NISCH

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3P0C

Ідентифікатори

Символи

NISCH, I-1, IR1, IRAS, hIRAS, nischarin

Зовнішні ІД

OMIM: 615507 HomoloGene: 130564 GeneCards: NISCH

Онтологія гена
Молекулярна функція	• integrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • identical protein binding • structural constituent of cytoskeleton • protein kinase binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • recycling endosome • гіалоплазма • ендосома • клітинна мембрана • early endosome • мембрана
Біологічний процес	• regulation of blood pressure • Rac protein signal transduction • negative regulation of cell migration • regulation of synaptic transmission, GABAergic • actin cytoskeleton organization • norepinephrine secretion • glucose metabolic process • GO:0097285 апоптоз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11188


306255

Ensembl


ENSG00000010322


ENSRNOG00000018823

UniProt


Q9Y2I1


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_001276293 NM_001276294 NM_007184


NM_001376918

RefSeq (білок)


NP_001263222 NP_001263223 NP_009115


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 3: 52.46 – 52.49 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NISCH (англ. Nischarin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 504 амінокислот, а молекулярна маса — 166 629^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATARTFGPE	REAEPAKEAR	VVGSELVDTY	TVYIIQVTDG	SHEWTVKHRY
SDFHDLHEKL	VAERKIDKNL	LPPKKIIGKN	SRSLVEKREK	DLEVYLQKLL
AAFPGVTPRV	LAHFLHFHFY	EINGITAALA	EELFEKGEQL	LGAGEVFAIG
PLQLYAVTEQ	LQQGKPTCAS	GDAKTDLGHI	LDFTCRLKYL	KVSGTEGPFG
TSNIQEQLLP	FDLSIFKSLH	QVEISHCDAK	HIRGLVASKP	TLATLSVRFS
ATSMKEVLVP	EASEFDEWEP	EGTTLEGPVT	AVIPTWQALT	TLDLSHNSVS
EIDESVKLIP	KIEFLDLSHN	GLLVVDNLQH	LYNLVHLDLS	YNKLSSLEGL
HTKLGNIKTL	NLAGNLLESL	SGLHKLYSLV	NLDLRDNRIE	QMEEVRSIGS
LPCLEHVSLL	NNPLSIIPDY	RTKVLAQFGE	RASEVCLDDT	VTTEKELDTV
EVLKAIQKAK	EVKSKLSNPE	KKGGEDSRLS	AAPCIRPSSS	PPTVAPASAS
LPQPILSNQG	IMFVQEEALA	SSLSSTDSLT	PEHQPIAQGC	SDSLESIPAG
QAASDDLRDV	PGAVGGASPE	HAEPEVQVVP	GSGQIIFLPF	TCIGYTATNQ
DFIQRLSTLI	RQAIERQLPA	WIEAANQREE	GQGEQGEEED	EEEEEEEDVA
ENRYFEMGPP	DVEEEEGGGQ	GEEEEEEEED	EEAEEERLAL	EWALGADEDF
LLEHIRILKV	LWCFLIHVQG	SIRQFAACLV	LTDFGIAVFE	IPHQESRGSS
QHILSSLRFV	FCFPHGDLTE	FGFLMPELCL	VLKVRHSENT	LFIISDAANL
HEFHADLRSC	FAPQHMAMLC	SPILYGSHTS	LQEFLRQLLT	FYKVAGGCQE
RSQGCFPVYL	VYSDKRMVQT	AAGDYSGNIE	WASCTLCSAV	RRSCCAPSEA
VKSAAIPYWL	LLTPQHLNVI	KADFNPMPNR	GTHNCRNRNS	FKLSRVPLST
VLLDPTRSCT	QPRGAFADGH	VLELLVGYRF	VTAIFVLPHE	KFHFLRVYNQ
LRASLQDLKT	VVIAKTPGTG	GSPQGSFADG	QPAERRASND	QRPQEVPAEA
LAPAPAEVPA	PAPAAASASG	PAKTPAPAEA	STSALVPEET	PVEAPAPPPA
EAPAQYPSEH	LIQATSEENQ	IPSHLPACPS	LRHVASLRGS	AIIELFHSSI
AEVENEELRH	LMWSSVVFYQ	TPGLEVTACV	LLSTKAVYFV	LHDGLRRYFS
EPLQDFWHQK	NTDYNNSPFH	ISQCFVLKLS	DLQSVNVGLF	DQHFRLTGST
PMQVVTCLTR	DSYLTHCFLQ	HLMVVLSSLE	RTPSPEPVDK	DFYSEFGNKT
TGKMENYELI	HSSRVKFTYP	SEEEIGDLTF	TVAQKMAEPE	KAPALSILLY
VQAFQVGMPP	PGCCRGPLRP	KTLLLTSSEI	FLLDEDCVHY	PLPEFAKEPP
QRDRYRLDDG	RRVRDLDRVL	MGYQTYPQAL	TLVFDDVQGH	DLMGSVTLDH
FGEVPGGPAR	ASQGREVQWQ	VFVPSAESRE	KLISLLARQW	EALCGRELPV
ELTG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ivanov T.R., Jones J.C., Dontenwill M., Bousquet P., Piletz J.E. (1998). Characterization of a partial cDNA clone detected by imidazoline receptor-selective antisera. J. Auton. Nerv. Syst. 72: 98—110. PMID 9851558 DOI:10.1016/S0165-1838(98)00094-0
Sano H., Liu S.C.H., Lane W.S., Piletz J.E., Lienhard G.E. (2002). Insulin receptor substrate 4 associates with the protein IRAS. J. Biol. Chem. 277: 19439—19447. PMID 11912194 DOI:10.1074/jbc.M111838200
Lim K.-P., Hong W. (2004). Human Nischarin/imidazoline receptor antisera-selected protein is targeted to the endosomes by a combined action of a PX domain and a coiled-coil region. J. Biol. Chem. 279: 54770—54782. PMID 15475348 DOI:10.1074/jbc.M411315200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18006 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9Y2I1 (англ.) . Архів оригіналу за 22 лютого 2018. Процитовано 30 серпня 2017.