SETD6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3QXY, 3RC0

Ідентифікатори

Символи

SETD6, SET domain containing 6, SET domain containing 6, protein lysine methyltransferase

Зовнішні ІД

OMIM: 616424 MGI: 1913333 HomoloGene: 38743 GeneCards: SETD6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • NF-kappaB binding • protein-lysine N-methyltransferase activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• stem cell population maintenance • histone lysine methylation • Метилювання • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • peptidyl-lysine monomethylation • stem cell differentiation • regulation of inflammatory response
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


79918


66083

Ensembl


ENSG00000103037


ENSMUSG00000031671

UniProt


Q8TBK2


Q9CWY3

RefSeq (мРНК)


NM_001160305 NM_024860


NM_001035123

RefSeq (білок)


NP_001153777 NP_079136


NP_001030295 NP_001355283

Локус (UCSC)

Хр. 16: 58.52 – 58.52 Mb

Хр. 8: 95.72 – 95.72 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SETD6 (англ. SET domain containing 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 473 амінокислот, а молекулярна маса — 53 189^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATQAKRPRV	AGPVDGGDLD	PVACFLSWCR	RVGLELSPKV	SERAGGRRTR
GGARAALTSP	PAQVAVSRQG	TVAGYGMVAR	ESVQAGELLF	VVPRAALLSQ
HTCSIGGLLE	RERVALQSQS	GWVPLLLALL	HELQAPASRW	RPYFALWPEL
GRLEHPMFWP	EEERRCLLQG	TGVPEAVEKD	LANIRSEYQS	IVLPFMEAHP
DLFSLRVRSL	ELYHQLVALV	MAYSFQEPLE	EEEDEKEPNS	PVMVPAADIL
NHLANHNANL	EYSANCLRMV	ATQPIPKGHE	IFNTYGQMAN	WQLIHMYGFV
EPYPDNTDDT	ADIQMVTVRE	AALQGTKTEA	ERHLVYERWD	FLCKLEMVGE
EGAFVIGREE	VLTEEELTTT	LKVLCMPAEE	FRELKDQDGG	GDDKREEGSL
TITNIPKLKA	SWRQLLQNSV	LLTLQTYATD	LKTDQGLLSN	KEVYAKLSWR
EQQALQVRYG	QKMILHQLLE	LTS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26116 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8TBK2 (англ.) . Архів оригіналу за 29 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.