PKP4 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PKP4, p0071, plakophilin 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604276 MGI: 109281 HomoloGene: 2689 GeneCards: PKP4 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cadherin binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • spindle pole • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • cell-cell contact zone • cell-cell junction • веретено поділу • Десмосома • міжклітинні контакти • midbody • spindle midzone • perinuclear region of cytoplasm • cytoplasmic side of plasma membrane • mitotic spindle • цитоскелет • cornified envelope • клітинна мембрана • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • cell-cell signaling • positive regulation of cytokinesis • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of cell adhesion • адгезія клітин • cell-cell junction assembly • keratinization • cornification • cell-cell adhesion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001005476 NM_001304969 NM_001304970 NM_001304971 NM_003628
| NM_001377218 NM_001377219 NM_001377220 NM_001377221 NM_001377222 NM_001377223 NM_001377224 NM_001377225 NM_001377226 |
| NM_026361 NM_175464 NM_001362990 NM_001362991 NM_001362992
| NM_001362993 NM_001362994 NM_001362995 NM_001362996 NM_001362997 NM_001362998 NM_001362999 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001005476 NP_001291898 NP_001291899 NP_001291900 NP_003619
| NP_001364147 NP_001364148 NP_001364149 NP_001364150 NP_001364151 NP_001364152 NP_001364153 NP_001364154 NP_001364155 |
| NP_080637 NP_780673 NP_001349919 NP_001349920 NP_001349921
| NP_001349922 NP_001349923 NP_001349924 NP_001349925 NP_001349926 NP_001349927 NP_001349928 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 158.46 – 158.68 Mb | Хр. 2: 59.16 – 59.36 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PKP4 (англ. Plakophilin 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 192 амінокислот, а молекулярна маса — 131 868[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPAPEQASLV | | EEGQPQTRQE | | AASTGPGMEP | | ETTATTILAS | | VKEQELQFQR |
LTRELEVERQ | | IVASQLERCR | | LGAESPSIAS | | TSSTEKSFPW | | RSTDVPNTGV |
SKPRVSDAVQ | | PNNYLIRTEP | | EQGTLYSPEQ | | TSLHESEGSL | | GNSRSSTQMN |
SYSDSGYQEA | | GSFHNSQNVS | | KADNRQQHSF | | IGSTNNHVVR | | NSRAEGQTLV |
QPSVANRAMR | | RVSSVPSRAQ | | SPSYVISTGV | | SPSRGSLRTS | | LGSGFGSPSV |
TDPRPLNPSA | | YSSTTLPAAR | | AASPYSQRPA | | SPTAIRRIGS | | VTSRQTSNPN |
GPTPQYQTTA | | RVGSPLTLTD | | AQTRVASPSQ | | GQVGSSSPKR | | SGMTAVPQHL |
GPSLQRTVHD | | MEQFGQQQYD | | IYERMVPPRP | | DSLTGLRSSY | | ASQHSQLGQD |
LRSAVSPDLH | | ITPIYEGRTY | | YSPVYRSPNH | | GTVELQGSQT | | ALYRTGSVGI |
GNLQRTSSQR | | STLTYQRNNY | | ALNTTATYAE | | PYRPIQYRVQ | | ECNYNRLQHA |
VPADDGTTRS | | PSIDSIQKDP | | REFAWRDPEL | | PEVIHMLQHQ | | FPSVQANAAA |
YLQHLCFGDN | | KVKMEVCRLG | | GIKHLVDLLD | | HRVLEVQKNA | | CGALRNLVFG |
KSTDENKIAM | | KNVGGIPALL | | RLLRKSIDAE | | VRELVTGVLW | | NLSSCDAVKM |
TIIRDALSTL | | TNTVIVPHSG | | WNNSSFDDDH | | KIKFQTSLVL | | RNTTGCLRNL |
SSAGEEARKQ | | MRSCEGLVDS | | LLYVIHTCVN | | TSDYDSKTVE | | NCVCTLRNLS |
YRLELEVPQA | | RLLGLNELDD | | LLGKESPSKD | | SEPSCWGKKK | | KKKKRTPQED |
QWDGVGPIPG | | LSKSPKGVEM | | LWHPSVVKPY | | LTLLAESSNP | | ATLEGSAGSL |
QNLSAGNWKF | | AAYIRAAVRK | | EKGLPILVEL | | LRMDNDRVVS | | SVATALRNMA |
LDVRNKELIG | | KYAMRDLVNR | | LPGGNGPSVL | | SDETMAAICC | | ALHEVTSKNM |
ENAKALADSG | | GIEKLVNITK | | GRGDRSSLKV | | VKAAAQVLNT | | LWQYRDLRSI |
YKKDGWNQNH | | FITPVSTLER | | DRFKSHPSLS | | TTNQQMSPII | | QSVGSTSSSP |
ALLGIRDPRS | | EYDRTQPPMQ | | YYNSQGDATH | | KGLYPGSSKP | | SPIYISSYSS |
PAREQNRRLQ | | HQQLYYSQDD | | SNRKNFDAYR | | LYLQSPHSYE | | DPYFDDRVHF |
PASTDYSTQY | | GLKSTTNYVD | | FYSTKRPSYR | | AEQYPGSPDS | | WV |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Stenzel N., Fetzer C.P., Heumann R., Erdmann K.S. (2009). PDZ-domain-directed basolateral targeting of the peripheral membrane protein FRMPD2 in epithelial cells. J. Cell Sci. 122: 3374—3384. PMID 19706687 DOI:10.1242/jcs.046854
- Hatzfeld M., Nachtsheim C. (1996). Cloning and characterization of a new armadillo family member, p0071, associated with the junctional plaque: evidence for a subfamily of closely related proteins. J. Cell Sci. 109: 2767—2778. PMID 8937994
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9026 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q99569 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |