TGFA

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1GK5, 1MOX, 1YUF, 1YUG, 2TGF, 3E50, 3TGF, 4TGF

Ідентифікатори

Символи

TGFA, TFGA, transforming growth factor alpha, Transforming growth factor - α

Зовнішні ІД

OMIM: 190170 MGI: 98724 HomoloGene: 2431 GeneCards: TGFA

Онтологія гена
Молекулярна функція	• epidermal growth factor receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • growth factor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • cell surface • basolateral plasma membrane • perinuclear region of cytoplasm • ER to Golgi transport vesicle membrane • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • Golgi membrane • міжклітинний простір • clathrin-coated vesicle membrane
Біологічний процес	• positive regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity • positive regulation of epithelial cell proliferation • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • COPII vesicle coating • проліферація • positive regulation of mitotic nuclear division • positive regulation of cell division • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • epidermal growth factor receptor signaling pathway • positive regulation of cell population proliferation • MAPK cascade • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • positive regulation of protein kinase B signaling • membrane organization • GO:0007243 intracellular signal transduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7039


21802

Ensembl


ENSG00000163235


ENSMUSG00000029999

UniProt


P01135


P48030

RefSeq (мРНК)


NM_001099691 NM_001308158 NM_001308159 NM_003236


NM_031199

RefSeq (білок)


NP_001093161 NP_001295087 NP_001295088 NP_003227


NP_112476 NP_001390047

Локус (UCSC)

Хр. 2: 70.45 – 70.55 Mb

Хр. 6: 86.17 – 86.25 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TGFA (англ. Transforming growth factor alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 160 амінокислот, а молекулярна маса — 17 006^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVPSAGQLAL	FALGIVLAAC	QALENSTSPL	SADPPVAAAV	VSHFNDCPDS
HTQFCFHGTC	RFLVQEDKPA	CVCHSGYVGA	RCEHADLLAV	VAASQKKQAI
TALVVVSIVA	LAVLIITCVL	IHCCQVRKHC	EWCRALICRH	EKPSALLKGR
TACCHSETVV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до факторів росту, мітогенів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Derynck R., Roberts A.B., Winkler M.E., Chen E.Y., Goeddel D.V. (1984). Human transforming growth factor-alpha: precursor structure and expression in E. coli. Cell. 38: 287—297. PMID 6088071 DOI:10.1016/0092-8674(84)90550-6
Jakowlew S.B., Kondaiah P., Dillard P.J., Sporn M.B., Roberts A.B. (1988). A novel low molecular weight ribonucleic acid (RNA) related to transforming growth factor alpha messenger RNA. Mol. Endocrinol. 2: 1056—1063. PMID 2464748 DOI:10.1210/mend-2-11-1056
Qian J.F., Lazar-Wesley E., Breugnot C., May E. (1993). Human transforming growth factor alpha: sequence analysis of the 4.5-kb and 1.6-kb mRNA species. Gene. 132: 291—296. PMID 8224876 DOI:10.1016/0378-1119(93)90210-T
Xu X., Liao J., Creek K.E., Pirisi L. (1999). Human keratinocytes and tumor-derived cell lines express alternatively spliced forms of transforming growth factor-alpha mRNA, encoding precursors lacking carboxyl-terminal valine residues. Oncogene. 18: 5554—5562. PMID 10523832 DOI:10.1038/sj.onc.1203091
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jakobovits E.B., Schlokat U., Vannice J.L., Derynck R., Levinson A.D. (1988). The human transforming growth factor alpha promoter directs transcription initiation from a single site in the absence of a TATA sequence. Mol. Cell. Biol. 8: 5549—5554. PMID 2907605 DOI:10.1128/MCB.8.12.5549

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11765 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, P01135 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.