PXN

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2O9V, 2VZD, 2VZG, 2VZI, 3GM1, 3PY7, 3U3F, 4EDN, 1OW6, 1OW7, 1OW8, 3RQE, 3RQF, 3RQG, 4XGZ, 4XH2

Ідентифікатори

Символи

PXN, entrez:5829, paxillin

Зовнішні ІД

OMIM: 602505 MGI: 108295 HomoloGene: 37697 GeneCards: PXN

Онтологія гена
Молекулярна функція	• beta-catenin binding • vinculin binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • зв'язування з іоном металу • integrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • ubiquitin protein ligase binding • neuropilin binding • protein phosphatase binding • GO:0001104 transcription coregulator activity
Клітинна компонента	• focal adhesion • клітинна мембрана • stress fiber • microtubule associated complex • міжклітинні контакти • cell cortex • цитоскелет • lamellipodium • цитоплазма • гіалоплазма • Адгезивні контакти
Біологічний процес	• м'язове скорочення • epidermal growth factor receptor signaling pathway • signal complex assembly • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • адгезія клітин • growth hormone receptor signaling pathway • cell-matrix adhesion • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • response to peptide • endothelial cell migration • positive regulation of stress fiber assembly • substrate adhesion-dependent cell spreading • regulation of nucleic acid-templated transcription
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5829


19303

Ensembl


ENSG00000089159


ENSMUSG00000029528

UniProt


P49023


Q8VI36

RefSeq (мРНК)

NM_001080855 NM_001243756 NM_002859 NM_025157 NM_001385981
NM_001385982 NM_001385983 NM_001385984 NM_001385985 NM_001385986 NM_001385987 NM_001385988 NM_001385989 NM_001385990


NM_011223 NM_133915

RefSeq (білок)


NP_001074324 NP_001230685 NP_002850 NP_079433

NP_035353 NP_598676 NP_001389995 NP_001389996 NP_001389997
NP_001389998 NP_001389999

Локус (UCSC)

Хр. 12: 120.21 – 120.27 Mb

Хр. 5: 115.64 – 115.69 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PXN (англ. Paxillin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 591 амінокислот, а молекулярна маса — 64 505^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDDLDALLAD	LESTTSHISK	RPVFLSEETP	YSYPTGNHTY	QEIAVPPPVP
PPPSSEALNG	TILDPLDQWQ	PSSSRFIHQQ	PQSSSPVYGS	SAKTSSVSNP
QDSVGSPCSR	VGEEEHVYSF	PNKQKSAEPS	PTVMSTSLGS	NLSELDRLLL
ELNAVQHNPP	GFPADEANSS	PPLPGALSPL	YGVPETNSPL	GGKAGPLTKE
KPKRNGGRGL	EDVRPSVESL	LDELESSVPS	PVPAITVNQG	EMSSPQRVTS
TQQQTRISAS	SATRELDELM	ASLSDFKIQG	LEQRADGERC	WAAGWPRDGG
RSSPGGQDEG	GFMAQGKTGS	SSPPGGPPKP	GSQLDSMLGS	LQSDLNKLGV
ATVAKGVCGA	CKKPIAGQVV	TAMGKTWHPE	HFVCTHCQEE	IGSRNFFERD
GQPYCEKDYH	NLFSPRCYYC	NGPILDKVVT	ALDRTWHPEH	FFCAQCGAFF
GPEGFHEKDG	KAYCRKDYFD	MFAPKCGGCA	RAILENYISA	LNTLWHPECF
VCRECFTPFV	NGSFFEHDGQ	PYCEVHYHER	RGSLCSGCQK	PITGRCITAM
AKKFHPEHFV	CAFCLKQLNK	GTFKEQNDKP	YCQNCFLKLF	C

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах.

Література

Mazaki Y., Hashimoto S., Sabe H. (1997). Monocyte cells and cancer cells express novel paxillin isoforms with different binding properties to focal adhesion proteins. J. Biol. Chem. 272: 7437—7444. PMID 9054445 DOI:10.1074/jbc.272.11.7437
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ebrahimnejad A., Flayeh R., Unteregger G., Wagener C., Bruemmer J. (2000). Cell adhesion molecule CEACAM1 associates with paxillin in granulocytes and epithelial and endothelial cells. Exp. Cell Res. 260: 365—373. PMID 11035932 DOI:10.1006/excr.2000.5026
Zhao Z.-S., Manser E., Loo T.-H., Lim L. (2000). Coupling of PAK-interacting exchange factor PIX to GIT1 promotes focal complex disassembly. Mol. Cell. Biol. 20: 6354—6363. PMID 10938112 DOI:10.1128/MCB.20.17.6354-6363.2000
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Miller S.L., Antico G., Raghunath P.N., Tomaszewski J.E., Clevenger C.V. (2007). Nek3 kinase regulates prolactin-mediated cytoskeletal reorganization and motility of breast cancer cells. Oncogene. 26: 4668—4678. PMID 17297458 DOI:10.1038/sj.onc.1210264

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9718 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P49023 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.