SNRPD3 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1D3B, 3CW1, 3PGW, 3VRI, 4PJO, 4WZJ, 3JCR | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SNRPD3, SMD3, Sm-D3, small nuclear ribonucleoprotein D3 polypeptide |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601062 MGI: 1914582 HomoloGene: 3078 GeneCards: SNRPD3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • histone pre-mRNA DCP binding • U2 snRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • U7 snRNA binding • telomerase RNA binding • U1 snRNP binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • SMN-Sm protein complex • гіалоплазма • prespliceosome • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal tri-snRNP complex • U5 snRNP • U12-type spliceosomal complex • U2 snRNP • нуклеоплазма • methylosome • U7 snRNP • precatalytic spliceosome • small nuclear ribonucleoprotein complex • pICln-Sm protein complex • telomerase holoenzyme complex • spliceosomal complex • commitment complex • U4 snRNP • екзосома • клітинне ядро • U1 snRNP • цитоплазма • ядерні тільця • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • U2-type precatalytic spliceosome • U2-type catalytic step 2 spliceosome |
---|
Біологічний процес | • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • mRNA processing • spliceosomal complex assembly • Сплайсинг РНК • histone mRNA metabolic process • Метилювання білків • import into nucleus • spliceosomal snRNP assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 24.56 – 24.58 Mb | Хр. 10: 75.35 – 75.37 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SNRPD3 (англ. Small nuclear ribonucleoprotein D3 polypeptide) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 126 амінокислот, а молекулярна маса — 13 916[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSIGVPIKVL | | HEAEGHIVTC | | ETNTGEVYRG | | KLIEAEDNMN | | CQMSNITVTY |
RDGRVAQLEQ | | VYIRGSKIRF | | LILPDMLKNA | | PMLKSMKNKN | | QGSGAGRGKA |
AILKAQVAAR | | GRGRGMGRGN | | IFQKRR |
Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Lehmeier T., Raker V., Hermann H., Luehrmann R. (1994). cDNA cloning of the Sm proteins D2 and D3 from human small nuclear ribonucleoproteins: evidence for a direct D1-D2 interaction. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 12317—12321. PMID 7527560 DOI:10.1073/pnas.91.25.12317
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Pillai R.S., Will C.L., Luehrmann R., Schuemperli D., Mueller B. (2001). Purified U7 snRNPs lack the Sm proteins D1 and D2 but contain Lsm10, a new 14 kDa Sm D1-like protein. EMBO J. 20: 5470—5479. PMID 11574479 DOI:10.1093/emboj/20.19.5470
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
- Pomeranz Krummel D.A., Oubridge C., Leung A.K., Li J., Nagai K. (2009). Crystal structure of human spliceosomal U1 snRNP at 5.5 A resolution. Nature. 458: 475—480. PMID 19325628 DOI:10.1038/nature07851
- Leung A.K., Nagai K., Li J. (2011). Structure of the spliceosomal U4 snRNP core domain and its implication for snRNP biogenesis. Nature. 473: 536—539. PMID 21516107 DOI:10.1038/nature09956
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11160 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P62318 (англ.) . Архів оригіналу за 19 жовтня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |