PRKAB1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4CFE, 4CFF, 5EZV, 4ZHX,%%s4ZHX, 5EZV

Ідентифікатори

Символи

PRKAB1, AMPK, HAMPKb, protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 1

Зовнішні ІД

OMIM: 602740 MGI: 1336167 HomoloGene: 38160 GeneCards: PRKAB1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein kinase activity • AMP-activated protein kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • kinase activity
Клітинна компонента	• гіалоплазма • nucleotide-activated protein kinase complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex • цитоплазма
Біологічний процес	• protein heterooligomerization • lipid metabolism • fatty acid metabolic process • protein phosphorylation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • fatty acid biosynthetic process • GO:0048552 regulation of catalytic activity • macroautophagy • nail development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of cold-induced thermogenesis • regulation of macroautophagy • regulation of signal transduction by p53 class mediator • фосфорилювання
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5564


19079

Ensembl


ENSG00000111725


ENSMUSG00000029513

UniProt


Q9Y478


Q9R078

RefSeq (мРНК)


NM_006253


NM_031869

RefSeq (білок)


NP_006244 NP_006244.2


NP_114075

Локус (UCSC)

Хр. 12: 119.67 – 119.68 Mb

Хр. 5: 116.15 – 116.16 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PRKAB1 (англ. Protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот, а молекулярна маса — 30 382^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGNTSSERAA	LERHGGHKTP	RRDSSGGTKD	GDRPKILMDS	PEDADLFHSE
EIKAPEKEEF	LAWQHDLEVN	DKAPAQARPT	VFRWTGGGKE	VYLSGSFNNW
SKLPLTRSHN	NFVAILDLPE	GEHQYKFFVD	GQWTHDPSEP	IVTSQLGTVN
NIIQVKKTDF	EVFDALMVDS	QKCSDVSELS	SSPPGPYHQE	PYVCKPEERF
RAPPILPPHL	LQVILNKDTG	ISCDPALLPE	PNHVMLNHLY	ALSIKDGVMV
LSATHRYKKK	YVTTLLYKPI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм жирних кислот, метаболізм ліпідів, біосинтез жирних кислот, біосинтез ліпідів.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Towler M.C., Hardie D.G. (2007). AMP-activated protein kinase in metabolic control and insulin signaling. Circ. Res. 100: 328—341. PMID 17307971 DOI:10.1161/01.RES.0000256090.42690.05
Hardie D.G. (2007). AMP-activated/SNF1 protein kinases: conserved guardians of cellular energy. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 8: 774—785. PMID 17712357 DOI:10.1038/nrm2249

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9378 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y478 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.