OPN1LW |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | OPN1LW, CBBM, CBP, COD5, RCP, ROP, opsin 1 (cone pigments), long-wave-sensitive, opsin 1, long wave sensitive |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 300822 MGI: 1097692 HomoloGene: 68064 GeneCards: OPN1LW |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
blue cone monochromacy[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • G protein-coupled receptor activity • photoreceptor activity • signal transducer activity • G protein-coupled photoreceptor activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • photoreceptor outer segment • photoreceptor disc membrane |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of cytokinesis • GO:0072468 сигнальна трансдукція • зір • retinoid metabolic process • відповідь на стимул • phototransduction • detection of visible light • G protein-coupled receptor signaling pathway • cellular response to light stimulus |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. X: 154.14 – 154.16 Mb | Хр. X: 73.17 – 73.19 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
OPN1LW (англ. Opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive (color blindness, deutan)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359 амінокислот, а молекулярна маса — 40 218[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAQRLTGEQT | | LDHYEDSTHA | | SIFTYTNSNS | | TKGPFEGPNY | | HIAPRWVYHL |
TSTWMILVVV | | ASVFTNGLVL | | AATMRFKKLR | | HPLNWILVNL | | AVADLAETII |
ASTISVVNQI | | YGYFVLGHPL | | CVIEGYIVSL | | CGITGLWSLA | | IISWERWLVV |
CKPFGNVRFD | | AKLATVGIVF | | SWVWAAIWTA | | PPIFGWSRYW | | PYGLKTSCGP |
DVFSGTSYPG | | VQSYMMVLMV | | TCCIFPLSII | | VLCYLQVWLA | | IRAVAKQQKE |
SESTQKAEKE | | VTRMVVVMVF | | AYCLCWGPYT | | FFACFATAHP | | GYAFHPLVAS |
LPSYFAKSAT | | IYNPIIYVFM | | NRQFRNCILH | | LFGKKVDDSS | | ELSSTSKTEV |
SSVSSVSPA |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з хромофором. Локалізований у мембрані.
Література
- Sun H., Macke J.P., Nathans J. (1997). Mechanisms of spectral tuning in the mouse green cone pigment. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 8860—8865. PMID 9238068 DOI:10.1073/pnas.94.16.8860
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з OPN1LW переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2015. Процитовано 13 лютого 2018.
- ↑ UniProt, O35599 (англ.) . Архів оригіналу за 14 лютого 2018. Процитовано 13 лютого 2018.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Рецептори нейромедіаторів | Адренорецептори | |
---|
Пуринові рецептори | - Аденозинові рецептори
- P2Y
|
---|
Серотонінові рецептори | - (крім 5-HT3) 5-HT1
- 5-HT2
- 5-HT
- 5A
- 6
- 7)
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Метаболіти та сигнальні молекули | Ейкозаноїдні рецептори | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Пептиди | Рецептори нейропептидів | - B/W
- FF
- S
- Y
- Нейромедин
- Нейротенсин
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Різні | |
---|
|
|
|
|
|