SPEF1

SPEF1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2EE7

Ідентифікатори
Символи SPEF1, C20orf28, CLAMP, SPEF1A, sperm flagellar 1
Зовнішні ІД OMIM: 610674 MGI: 3513546 HomoloGene: 15741 GeneCards: SPEF1
Онтологія гена
Молекулярна функція

• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• microtubule binding
• молекулярна функція

Клітинна компонента

• цитоплазма
• GO:0035085 Аксонема
• cell projection
• motile cilium
• війка
• цитоскелет
• компонент клітини

Біологічний процес

• negative regulation of microtubule depolymerization
• cell migration
• GO:0022610 життєдіяльність
• cilium-dependent cell motility
• regulation of cytoskeleton organization

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
25876
70997
Ensembl
ENSG00000101222
ENSMUSG00000027329
UniProt
Q9Y4P9
Q99JL1
RefSeq (мРНК)
NM_015417
NM_027641
RefSeq (білок)
NP_056232
NP_081917
Локус (UCSC) Хр. 20: 3.78 – 3.78 Mb Хр. 2: 131.01 – 131.03 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SPEF1 (англ. Sperm flagellar 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 236 амінокислот, а молекулярна маса — 26 987[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MASSVDEEALHQLYLWVDNIPLSRPKRNLSRDFSDGVLVAEVIKFYFPKM
VEMHNYVPANSLQQKLSNWGHLNRKVLKRLNFSVPDDVMRKIAQCAPGVV
ELVLIPLRQRLEERQRRRKQGAGSLQELAPQDGSGYMDVGVSQKARGEGV
PDPQGGGQLSWDRPPAPRPPAYNRALQGDPSFVLQIAEKEQELLASQETV
QVLQMKVRRLEHLLQLKNVRIEDLSRRLQQAERKQR

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, війках.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Chan S.W., Fowler K.J., Choo K.H.A., Kalitsis P. (2005). Spef1, a conserved novel testis protein found in mouse sperm flagella. Gene. 353: 189—199. PMID 15979255 DOI:10.1016/j.gene.2005.04.025

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15874 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. ↑ UniProt, Q9Y4P9 (англ.) . Архів оригіналу за 5 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 20
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.