人類冠狀病毒OC43

人類冠狀病毒OC43
病毒分類 编辑
(未分级) 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 正核糖病毒界 Orthornavirae
门: 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲: 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目: 套式病毒目 Nidovirales
科: 冠状病毒科 Coronaviridae
属: 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus
种:
人類冠狀病毒OC43 Betacoronavirus 1
病毒
人類冠狀病毒OC43 Human coronavirus OC43

人類冠狀病毒OC43Human coronavirus OC43、HCoV-OC43)是乙型冠狀病毒屬的一種病毒,與同屬的人類冠狀病毒HKU1以及甲型冠狀病毒屬人類冠狀病毒NL63人類冠狀病毒229E同為能感染人類呼吸道、造成普通感冒的四種冠狀病毒[1],於1967年從感冒病患的鼻咽分泌物中被分離發現[2],是第二個被發現能感染人類的冠狀病毒。

乙型冠狀病毒屬中,人類冠狀病毒OC43與猪凝血性脑脊髓炎病毒(Porcine Hemagglutinating Encephalomyelitis Virus、PHEV)和牛冠狀病毒的關係較為接近[3],這些病毒被國際病毒分類委員會歸為同種,合稱乙型冠狀病毒1型Betacoronavirus 1[4]。乙型冠狀病毒屬1型的病毒皆以9-O-乙酰基唾液酸(9-O-acetylated sialic acids、9-O-Ac-Sias)為受體感染細胞[5]

基因組

人類冠狀病毒OC43為正鏈單股RNA病毒,具有外膜,其基因組長約30700nt,編碼冠狀病毒皆有的複製酶(1a/1b)和刺突蛋白(S)、膜蛋白(M)、外膜蛋白(E)與衣殼蛋白(N)等四種結構蛋白,此外在複製酶與刺突蛋白的開放閱讀框(ORF)中間有編碼血凝素酯酶英语hemagglutinin esterase(HE)與一輔助蛋白ns2的ORF,且在刺突蛋白與外膜蛋白的ORF間有另一編碼輔助蛋白ns12.9的ORF,牛冠狀病毒在此區尚有編碼另一輔助蛋白ns4.9的ORF,但OC43病毒該區序列發生了缺失而闕如;另外OC43病毒的衣殼蛋白開放閱讀框中有Ia與Ib兩個較小的ORF,而牛冠狀病毒在此處則是具有一個完整的ORF[6]

演化

刺突蛋白序列的分子鐘分析顯示OC43病毒與牛冠狀病毒約於1890年左右從共同祖先分家,有學者提出假說指當時爆發的流感疫情可能即是OC43病毒引起,而非流感病毒所致[6]。OC43病毒與牛冠狀病毒雖序列相似度高達96.6%,但無證據顯示OC43病毒可感染牛隻,亦無證據顯示牛冠狀病毒可感染人類。乙型冠狀病毒屬1型的多數病毒可同時以表面的刺突蛋白(S)和血凝素酯酶(HE)結合宿主細胞表面的唾液酸,隨後血凝素酯酶可將唾液酸分解,進而造成感染,但OC43病毒演化的過程中,血凝素酯酶和唾液酸的結合能力漸喪失,僅以刺突蛋白結合唾液酸,此結合模式的改變又造成前者分解唾液酸的能力亦大幅受限,這種現象可能是OC43病毒對人類呼吸道環境的適應機制,而受體結合模式的差異也造成不同病毒間跨物種感染的困難。同屬的另一種冠狀病毒人類冠狀病毒HKU1也有此現象[7]

人類冠狀病毒OC43傳統上可分為A–E五種基因型,其中1967年最早發現的株系VR759為A型,D型為B型與C型產生,E型為B型、C型與D型重組產生[2]。2017年又有研究人員發表了此病毒兩種新的基因型F型與G型[8]

感染

人類冠狀病毒OC43與另外三種造成普通感冒的冠狀病毒一樣,一般僅感染上呼吸道,潛伏期為2–5天,症狀與人類冠狀病毒229E的感染相同,包括身體不適、頭痛、流鼻水與喉嚨痛等,有10%–20%的病患會出現咳嗽發燒的症狀[2]。另外有一些報導指此病毒可能可感染神經組織,例如感染老鼠的神經組織造成腦炎,並可造成人類神經元細胞株英语Immortalised cell line的感染。2016年,一名患病毒性腦炎而病逝的十一個月大男童腦組織中檢測出了此病毒[9][10]

參考

參考文獻

  1. ^ Human Coronavirus Types. Centers for Disease Control and Prevention. 2020-02-15 [2020-03-25]. (原始内容存档于2020-02-04). 
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 Su, Shuo; Wong, Gary; Shi, Weifeng; Liu, Jun; Lai, Alexander C.K.; Zhou, Jiyong; Liu, Wenjun; Bi, Yuhai; Gao, George F. Epidemiology, Genetic Recombination, and Pathogenesis of Coronaviruses. Trends in Microbiology. 2016, 24 (6): 490–502. ISSN 0966-842X. doi:10.1016/j.tim.2016.03.003. 
  3. ^ Vijgen, L.; Keyaerts, E.; Lemey, P.; Maes, P.; Van Reeth, K.; Nauwynck, H.; Pensaert, M.; Van Ranst, M. Evolutionary History of the Closely Related Group 2 Coronaviruses: Porcine Hemagglutinating Encephalomyelitis Virus, Bovine Coronavirus, and Human Coronavirus OC43. Journal of Virology. 2006, 80 (14): 7270–7274. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.02675-05. 
  4. ^ Carstens, E. B. Ratification vote on taxonomic proposals to the International Committee on Taxonomy of Viruses (2009). Archives of Virology. 2009, 155 (1): 133–146. ISSN 0304-8608. doi:10.1007/s00705-009-0547-x. 
  5. ^ Li, Fang. Structure, Function, and Evolution of Coronavirus Spike Proteins. Annual Review of Virology. 2016, 3 (1): 237–261. ISSN 2327-056X. doi:10.1146/annurev-virology-110615-042301. 
  6. ^ 6.0 6.1 Vijgen, L.; Keyaerts, E.; Moes, E.; Thoelen, I.; Wollants, E.; Lemey, P.; Vandamme, A.-M.; Van Ranst, M. Complete Genomic Sequence of Human Coronavirus OC43: Molecular Clock Analysis Suggests a Relatively Recent Zoonotic Coronavirus Transmission Event. Journal of Virology. 2005, 79 (3): 1595–1604. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.79.3.1595-1604.2005. 
  7. ^ Bakkers, Mark J.G.; Lang, Yifei; Feitsma, Louris J.; Hulswit, Ruben J.G.; de Poot, Stefanie A.H.; van Vliet, Arno L.W.; Margine, Irina; de Groot-Mijnes, Jolanda D.F.; van Kuppeveld, Frank J.M.; Langereis, Martijn A.; Huizinga, Eric G.; de Groot, Raoul J. Betacoronavirus Adaptation to Humans Involved Progressive Loss of Hemagglutinin-Esterase Lectin Activity. Cell Host & Microbe. 2017, 21 (3): 356–366. ISSN 1931-3128. doi:10.1016/j.chom.2017.02.008. 
  8. ^ Oong, Xiang Yong; Ng, Kim Tien; Takebe, Yutaka; Ng, Liang Jie; Chan, Kok Gan; Chook, Jack Bee; Kamarulzaman, Adeeba; Tee, Kok Keng. Identification and evolutionary dynamics of two novel human coronavirus OC43 genotypes associated with acute respiratory infections: phylogenetic, spatiotemporal and transmission network analyses. Emerging Microbes & Infections. 2017, 6 (1): 1–13. ISSN 2222-1751. doi:10.1038/emi.2016.132. 
  9. ^ Morfopoulou, Sofia; Brown, Julianne R.; Davies, E. Graham; Anderson, Glenn; Virasami, Alex; Qasim, Waseem; Chong, Wui K.; Hubank, Michael; Plagnol, Vincent; Desforges, Marc; Jacques, Thomas S.; Talbot, Pierre J.; Breuer, Judith. Human Coronavirus OC43 Associated with Fatal Encephalitis. New England Journal of Medicine. 2016, 375 (5): 497–498. ISSN 0028-4793. doi:10.1056/NEJMc1509458. 
  10. ^ Kenneth McIntosh. Coronaviruses. UpToDate. 2020-02-18 [2020-03-28]. (原始内容存档于2021-02-07). 
 
甲型冠狀病毒屬
(α-CoV)
甲型冠狀病毒1型
甲型冠狀病毒2型
雪貂冠狀病毒(FRECV · FRSCV) · 水鼬冠狀病毒(MCoV)
229E病毒
人類冠狀病毒229E(HCoV-229E) · 羊駝冠狀病毒(ACoV) · 單峰駱駝229E樣冠狀病毒 · 蝙蝠229E樣冠狀病毒
NL63病毒
人類冠狀病毒NL63(HCoV-NL63) · NL63相關蝙蝠冠狀病毒英语NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b
長翼蝠冠狀病毒HKU8(Bat-CoV HKU8) · 長翼蝠冠狀病毒1型(Bat-CoV 1A/1B) · 褐扁顱蝠冠狀病毒HKU33(Tr-BatCoV HKU33)
蝙蝠冠狀病毒HKU10(Bat-CoV HKU10) · 马铁菊头蝠甲型冠状病毒HuB-2013英语Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013 · 中華菊頭蝠冠狀病毒HKU32(Rs-BatCoV HKU32) · 蝙蝠冠狀病毒CDPHE15(BatCoV CDPHE15) · 高頭蝠冠狀病毒512(Sc-BatCoV-512) · 猪流行性腹泻病毒(PEDV)
其他
鼩鼱冠狀病毒T14(Sa-CoV T14) · 文成鼩鼱病毒(WESV) · 鹿城褐家鼠冠状病毒(LRNV)
乙型冠狀病毒屬
(β-CoV)
Embecovirus英语Embecovirus
(支系A)
乙型冠狀病毒1型(β1CoV)
牛冠狀病毒(BCoV) · 人類冠狀病毒OC43(HCoV-OC43) · 馬冠狀病毒(ECoV) · 豬凝血性腦脊髓炎病毒(PHEV) · 犬呼吸道冠狀病毒(CRCoV)
兔冠狀病毒HKU14(RbCoV HKU14) · 黃鼠冠狀病毒HKU24(ChRCoV HKU24) · 龍泉黑線姬鼠冠狀病毒(LAMV)
鼠冠狀病毒(M-CoV)
鼠肝炎病毒(MHV) · 大鼠冠狀病毒(RCoV)(大鼠涎淚腺炎病毒SDAV · 帕克RCoV)
人類冠狀病毒HKU1(HCoV-HKU1) · 龍泉羅賽鼠冠狀病毒(LRLV)
Merbecovirus英语Merbecovirus
(支系C)
刺蝟冠狀病毒(EriCoV) · 東北刺蝟冠狀病毒HKU31(Ea-HedCoV HKU31) · 扁颅蝠冠状病毒HKU4(Bat-CoV HKU4) · 伏翼蝠冠状病毒HKU5(Bat-CoV HKU5) · 中東呼吸綜合症冠狀病毒(MERS-CoV) · 祖魯棕蝠冠狀病毒(NeoCoV) · 灰伏翼冠狀病毒HKU25(Hp-BatCoV HKU25)
Nobecovirus英语Nobecovirus(支系D)
果蝠冠状病毒GCCDC1(Ro-BatCoV GCCDC1) · 果蝠冠状病毒HKU9(Ro-BatCoV HKU9)
Hibecovirus英语Hibecovirus                            
普氏蹄蝠冠狀病毒ZJ013(BtHp-BetaCoV/ZJ2013)
Sarbecovirus(支系B)                            
SARS-CoV-1 · SARS-CoV-2 · 变种 · 蝙蝠SARSr-CoV(詳见Template:SARSr-CoV)
丙型冠状病毒属
(γ-CoV)
Cegacovirus
鯨豚冠狀病毒(白鯨冠狀病毒SW1 · 瓶鼻海豚冠狀病毒HKU22)
Brangacovirus英语Brangacovirus
Igacovirus英语Igacovirus
禽冠狀病毒(傳染性支氣管炎病毒) · 禽冠狀病毒9203(火雞冠狀病毒)
丁型冠狀病毒屬
(δ-CoV)
鵯冠狀病毒HKU11(BuCoV HKU11) · 鶇冠狀病毒HKU12(ThCoV HKU12) · 文鳥冠狀病毒HKU13英语Munia coronavirus HKU13(MuCoV HKU13) · 猪丁型冠状病毒(PdCV) · 繡眼冠狀病毒HKU16英语White-eye coronavirus HKU16(WeCoV HKU16) · 麻雀冠狀病毒HKU17(SpCoV HKU17) · 鵲鴝冠狀病毒HKU18(MRCoV HKU18) · 夜鷺冠狀病毒HKU19 · 鴨冠狀病毒HKU20(WiCoV HKU20) · 紅冠水雞冠狀病毒HKU21英语Common moorhen coronavirus HKU21(CMCoV HKU21) · 隼冠狀病毒HKU27(FalCoV UAE-HKU27) · 翎頜鴇冠狀病毒HKU28(HouCoV UAE-HKU28) · 鴿冠狀病毒HKU29(PiCoV UAE-HKU29) · 鵪鶉冠狀病毒HKU30(QuaCoV UAE-HKU30)
 
分類單元識別碼