PACRG

Ідентифікатори

Символи

PACRG, GLUP, HAK005771, PARK2CRG, PARK2 co-regulated, PARK2 coregulated, parkin coregulated, PACRG2.1

Зовнішні ІД

OMIM: 608427 MGI: 1916560 HomoloGene: 16212 GeneCards: PACRG

Онтологія гена
Молекулярна функція	• Hsp70 protein binding • Hsp90 protein binding • actin binding • alpha-tubulin binding • chaperone binding • G protein-coupled receptor binding • heat shock protein binding • ubiquitin protein ligase binding • beta-tubulin binding
Клітинна компонента	• cell body • везикула • гіалоплазма • neuron projection • sperm midpiece • війка • мітохондрія • клітинне ядро
Біологічний процес	• negative regulation of cell death • Unfolded Protein Response • spermatid development
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


135138


69310

Ensembl


ENSG00000112530


ENSMUSG00000037196

UniProt


Q96M98


Q9DAK2

RefSeq (мРНК)


NM_001080378 NM_001080379 NM_152410


NM_027032

RefSeq (білок)


NP_001073847 NP_001073848 NP_689623


NP_081308

Локус (UCSC)

Хр. 6: 162.73 – 163.32 Mb

Хр. 17: 10.62 – 11.06 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PACRG (англ. Parkin coregulated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 296 амінокислот, а молекулярна маса — 33 342^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVAEKETLSL	NKCPDKMPKR	TKLLAQQPLP	VHQPHSLVSE	GFTVKAMMKN
SVVRGPPAAG	AFKERPTKPT	AFRKFYERGD	FPIALEHDSK	GNKIAWKVEI
EKLDYHHYLP	LFFDGLCEMT	FPYEFFARQG	IHDMLEHGGN	KILPVLPQLI
IPIKNALNLR	NRQVICVTLK	VLQHLVVSAE	MVGKALVPYY	RQILPVLNIF
KNMNGSYSLP	RLECSGAIMA	RCNLDHLGSS	DPPTSASQVA	EIIVNSGDGI
DYSQQKRENI	GDLIQETLEA	FERYGGENAF	INIKYVVPTY	ESCLLN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

West A.B., Lockhart P.J., O'Farell C., Farrer M.J. (2003). Identification of a novel gene linked to parkin via a bi-directional promoter. J. Mol. Biol. 326: 11—19. PMID 12547187 DOI:10.1016/S0022-2836(02)01376-1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19152 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96M98 (англ.) . Архів оригіналу за 30 листопада 2016. Процитовано 6 вересня 2017.