PCDHB3

Ідентифікатори

Символи

PCDHB3, PCDH-BETA3, protocadherin beta 3

Зовнішні ІД

OMIM: 606329 MGI: 2136737 HomoloGene: 115665 GeneCards: PCDHB3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана
Біологічний процес	• calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • synapse assembly • адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • chemical synaptic transmission
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56132


93874

Ensembl


ENSG00000113205


ENSMUSG00000045498

UniProt


Q9Y5E6


Q91XZ7

RefSeq (мРНК)


NM_018937


NM_053128

RefSeq (білок)


NP_061760


NP_444358

Локус (UCSC)

Хр. 5: 141.1 – 141.1 Mb

Хр. 18: 37.43 – 37.44 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCDHB3 (англ. Protocadherin beta 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 796 амінокислот, а молекулярна маса — 86 773^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEAGGERFLR	QRQVLLLFVF	LGGSLAGSES	RRYSVAEEKE	KGFLIANLAK
DLGLRVEELA	ARGAQVVSKG	NKQHFQLSHQ	TGDLLLNEKL	DREELCGPTE
PCILHFQILL	QNPLQFVTNE	LRIIDVNDHS	PVFFENEMHL	KILESTLPGT
VIPLGNAEDL	DVGRNSLQNY	TITPNSHFHV	LTRSRRDGRK	YPELVLDKAL
DREEQPELSL	TLTALDGGSP	PRSGTAQINI	QVLDINDNAP	EFAQPLYEVA
VLENTPVNSV	IVTVSASDLD	TGSFGTISYA	FFHASEEIRK	TFQLNPITGD
MQLVKYLNFE	AINSYEVDIE	AKDGGGLSGK	STVIVQVVDV	NDNPPELTLS
SVNSPIPENS	GETVLAVFSV	SDLDSGDNGR	VMCSIENNLP	FFLKPSVENF
YTLVSEGALD	RETRSEYNIT	ITITDLGTPR	LKTKYNITVL	VSDVNDNAPA
FTQISYTLFV	RENNSPALHI	GSVSATDRDS	GTNAQVTYSL	LPPQDPHLPL
SSLVSINADN	GHLFALRSLD	YEALQAFEFR	VGATDRGSPA	LSSEALVRVL
VLDANDNSPF	VLYPLQNGSA	PCTELVPRAA	EPGYLVTKVV	AVDGDSGQNA
WLSYQLLKAT	EPGLFGVWAH	NGEVRTARLL	SERDAAKHRL	VVLVKDNGEP
PRSATATLHV	LLVDGFSQPY	LPLPEAAPAQ	AQADLLTVYL	VVALASVSSL
FLFSVLLFVA	VRLCRRSRAA	SVGRCSVPEG	PFPGQMVDVS	GTGTLSQSYQ
YEVCLTGGSG	TNEFKFLKPI	IPNFVAQGAE	RVSEANPSFR	KSFEFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
Vanhalst K., Kools P., Vanden Eynde E., van Roy F. (2001). The human and murine protocadherin-beta one-exon gene families show high evolutionary conservation, despite the difference in gene number. FEBS Lett. 495: 120—125. PMID 11322959 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02372-9

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8688 (англ.) . Архів оригіналу за 30 жовтня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5E6 (англ.) . Архів оригіналу за 2 січня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.