TSC22D1

Ідентифікатори

Символи

TSC22D1, Ptg-2, TGFB1I4, TSC22, TSC22 domain family member 1

Зовнішні ІД

OMIM: 607715 MGI: 109127 HomoloGene: 7573 GeneCards: TSC22D1

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8848


21807

Ensembl


ENSG00000102804


ENSMUSG00000022010

UniProt


Q15714


P62500

RefSeq (мРНК)


NM_001243797 NM_001243798 NM_001243799 NM_006022 NM_183422


NM_001177751 NM_009366 NM_207652 NM_001310646 NM_001310647

RefSeq (білок)


NP_001230726 NP_001230727 NP_001230728 NP_006013 NP_904358


NP_001171222 NP_001297575 NP_001297576 NP_033392 NP_997535

Локус (UCSC)

Хр. 13: 44.43 – 44.58 Mb

Хр. 14: 76.65 – 76.75 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TSC22D1 (англ. TSC22 domain family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 073 амінокислот, а молекулярна маса — 109 677^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MHQPPESTAA	AAAAADISAR	KMAHPAMFPR	RGSGSGSASA	LNAAGTGVGS
NATSSEDFPP	PSLLQPPPPA	ASSTSGPQPP	PPQSLNLLSQ	AQLQAQPLAP
GGTQMKKKSG	FQITSVTPAQ	ISASISSNNS	IAEDTESYDD	LDESHTEDLS
SSEILDVSLS	RATDLGEPER	SSSEETLNNF	QEAETPGAVS	PNQPHLPQPH
LPHLPQQNVV	INGNAHPHHL	HHHHQIHHGH	HLQHGHHHPS	HVAVASASIT
GGPPSSPVSR	KLSTTGSSDS	ITPVAPTSAV	SSSGSPASVM	TNMRAPSTTG
GIGINSVTGT	STVNNVNITA	VGSFNPNVTS	SMLGNVNIST	SNIPSAAGVS
VGPGVTSGVN	VNILSGMGNG	TISSSAAVSS	VPNAAAGMTG	GSVSSQQQQP
TVNTSRFRVV	KLDSSSEPFK	KGRWTCTEFY	EKENAVPATE	GVLINKVVET
VKQNPIEVTS	ERESTSGSSV	SSSVSTLSHY	TESVGSGEMG	APTVVVQQQQ
QQQQQQQQQP	ALQGVTLQQM	DFGSTGPQSI	PAVSIPQSIS	QSQISQVQLQ
SQELSYQQKQ	GLQPVPLQAT	MSAATGIQPS	PVNVVGVTSA	LGQQPSISSL
AQPQLPYSQA	APPVQTPLPG	APPPQQLQYG	QQQPMVSTQM	APGHVKSVTQ
NPASEYVQQQ	PILQTAMSSG	QPSSAGVGAG	TTVIPVAQPQ	GIQLPVQPTA
VPAQPAGASV	QPVGQAPAAV	SAVPTGSQIA	NIGQQANIPT	AVQQPSTQVP
PSVIQQGAPP	SSQVVPPAQT	GIIHQGVQTS	APSLPQQLVI	ASQSSLLTVP
PQPQGVEPVA	QGIVSQQLPA	VSSLPSASSI	SVTSQVSSTG	PSGMPSAPTN
LVPPQNIAQT	PATQNGNLVQ	SVSQPPLIAT	NTNLPLAQQI	PLSSTQFSAQ
SLAQAIGSQI	EDARRAAEPS	LVGLPQTISG	DSGGMSAVSD	GSSSSLAASA
SLFPLKVLPL	TTPLVDGEDE	SSSGASVVAI	DNKIEQAMDL	VKSHLMYAVR
EEVEVLKEQI	KELIEKNSQL	EQENNLLKTL	ASPEQLAQFQ	AQLQTGSPPA
TTQPQGTTQP	PAQPASQGSG	PTA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Ohta S., Shimekake Y., Nagata K. (1996). Molecular cloning and characterization of a transcription factor for the C-type natriuretic peptide gene promoter. Eur. J. Biochem. 242: 460—466. PMID 9022669 DOI:10.1111/j.1432-1033.1996.460rr.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kester H.A., Blanchetot C., den Hertog J., van der Saag P.T., van der Burg B. (1999). Transforming growth factor-beta-stimulated clone-22 is a member of a family of leucine zipper proteins that can homo- and heterodimerize and has transcriptional repressor activity. J. Biol. Chem. 274: 27439—27447. PMID 10488076 DOI:10.1074/jbc.274.39.27439
Dmitrenko V.V., Garifulin O.M., Shostak E.A., Smikodub A.I., Kavsan V.M. (1996). The characteristics of different types of mRNA expressed in the human brain. Cyt. Genet. 30: 41—47. PMID 9026990

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TSC22D1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16826 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15714 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.