SLC27A6

Ідентифікатори

Символи

SLC27A6, ACSVL2, FACVL2, FATP6, VLCS-H1, solute carrier family 27 member 6

Зовнішні ІД

OMIM: 604196 MGI: 3036230 HomoloGene: 38385 GeneCards: SLC27A6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• long-chain fatty acid-CoA ligase activity • nucleotide binding • very long-chain fatty acid-CoA ligase activity • каталітична активність • ligase activity • GO:0015246 fatty acid transmembrane transporter activity • GO:0005325 long-chain fatty acid transporter activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • Сарколема • мембрана
Біологічний процес	• обмін речовин • very long-chain fatty acid metabolic process • lipid transport • fatty acid transport • fatty acid metabolic process • lipid metabolism • long-chain fatty acid transport • long-chain fatty acid metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


28965


225579

Ensembl


ENSG00000113396


ENSMUSG00000024600

UniProt


Q9Y2P4


E9Q9W4

RefSeq (мРНК)


NM_001017372 NM_014031 NM_001317984


NM_001081072

RefSeq (білок)


NP_001017372 NP_001304913 NP_054750


NP_001074541

Локус (UCSC)

Хр. 5: 128.54 – 129.03 Mb

Хр. 18: 58.69 – 58.75 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SLC27A6 (англ. Solute carrier family 27 member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 619 амінокислот, а молекулярна маса — 70 112^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLLSWLTVLG	AGMVVLHFLQ	KLLFPYFWDD	FWFVLKVVLI	IIRLKKYEKR
GELVTVLDKF	LSHAKRQPRK	PFIIYEGDIY	TYQDVDKRSS	RVAHVFLNHS
SLKKGDTVAL	LMSNEPDFVH	VWFGLAKLGC	VVAFLNTNIR	SNSLLNCIRA
CGPRALVVGA	DLLGTVEEIL	PSLSENISVW	GMKDSVPQGV	ISLKEKLSTS
PDEPVPRSHH	VVSLLKSTCL	YIFTSGTTGL	PKAAVISQLQ	VLRGSAVLWA
FGCTAHDIVY	ITLPLYHSSA	AILGISGCVE	LGATCVLKKK	FSASQFWSDC
KKYDVTVFQY	IGELCRYLCK	QSKREGEKDH	KVRLAIGNGI	RSDVWREFLD
RFGNIKVCEL	YAATESSISF	MNYTGRIGAI	GRTNLFYKLL	STFDLIKYDF
QKDEPMRNEQ	GWCIHVKKGE	PGLLISRVNA	KNPFFGYAGP	YKHTKDKLLC
DVFKKGDVYL	NTGDLIVQDQ	DNFLYFWDRT	GDTFRWKGEN	VATTEVADVI
GMLDFIQEAN	VYGVAISGYE	GRAGMASIIL	KPNTSLDLEK	VYEQVVTFLP
AYACPRFLRI	QEKMEATGTF	KLLKHQLVED	GFNPLKISEP	LYFMDNLKKS
YVLLTRELYD	QIMLGEIKL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до лігаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм жирних кислот, метаболізм ліпідів, транспорт, транспорт ліпідів, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11000 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y2P4 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.