PCDH1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PCDH1, PC42, PCDH42, protocadherin 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603626 MGI: 104692 HomoloGene: 12613 GeneCards: PCDH1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана • cell-cell junction • клітинне ядро • ядерце • міжклітинні контакти • внутрішньоклітинна мембранна органела |
---|
Біологічний процес | • cell-cell signaling • адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001278613 NM_001278615 NM_002587 NM_032420 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001265542 NP_001265544 NP_002578 NP_115796 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 141.85 – 141.88 Mb | Хр. 18: 38.32 – 38.35 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PCDH1 (англ. Protocadherin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 060 амінокислот, а молекулярна маса — 114 743[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDSGAGGRRC | | PEAALLILGP | | PRMEHLRHSP | | GPGGQRLLLP | | SMLLALLLLL |
APSPGHATRV | | VYKVPEEQPP | | NTLIGSLAAD | | YGFPDVGHLY | | KLEVGAPYLR |
VDGKTGDIFT | | TETSIDREGL | | RECQNQLPGD | | PCILEFEVSI | | TDLVQNGSPR |
LLEGQIEVQD | | INDNTPNFAS | | PVITLAIPEN | | TNIGSLFPIP | | LASDRDAGPN |
GVASYELQAG | | PEAQELFGLQ | | VAEDQEEKQP | | QLIVMGNLDR | | ERWDSYDLTI |
KVQDGGSPPR | | ASSALLRVTV | | LDTNDNAPKF | | ERPSYEAELS | | ENSPIGHSVI |
QVKANDSDQG | | ANAEIEYTFH | | QAPEVVRRLL | | RLDRNTGLIT | | VQGPVDREDL |
STLRFSVLAK | | DRGTNPKSAR | | AQVVVTVKDM | | NDNAPTIEIR | | GIGLVTHQDG |
MANISEDVAE | | ETAVALVQVS | | DRDEGENAAV | | TCVVAGDVPF | | QLRQASETGS |
DSKKKYFLQT | | TTPLDYEKVK | | DYTIEIVAVD | | SGNPPLSSTN | | SLKVQVVDVN |
DNAPVFTQSV | | TEVAFPENNK | | PGEVIAEITA | | SDADSGSNAE | | LVYSLEPEPA |
AKGLFTISPE | | TGEIQVKTSL | | DREQRESYEL | | KVVAADRGSP | | SLQGTATVLV |
NVLDCNDNDP | | KFMLSGYNFS | | VMENMPALSP | | VGMVTVIDGD | | KGENAQVQLS |
VEQDNGDFVI | | QNGTGTILSS | | LSFDREQQST | | YTFQLKAVDG | | GVPPRSAYVG |
VTINVLDEND | | NAPYITAPSN | | TSHKLLTPQT | | RLGETVSQVA | | AEDFDSGVNA |
ELIYSIAGGN | | PYGLFQIGSH | | SGAITLEKEI | | ERRHHGLHRL | | VVKVSDRGKP |
PRYGTALVHL | | YVNETLANRT | | LLETLLGHSL | | DTPLDIDIAG | | DPEYERSKQR |
GNILFGVVAG | | VVAVALLIAL | | AVLVRYCRQR | | EAKSGYQAGK | | KETKDLYAPK |
PSGKASKGNK | | SKGKKSKSPK | | PVKPVEDEDE | | AGLQKSLKFN | | LMSDAPGDSP |
RIHLPLNYPP | | GSPDLGRHYR | | SNSPLPSIQL | | QPQSPSASKK | | HQVVQDLPPA |
NTFVGTGDTT | | STGSEQYSDY | | SYRTNPPKYP | | SKQVGQPFQL | | STPQPLPHPY |
HGAIWTEVWE |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8655 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q08174 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |