RAB18

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1X3S

Ідентифікатори

Символи

RAB18, RAB18LI1, WARBM3, member RAS oncogene family

Зовнішні ІД

OMIM: 602207 MGI: 102790 HomoloGene: 40765 GeneCards: RAB18

Пов'язані генетичні захворювання

Warburg micro syndrome 3, Warburg micro syndrome^[1]

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GDP binding • GO:0006184 GTPase activity
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний • мембрана • endoplasmic reticulum tubular network • гіалоплазма • endoplasmic reticulum membrane • клітинна мембрана • secretory granule membrane • комплекс Ґольджі • синапс
Біологічний процес	• розвиток ока • protein transport • multicellular organism development • endoplasmic reticulum tubular network organization • brain development • lipid droplet organization • neutrophil degranulation • small GTPase mediated signal transduction • import into nucleus • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


22931


19330

Ensembl


ENSG00000099246


ENSMUSG00000073639

UniProt


Q9NP72


P35293

RefSeq (мРНК)


NM_001256410 NM_001256411 NM_001256412 NM_001256415 NM_021252


NM_001278447 NM_181070

RefSeq (білок)


NP_001243339 NP_001243340 NP_001243341 NP_001243344 NP_067075


NP_001265376 NP_851415

Локус (UCSC)

Хр. 10: 27.5 – 27.54 Mb

Хр. 18: 6.73 – 6.79 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RAB18 (англ. RAB18, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 206 амінокислот, а молекулярна маса — 22 977^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDEDVLTTLK	ILIIGESGVG	KSSLLLRFTD	DTFDPELAAT	IGVDFKVKTI
SVDGNKAKLA	IWDTAGQERF	RTLTPSYYRG	AQGVILVYDV	TRRDTFVKLD
NWLNELETYC	TRNDIVNMLV	GNKIDKENRE	VDRNEGLKFA	RKHSMLFIEA
SAKTCDGVQC	AFEELVEKII	QTPGLWESEN	QNKGVKLSHR	EEGQGGGACG
GYCSVL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Schaefer U., Seibold S., Schneider A., Neugebauer E. (2000). Isolation and characterisation of the human rab18 gene after stimulation of endothelial cells with histamine. FEBS Lett. 466: 148—154. PMID 10648831 DOI:10.1016/S0014-5793(99)01778-0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з RAB18 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з RAB18, member RAS oncogene family переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14244 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NP72 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.