MMP12

MMP12
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1JIZ, 1JK3, 1OS2, 1OS9, 1RMZ, 1ROS, 1UTT, 1UTZ, 1Y93, 1YCM, 1Z3J, 2HU6, 2JXY, 2K2G, 2K9C, 2KRJ, 2MLR, 2MLS, 2OXU, 2OXW, 2OXZ, 2POJ, 2W0D, 2WO8, 2WO9, 2WOA, 2Z2D, 3BA0, 3EHX, 3EHY, 3F15, 3F16, 3F17, 3F18, 3F19, 3F1A, 3LIK, 3LIL, 3LIR, 3LJG, 3LK8, 3LKA, 3N2U, 3N2V, 3NX7, 3RTS, 3RTT, 3TS4, 3TSK, 3UVC, 4EFS, 4GQL, 4GR0, 4GR3, 4GR8, 4GUY, 4H30, 4H49, 4H76, 4H84, 4I03, 4IJO, 2N8R, 5I4O, 5I0L, 5I2Z, 5I3M, 5I43

Ідентифікатори
Символи MMP12, HME, ME, MME, MMP-12, Matrix metallopeptidase 12
Зовнішні ІД OMIM: 601046 MGI: 97005 HomoloGene: 20547 GeneCards: MMP12
Реагує на сполуку
cts-1027[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• GO:0070122 peptidase activity
• endopeptidase activity
• hydrolase activity
• metallopeptidase activity
• зв'язування з іоном металу
• serine-type endopeptidase activity
• metalloendopeptidase activity
• calcium ion binding
• collagen binding
• zinc ion binding
• sequence-specific DNA binding

Клітинна компонента

• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• extracellular region
• міжклітинний простір
• клітинне ядро
• цитоплазма

Біологічний процес

• collagen catabolic process
• wound healing, spreading of epidermal cells
• extracellular matrix disassembly
• positive regulation of epithelial cell proliferation involved in wound healing
• Загоєння ран
• GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
• протеоліз
• protein import into nucleus
• GO:1901313 positive regulation of gene expression
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• regulation of defense response to virus by host
• negative regulation of type I interferon-mediated signaling pathway
• positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway
• cellular response to virus
• response to hypoxia
• elastin catabolic process
• negative regulation of endothelial cell-matrix adhesion via fibronectin
• extracellular matrix organization
• response to amyloid-beta

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4321
17381
Ensembl
ENSG00000262406
ENSMUSG00000049723
UniProt
P39900
P34960
RefSeq (мРНК)
NM_002426
NM_008605
NM_001320076
NM_001320077
RefSeq (білок)
NP_002417
NP_001307005
NP_001307006
NP_032631
Локус (UCSC) Хр. 11: 102.86 – 102.87 Mb Хр. 9: 7.34 – 7.37 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

MMP12 (англ. Matrix metallopeptidase 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 470 амінокислот, а молекулярна маса — 54 002[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKFLLILLLQATASGALPLNSSTSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPV
TKMKYSGNLMKEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHF
REMPGGPVWRKHYITYRINNYTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFS
KINTGMADILVVFARGAHGDFHAFDGKGGILAHAFGPGSGIGGDAHFDED
EFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVMFPTYKYVDINTFRL
SADDIRGIQSLYGDPKENQRLPNPDNSEPALCDPNLSFDAVTTVGNKIFF
FKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDD
KYWLISNLRPEPNYPKSIHSFGFPNFVKKIDAAVFNPRFYRTYFFVDNQY
WRYDERRQMMDPGYPKLITKNFQGIGPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFE
YDFLLQRITKTLKSNSWFGC

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Nar H., Werle K., Bauer M.M.T., Dollinger H., Jung B. (2001). Crystal structure of human macrophage elastase (MMP-12) in complex with a hydroxamic acid inhibitor. J. Mol. Biol. 312: 743—751. PMID 11575929 DOI:10.1006/jmbi.2001.4953
  • Shapiro S.D., Kobayashi D.K., Ley T.J. (1993). Cloning and characterization of a unique elastolytic metalloproteinase produced by human alveolar macrophages. J. Biol. Chem. 268: 23824—23829. PMID 8226919

Примітки

  1. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Matrix metallopeptidase 12 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7158 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, P39900 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 11
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
  • п
  • о
  • р
Протеази: металоендопептидази (EC 3.4.24)
Білки ADAM
Матриксні металопротеїнази

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.