQKTVNNNQQ | | SLFQRLDSKS | | KDISKIAADI | | TQAVSLSQGN |
ERKKVIQHIR | | GMYKVDLSAS | | RHWQELIQQL | | THDRAVWYDP | | IYYPTSWQLD |
PTEGPNRERR | | RLQRCYLTIP | | NKYLLRDRQK | | SEDVVKPPLS | | YLFEDKTHSS |
FSSTVKDKAA | | SESIRVNRRC | | ISVAPSRETA | | GELLLGKCGM | | YFVEDNASDT |
VESSSLQGEL | | EPASFSWTYE | | EIKEVHKRWW | | QLRDNAVEIF | | LTNGRTLLLA |
FDNTKVRDDV | | YHNILTNNLP | | NLLEYGNITA | | LTNLWYTGQI | | TNFEYLTHLN |
KHAGRSFNDL | | MQYPVFPFIL | | ADYVSETLDL | | NDLLIYRNLS | | KPIAVQYKEK |
EDRYVDTYKY | | LEEEYRKGAR | | EDDPMPPVQP | | YHYGSHYSNS | | GTVLHFLVRM |
PPFTKMFLAY | | QDQSFDIPDR | | TFHSTNTTWR | | LSSFESMTDV | | KELIPEFFYL |
PEFLVNREGF | | DFGVRQNGER | | VNHVNLPPWA | | RNDPRLFILI | | HRQALESDYV |
SQNICQWIDL | | VFGYKQKGKA | | SVQAINVFHP | | ATYFGMDVSA | | VEDPVQRRAL |
ETMIKTYGQT | | PRQLFHMAHV | | SRPGAKLNIE | | GELPAAVGLL | | VQFAFRETRE |
QVKEITYPSP | | LSWIKGLKWG | | EYVGSPSAPV | | PVVCFSQPHG | | ERFGSLQALP |
TRAICGLSRN | | FCLLMTYSKE | | QGVRSMNSTD | | IQWSAILSWG | | YADNILRLKS |
KQSEPPVNFI | | QSSQQYQVTS | | CAWVPDSCQL | | FTGSKCGVIT | | AYTNRFTSST |
PSEIEMETQI | | HLYGHTEEIT | | SLFVCKPYSI | | LISVSRDGTC | | IIWDLNRLCY |
VQSLAGHKSP | | VTAVSASETS | | GDIATVCDSA | | GGGSDLRLWT | | VNGDLVGHVH |
CREIICSVAF | | SNQPEGVSIN | | VIAGGLENGI | | VRLWSTWDLK | | PVREITFPKS |
NKPIISLTFS | | CDGHHLYTAN | | SDGTVIAWCR | | KDQQRLKQPM | | FYSFLSSYAA |
G |
Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LYST переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1968 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q99698 (англ.) . Архів оригіналу за 21 квітня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |