RSL1D1

Ідентифікатори

Символи

RSL1D1, CSIG, PBK1, UTP30, L12, ribosomal L1 domain containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 615874 MGI: 1913659 HomoloGene: 41052 GeneCards: RSL1D1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cadherin binding • RNA binding • mRNA 3'-UTR binding • mRNA 5'-UTR binding
Клітинна компонента	• ядерце • мембрана • клітинне ядро • cytosolic large ribosomal subunit • 90S preribosome
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process • regulation of cellular senescence • osteoblast differentiation • regulation of protein localization • Біосинтез білків • maturation of LSU-rRNA
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


26156


66409

Ensembl


ENSG00000171490


ENSMUSG00000005846

UniProt


O76021


Q8BVY0

RefSeq (мРНК)


NM_015659


NM_025546

RefSeq (білок)


NP_056474


NP_079822

Локус (UCSC)

Хр. 16: 11.83 – 11.85 Mb

Хр. 16: 11.01 – 11.02 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RSL1D1 (англ. Ribosomal L1 domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 490 амінокислот, а молекулярна маса — 54 973^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEDSASASLS	SAAATGTSTS	TPAAPTARKQ	LDKEQVRKAV	DALLTHCKSR
KNNYGLLLNE	NESLFLMVVL	WKIPSKELRV	RLTLPHSIRS	DSEDICLFTK
DEPNSTPEKT	EQFYRKLLNK	HGIKTVSQII	SLQTLKKEYK	SYEAKLRLLS
SFDFFLTDAR	IRRLLPSLIG	RHFYQRKKVP	VSVNLLSKNL	SREINDCIGG
TVLNISKSGS	CSAIRIGHVG	MQIEHIIENI	VAVTKGLSEK	LPEKWESVKL
LFVKTEKSAA	LPIFSSFVSN	WDEATKRSLL	NKKKKEARRK	RRERNFEKQK
ERKKKRQQAR	KTASVLSKDD	VAPESGDTTV	KKPESKKEQT	PEHGKKKRGR
GKAQVKATNE	SEDEIPQLVP	IGKKTPANEK	VEIQKHATGK	KSPAKSPNPS
TPRGKKRKAL	PASETPKAAE	SETPGKSPEK	KPKIKEEAVK	EKSPSLGKKD
ARQTPKKPEA	KFFTTPSKSV	RKASHTPKKW	PKKPKVPQST

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Huch G., Hohn H.-P., Denker H.-W. (1998). Identification of differentially expressed genes in human trophoblast cells by DDRT-PCR. Placenta. 19: 557—567. PMID 9859858 DOI:10.1016/S0143-4004(98)90015-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24534 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, O76021 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.