POLD4

Ідентифікатори

Символи

POLD4, POLDS, p12, polymerase (DNA) delta 4, accessory subunit, DNA polymerase delta 4, accessory subunit

Зовнішні ІД

OMIM: 611525 MGI: 1916995 HomoloGene: 10909 GeneCards: POLD4

Реагує на сполуку

цитарабін, Флударабін, gemcitabine hydrochloride^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA-directed DNA polymerase activity
Клітинна компонента	• delta DNA polymerase complex • нуклеоплазма • ядерце • мітохондрія • гіалоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес	• DNA-dependent DNA replication • nucleotide-excision repair, DNA gap filling • DNA synthesis involved in DNA repair • translesion synthesis • transcription-coupled nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, DNA incision • telomere maintenance • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • telomere maintenance via semi-conservative replication • реплікація ДНК • DNA mismatch repair
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57804


69745

Ensembl


ENSG00000175482


ENSMUSG00000024854

UniProt


Q9HCU8


Q9CWP8

RefSeq (мРНК)


NM_001256870 NM_021173


NM_027196

RefSeq (білок)


NP_001243799 NP_066996


NP_081472

Локус (UCSC)

Хр. 11: 67.35 – 67.36 Mb

Хр. 19: 4.28 – 4.28 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

POLD4 (англ. DNA polymerase delta 4, accessory subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 107 амінокислот, а молекулярна маса — 12 433^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGRKRLITDS	YPVVKRREGP	AGHSKGELAP	ELGEEPQPRD	EEEAELELLR
QFDLAWQYGP	CTGITRLQRW	CRAKQMGLEP	PPEVWQVLKT	HPGDPRFQCS
LWHLYPL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Liu L., Mo J.-Y., Rodriguez-Belmonte E.M., Lee M.Y.W.T. (2000). Identification of a fourth subunit of mammalian DNA polymerase delta. J. Biol. Chem. 275: 18739—18744. PMID 10751307 DOI:10.1074/jbc.M001217200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Liu L., Rodriguez-Belmonte E.M., Mazloum N., Xie B., Lee M.Y.W.T. (2003). Identification of a novel protein, PDIP38, that interacts with the p50 subunit of DNA polymerase delta and proliferating cell nuclear antigen. J. Biol. Chem. 278: 10041—10047. PMID 12522211 DOI:10.1074/jbc.M208694200
Tsurimoto T., Shinozaki A., Yano M., Seki M., Enomoto T. (2005). Human Werner helicase interacting protein 1 (WRNIP1) functions as a novel modulator for DNA polymerase delta. Genes Cells. 10: 13—22. PMID 15670210 DOI:10.1111/j.1365-2443.2004.00812.x
Liu G., Warbrick E. (2006). The p66 and p12 subunits of DNA polymerase delta are modified by ubiquitin and ubiquitin-like proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 349: 360—366. PMID 16934752 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.08.049
Meng X., Zhou Y., Lee E.Y., Lee M.Y., Frick D.N. (2010). The p12 subunit of human polymerase delta modulates the rate and fidelity of DNA synthesis. Biochemistry. 49: 3545—3554. PMID 20334433 DOI:10.1021/bi100042b

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з DNA polymerase delta 4, accessory subunit переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14106 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9HCU8 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 8 вересня 2017.