USP40

Ідентифікатори

Символи

USP40, ubiquitin specific peptidase 40

Зовнішні ІД

OMIM: 610570 MGI: 2443184 HomoloGene: 32400 GeneCards: USP40

Онтологія гена
Молекулярна функція	• thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • cysteine-type endopeptidase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес	• protein deubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • regulation of protein stability
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55230


227334

Ensembl


ENSG00000085982


ENSMUSG00000005501

UniProt


Q9NVE5


Q8BWR4

RefSeq (мРНК)


NM_018218 NM_001365479


NM_001033291 NM_001198573

RefSeq (білок)

NP_060688 NP_001352408 NP_001369224 NP_001369225 NP_001369226
NP_001369227 NP_001369228 NP_001369229 NP_001369230 NP_001369231 NP_001369232


NP_001028463 NP_001185502

Локус (UCSC)

Хр. 2: 233.48 – 233.57 Mb

Хр. 1: 87.95 – 88.01 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

USP40 (англ. Ubiquitin specific peptidase 40) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 235 амінокислот, а молекулярна маса — 140 130^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFGDLFEEEY	STVSNNQYGK	GKKLKTKALE	PPAPREFTNL	SGIRNQGGTC
YLNSLLQTLH	FTPEFREALF	SLGPEELGLF	EDKDKPDAKV	RIIPLQLQRL
FAQLLLLDQE	AASTADLTDS	FGWTSNEEMR	QHDVQELNRI	LFSALETSLV
GTSGHDLIYR	LYHGTIVNQI	VCKECKNVSE	RQEDFLDLTV	AVKNVSGLED
ALWNMYVEEE	VFDCDNLYHC	GTCDRLVKAA	KSAKLRKLPP	FLTVSLLRFN
FDFVKCERYK	ETSCYTFPLR	INLKPFCEQS	ELDDLEYIYD	LFSVIIHKGG
CYGGHYHVYI	KDVDHLGNWQ	FQEEKSKPDV	NLKDLQSEEE	IDHPLMILKA
ILLEENNLIP	VDQLGQKLLK	KIGISWNKKY	RKQHGPLRKF	LQLHSQIFLL
SSDESTVRLL	KNSSLQAESD	FQRNDQQIFK	MLPPESPGLN	NSISCPHWFD
INDSKVQPIR	EKDIEQQFQG	KESAYMLFYR	KSQLQRPPEA	RANPRYGVPC
HLLNEMDAAN	IELQTKRAEC	DSANNTFELH	LHLGPQYHFF	NGALHPVVSQ
TESVWDLTFD	KRKTLGDLRQ	SIFQLLEFWE	GDMVLSVAKL	VPAGLHIYQS
LGGDELTLCE	TEIADGEDIF	VWNGVEVGGV	HIQTGIDCEP	LLLNVLHLDT
SSDGEKCCQV	IESPHVFPAN	AEVGTVLTAL	AIPAGVIFIN	SAGCPGGEGW
TAIPKEDMRK	TFREQGLRNG	SSILIQDSHD	DNSLLTKEEK	WVTSMNEIDW
LHVKNLCQLE	SEEKQVKISA	TVNTMVFDIR	IKAIKELKLM	KELADNSCLR
PIDRNGKLLC	PVPDSYTLKE	AELKMGSSLG	LCLGKAPSSS	QLFLFFAMGS
DVQPGTEMEI	VVEETISVRD	CLKLMLKKSG	LQGDAWHLRK	MDWCYEAGEP
LCEEDATLKE	LLICSGDTLL	LIEGQLPPLG	FLKVPIWWYQ	LQGPSGHWES
HQDQTNCTSS	WGRVWRATSS	QGASGNEPAQ	VSLLYLGDIE	ISEDATLAEL
KSQAMTLPPF	LEFGVPSPAH	LRAWTVERKR	PGRLLRTDRQ	PLREYKLGRR
IEICLEPLQK	GENLGPQDVL	LRTQVRIPGE	RTYAPALDLV	WNAAQGGTAG
SLRQRVADFY	RLPVEKIEIA	KYFPEKFEWL	PISSWNQQIT	KRKKKKKQDY
LQGAPYYLKD	GDTIGVKNLL	IDDDDDFSTI	RDDTGKEKQK	QRALGRRKSQ
EALHEQSSYI	LSSAETPARP	RAPETSLSIH	VGSFR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20069 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9NVE5 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2016. Процитовано 29 серпня 2017.