TIMP3 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TIMP3, HSMRK222, K222, K222TA2, SFD, TIMP metallopeptidase inhibitor 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 188826 MGI: 98754 HomoloGene: 36322 GeneCards: TIMP3 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Sorsby's fundus dystrophy[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • peptidase inhibitor activity • GO:0048551 enzyme inhibitor activity • зв'язування з іоном металу • protease binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • metalloendopeptidase inhibitor activity |
---|
Клітинна компонента | • GO:0005578 Позаклітинна матриця • базальна мембрана • екзосома • клітинне ядро • extracellular region • platelet dense granule lumen • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • cellular response to organic substance • negative regulation of peptidase activity • відповідь на стимул • positive regulation of TRAIL-activated apoptotic signaling pathway • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • negative regulation of membrane protein ectodomain proteolysis • зір • platelet degranulation • response to organic substance • negative regulation of metalloendopeptidase activity • response to hormone • negative regulation of endopeptidase activity • response to cytokine |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 32.8 – 32.86 Mb | Хр. 10: 86.14 – 86.19 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TIMP3 (англ. TIMP metallopeptidase inhibitor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 211 амінокислот, а молекулярна маса — 24 145[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTPWLGLIVL | | LGSWSLGDWG | | AEACTCSPSH | | PQDAFCNSDI | | VIRAKVVGKK |
LVKEGPFGTL | | VYTIKQMKMY | | RGFTKMPHVQ | | YIHTEASESL | | CGLKLEVNKY |
QYLLTGRVYD | | GKMYTGLCNF | | VERWDQLTLS | | QRKGLNYRYH | | LGCNCKIKSC |
YYLPCFVTSK | | NECLWTDMLS | | NFGYPGYQSK | | HYACIRQKGG | | YCSWYRGWAP |
PDKSIINATD | | P |
Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів металоферментів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Silbiger S.M., Jacobsen V.L., Cupples R.L., Koski R.A. (1994). Cloning of cDNAs encoding human TIMP-3, a novel member of the tissue inhibitor of metalloproteinase family. Gene. 141: 293—297. PMID 8163205 DOI:10.1016/0378-1119(94)90588-6
- Stoehr H., Roomp K., Felbor U., Weber B.H.F. (1995). Genomic organization of the human tissue inhibitor of metalloproteinases-3 (TIMP3). Genome Res. 5: 483—487. PMID 8808469 DOI:10.1101/gr.5.5.483
- Ruiz A.C., Brett P., Bok D. (1996). TIMP-3 is expressed in the human retinal pigment epithelium. Biochem. Biophys. Res. Commun. 226: 467—474. PMID 8806658 DOI:10.1006/bbrc.1996.1379
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Apte S.S., Mattei M.-G., Olsen B.R. (1994). Cloning of the cDNA encoding human tissue inhibitor of metalloproteinases-3 (TIMP-3) and mapping of the TIMP3 gene to chromosome 22. Genomics. 19: 86—90. PMID 8188246 DOI:10.1006/geno.1994.1016
- Kishnani N.S., Staskus P.W., Yang T.-T., Masiarz F.R., Hawkes S.P. (1995). Identification and characterization of human tissue inhibitor of metalloproteinase-3 and detection of three additional metalloproteinase inhibitor activities in extracellular matrix. Matrix Biol. 14: 479—488. PMID 7795886 DOI:10.1016/0945-053X(95)90005-5
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TIMP3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11822 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P35625 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |