PARP1

PARP1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1UK0, 1UK1, 1WOK, 2COK, 2CR9, 2CS2, 2DMJ, 2JVN, 2L30, 2L31, 2RCW, 2RD6, 2RIQ, 3GJW, 3GN7, 3L3L, 3L3M, 3OD8, 3ODA, 3ODC, 3ODE, 4AV1, 4DQY, 4GV7, 4HHY, 4HHZ, 4L6S, 4OPX, 4OQA, 4OQB, 4PJT, 4UND, 4ZZZ, 5A00, 4R5W, 4R6E, 4UXB, 2N8A, 4XHU, 4RV6, 5HA9, 5DS3

Ідентифікатори
Символи PARP1, ADPRT, ADPRT 1, ADPRT1, ARTD1, PARP, PARP-1, PPOL, pADPRT-1, poly(ADP-ribose) polymerase 1, Poly-PARP, PARS
Зовнішні ІД OMIM: 173870 MGI: 1340806 HomoloGene: 1222 GeneCards: PARP1
Пов'язані генетичні захворювання
меланома[1]
Реагує на сполуку
олапаріб, rucaparib[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• transferase activity
• DNA binding
• R-SMAD binding
• DNA ligase (ATP) activity
• protein N-terminus binding
• glycosyltransferase activity
• NAD binding
• zinc ion binding
• transcription factor binding
• histone deacetylase binding
• зв'язування з іоном металу
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• identical protein binding
• protein kinase binding
• estrogen receptor binding
• enzyme binding
• SMAD binding
• RNA binding
• NAD+ ADP-ribosyltransferase activity
• protein ADP-ribosylase activity
• RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
• GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
• NAD DNA ADP-ribosyltransferase activity

Клітинна компонента

• nuclear envelope
• мембрана
• transcription regulator complex
• нуклеоплазма
• ядерце
• мітохондрія
• клітинне ядро
• protein-DNA complex
• цитоплазма
• GO:0009327 protein-containing complex
• site of double-strand break
• site of DNA damage
• хромосома

Біологічний процес

• positive regulation of transcription regulatory region DNA binding
• lagging strand elongation
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
• mitochondrial DNA metabolic process
• mitochondrial DNA repair
• nucleotide-excision repair, DNA damage recognition
• mitochondrion organization
• signal transduction involved in regulation of gene expression
• protein autoprocessing
• GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
• transcription by RNA polymerase II
• macrophage differentiation
• cellular response to DNA damage stimulus
• positive regulation of cardiac muscle hypertrophy
• global genome nucleotide-excision repair
• double-strand break repair via homologous recombination
• protein modification process
• cellular response to insulin stimulus
• negative regulation of telomere maintenance via telomere lengthening
• protein poly-ADP-ribosylation
• cellular response to oxidative stress
• DNA ligation involved in DNA repair
• nucleotide-excision repair, DNA incision
• GO:0100026 Репарація ДНК
• positive regulation of SMAD protein signal transduction
• nucleotide-excision repair, preincision complex assembly
• regulation of oxidative stress-induced neuron intrinsic apoptotic signaling pathway
• cellular response to zinc ion
• regulation of SMAD protein complex assembly
• cellular response to amyloid-beta
• regulation of DNA methylation
• positive regulation of mitochondrial depolarization
• nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion
• positive regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway
• positive regulation of protein localization to nucleus
• nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion
• cellular response to transforming growth factor beta stimulus
• double-strand break repair
• transcription, DNA-templated
• positive regulation of myofibroblast differentiation
• nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding
• positive regulation of neuron death
• response to aldosterone
• transforming growth factor beta receptor signaling pathway
• nucleotide-excision repair, preincision complex stabilization
• response to gamma radiation
• GO:0048552 regulation of catalytic activity
• ATP generation from poly-ADP-D-ribose
• negative regulation of ATP biosynthetic process
• telomere maintenance
• protein ADP-ribosylation
• peptidyl-serine ADP-ribosylation
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• GO:0097285 апоптоз
• positive regulation of single strand break repair
• peptidyl-glutamic acid poly-ADP-ribosylation
• DNA ADP-ribosylation
• cellular response to UV
• protein auto-ADP-ribosylation
• positive regulation of double-strand break repair via homologous recombination

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
142
11545
Ensembl
ENSG00000143799
ENSMUSG00000026496
UniProt
P09874
P11103
RefSeq (мРНК)
NM_001618
NM_007415
RefSeq (білок)
NP_001609
NP_001609.2
н/д
Локус (UCSC) Хр. 1: 226.36 – 226.41 Mb Хр. 1: 180.4 – 180.43 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PARP1 (англ. Poly(ADP-ribose) polymerase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 014 амінокислот, а молекулярна маса — 113 084[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAESSDKLYRVEYAKSGRASCKKCSESIPKDSLRMAIMVQSPMFDGKVPH
WYHFSCFWKVGHSIRHPDVEVDGFSELRWDDQQKVKKTAEAGGVTGKGQD
GIGSKAEKTLGDFAAEYAKSNRSTCKGCMEKIEKGQVRLSKKMVDPEKPQ
LGMIDRWYHPGCFVKNREELGFRPEYSASQLKGFSLLATEDKEALKKQLP
GVKSEGKRKGDEVDGVDEVAKKKSKKEKDKDSKLEKALKAQNDLIWNIKD
ELKKVCSTNDLKELLIFNKQQVPSGESAILDRVADGMVFGALLPCEECSG
QLVFKSDAYYCTGDVTAWTKCMVKTQTPNRKEWVTPKEFREISYLKKLKV
KKQDRIFPPETSASVAATPPPSTASAPAAVNSSASADKPLSNMKILTLGK
LSRNKDEVKAMIEKLGGKLTGTANKASLCISTKKEVEKMNKKMEEVKEAN
IRVVSEDFLQDVSASTKSLQELFLAHILSPWGAEVKAEPVEVVAPRGKSG
AALSKKSKGQVKEEGINKSEKRMKLTLKGGAAVDPDSGLEHSAHVLEKGG
KVFSATLGLVDIVKGTNSYYKLQLLEDDKENRYWIFRSWGRVGTVIGSNK
LEQMPSKEDAIEHFMKLYEEKTGNAWHSKNFTKYPKKFYPLEIDYGQDEE
AVKKLTVNPGTKSKLPKPVQDLIKMIFDVESMKKAMVEYEIDLQKMPLGK
LSKRQIQAAYSILSEVQQAVSQGSSDSQILDLSNRFYTLIPHDFGMKKPP
LLNNADSVQAKVEMLDNLLDIEVAYSLLRGGSDDSSKDPIDVNYEKLKTD
IKVVDRDSEEAEIIRKYVKNTHATTHNAYDLEVIDIFKIEREGECQRYKP
FKQLHNRRLLWHGSRTTNFAGILSQGLRIAPPEAPVTGYMFGKGIYFADM
VSKSANYCHTSQGDPIGLILLGEVALGNMYELKHASHISKLPKGKHSVKG
LGKTTPDPSANISLDGVDVPLGTGISSGVNDTSLLYNEYIVYDIAQVNLK
YLLKLKFNFKTSLW

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з НАД, іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Auer B., Nagl U., Herzog H., Schneider R., Schweiger M. (1989). Human nuclear NAD+ ADP-ribosyltransferase(polymerizing): organization of the gene. DNA. 8: 575—580. PMID 2513174 DOI:10.1089/dna.1989.8.575
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Maruyama T., Nara K., Yoshikawa H., Suzuki N. (2007). Txk, a member of the non-receptor tyrosine kinase of the Tec family, forms a complex with poly(ADP-ribose) polymerase 1 and elongation factor 1alpha and regulates interferon-gamma gene transcription in Th1 cells. Clin. Exp. Immunol. 147: 164—175. PMID 17177976 DOI:10.1111/j.1365-2249.2006.03249.x
  • Rolli V., O'Farrell M., Menissier-de Murcia J., de Murcia G.M. (1997). Random mutagenesis of the poly(ADP-ribose) polymerase catalytic domain reveals amino acids involved in polymer branching. Biochemistry. 36: 12147—12154. PMID 9315851 DOI:10.1021/bi971055p
  • Dantzer F., Nasheuer H.P., Vonesch J.L., de Murcia G., Menissier-de Murcia J. (1998). Functional association of poly(ADP-ribose) polymerase with DNA polymerase alpha-primase complex: a link between DNA strand break detection and DNA replication. Nucleic Acids Res. 26: 1891—1898. PMID 9518481 DOI:10.1093/nar/26.8.1891
  • Li Y., Oh H.J., Lau Y.-F.C. (2006). The poly(ADP-ribose) polymerase 1 interacts with Sry and modulates its biological functions. Mol. Cell. Endocrinol. 257: 35—46. PMID 16904257 DOI:10.1016/j.mce.2006.06.008

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PARP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з PARP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. ↑ Human PubMed Reference:.
  4. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  5. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:270 (англ.) . Архів оригіналу за 18 квітня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
  6. ↑ UniProt, P09874 (англ.) . Архів оригіналу за 12 квітня 2011. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»