PWP2

Ідентифікатори

Символи

PWP2, EHOC-17, PWP2H, UTP1, PWP2 periodic tryptophan protein homolog (yeast), small subunit processome component, PWP2 small subunit processome component

Зовнішні ІД

OMIM: 601475 MGI: 1341200 HomoloGene: 136786 GeneCards: PWP2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• snoRNA binding • RNA binding
Клітинна компонента	• Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome • клітинне ядро • ядерце • small-subunit processome • нуклеоплазма
Біологічний процес	• ribosomal small subunit assembly • maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • rRNA processing
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5822


110816

Ensembl


ENSG00000241945


ENSMUSG00000032834

UniProt


Q15269


Q8BU03

RefSeq (мРНК)


NM_005049


NM_029546

RefSeq (білок)


NP_005040


NP_083822

Локус (UCSC)

Хр. 21: 44.11 – 44.13 Mb

Хр. 10: 78.01 – 78.02 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PWP2 (англ. PWP2, small subunit processome component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 919 амінокислот, а молекулярна маса — 102 452^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKFAYRFSNL	LGTVYRRGNL	NFTCDGNSVI	SPVGNRVTVF	DLKNNKSDTL
PLATRYNVKC	VGLSPDGRLA	IIVDEGGDAL	LVSLVCRSVL	HHFHFKGSVH
SVSFSPDGRK	FVVTKGNIAQ	MYHAPGKKRE	FNAFVLDKTY	FGPYDETTCI
DWTDDSRCFV	VGSKDMSTWV	FGAERWDNLI	YYALGGHKDA	IVACFFESNS
LDLYSLSQDG	VLCMWQCDTP	PEGLRLKPPA	GWKADLLQRE	EEEEEEEDQE
GDRETTIRGK	ATPAEEEKTG	KVKYSRLAKY	FFNKEGDFNN	LTAAAFHKKS
HLLVTGFASG	IFHLHELPEF	NLIHSLSISD	QSIASVAINS	SGDWIAFGCS
GLGQLLVWEW	QSESYVLKQQ	GHFNSMVALA	YSPDGQYIVT	GGDDGKVKVW
NTLSGFCFVT	FTEHSSGVTG	VTFTATGYVV	VTSSMDGTVR	AFDLHRYRNF
RTFTSPRPTQ	FSCVAVDASG	EIVSAGAQDS	FEIFVWSMQT	GRLLDVLSGH
EGPISGLCFN	PMKSVLASAS	WDKTVRLWDM	FDSWRTKETL	ALTSDALAVT
FRPDGAELAV	ATLNSQITFW	DPENAVQTGS	IEGRHDLKTG	RKELDKITAK
HAAKGKAFTA	LCYSADGHSI	LAGGMSKFVC	IYHVREQILM	KRFEISCNLS
LDAMEEFLNR	RKMTEFGNLA	LIDQDAGQED	GVAIPLPGVR	KGDMSSRHFK
PEIRVTSLRF	SPTGRCWAAT	TTEGLLIYSL	DTRVLFDPFE	LDTSVTPGRV
REALRQQDFT	RAILMALRLN	ESKLVQEALE	AVPRGEIEVV	TSSLPELYVE
KVLEFLASSF	EVSRHLEFYL	LWTHKLLMLH	GQKLKSRAGT	LLPVIQFLQK
SIQRHLDDLS	KLCSWNHYNM	QYALAVSKQR	GTKRSLDPLG	SEEEAEASED
DSLHLLGGGG	RDSEEEMLA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Локалізований у ядрі.

Література

Lalioti M.D., Chen H., Rossier C., Reid J.D., Antonarakis S.E. (1996). Cloning the cDNA of human PWP2, which encodes a protein with WD repeats and maps to 21q22.3. Genomics. 35: 321—327. PMID 8661145 DOI:10.1006/geno.1996.0363
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yamakawa K., Gao D.-Q., Korenberg J.R. (1996). A periodic tryptophan protein 2 gene homologue (PWP2H) in the candidate region of progressive myoclonus epilepsy on 21q22.3. Cytogenet. Cell Genet. 74: 140—145. PMID 8893822

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9711 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15269 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.