细胞色素P450

细胞色素P450
细胞色素P450氧化酶(CYP2C9)
鑑定
標誌p450
PfamPF00067(旧版)
InterPro英语InterProIPR001128
PROSITE英语PROSITEPDOC00081
SCOP英语Structural Classification of Proteins2cpp / SUPFAM
OPM英语Orientations of Proteins in Membranes database家族41
OPM英语Orientations of Proteins in Membranes database蛋白1w0f
現有可用的蛋白結構:
Pfam結構(旧版) / ECOD
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum英语PDBsum結構概要
PDB1akd, 1bu7, 1bvy, 1c8j, 1cl6, 1cmj, 1cmn, 1cp4, 1cpt, 1dt6, 1dz4, 1dz6, 1dz8, 1dz9, 1e9x, 1ea1, 1egy, 1ehe, 1ehf, 1ehg, 1eup, 1f24, 1f25, 1f26, 1f4t, 1f4u, 1fag, 1fah, 1geb, 1ged, 1gei, 1gej, 1gek, 1gem, 1gjm, 1gwi, 1h5z, 1io7, 1io8, 1io9, 1iwi, 1iwj, 1iwk, 1izo, 1j51, 1jfb, 1jfc, 1jin, 1jio, 1jip, 1jme, 1jpz, 1k2o, 1lfk, 1lg9, 1lgf, 1lwl, 1mpw, 1n40, 1n4g, 1n6b, 1n97, 1noo, 1nr6, 1o76, 1odo, 1og2, 1og5, 1oxa, 1p0v, 1p0w, 1p0x, 1p2y, 1p7r, 1pha, 1phb, 1phc, 1phd, 1phe, 1phf, 1phg, 1pkf, 1po5, 1pq2, 1q5d, 1q5e, 1qmq, 1r9o, 1re9, 1rf9, 1rom, 1s1f, 1se6, 1smi, 1smj, 1suo, 1t85, 1t86, 1t87, 1t88, 1t93, 1tqn, 1u13, 1ue8, 1ued, 1ulw, 1uyu, 1w0e, 1w0f, 1w0g, 1wiy, 1x8v, 1xqd, 1yqo, 1yqp, 1yrc, 1yrd, 1z10, 1z11, 1z8o, 1z8p, 1z8q, 1zo4, 1zo9, 1zoa, 2a1m, 2a1n, 2a1o, 2bdm, 2bmh, 2bvj, 2bz9, 2c6h, 2c7x, 2ca0, 2cd8, 2ci0, 2cib, 2cp4, 2cpp, 2d09, 2d0e, 2dkk, 2f9q, 2fdu, 2fdv, 2fdw, 2fdy, 2fe6, 2fer, 2feu, 2frz, 2gqx, 2gr6, 2h7q, 2h7r, 2h7s, 2hpd, 2ij2, 2ij3, 2ij4, 2ij5, 2ij7, 2j0d, 2j1m, 2j4s, 2nnb, 2nnh, 2nni, 2nnj, 2nz5, 2nza, 2p85, 2pg5, 2pg6, 2pg7, 2q6n, 2qbl, 2qbm, 2qbn, 2qbo, 2rfb, 2rfc, 2rom, 2uwh, 2v0m, 2vku, 2vn0, 2z36, 2z3t, 2z3u, 2z97, 2zaw, 2zax, 2zbx, 2zby, 2zbz, 3ben, 3buj, 3c6g, 3cp4, 3cpp, 3czh, 3dl9, 4cp4, 4cpp, 5cp4, 5cpp, 6cp4, 6cpp, 7cpp, 8cpp

细胞色素P450[1](英語:cytochrome P450,缩写 CYP)是包含血基質(heme)作为辅因子的一个庞大的酶超家族,具单加氧酶功能[2][3][4]。在哺乳动物中,这些蛋白质氧化类固醇脂肪酸异生物质英语Xenobiotic(外源化学物),对多种化合物的清除英语Clearance (pharmacology),以及激素的合成和分解都很重要。在植物中,这些蛋白质对于防御性化合物脂肪酸激素的生物合成很重要[3]

CYP酶已在所有生命界中被发现:动物植物真菌原生生物细菌古菌以及病毒[5]。 但是,它们并不是无处不在。 例如,在大肠杆菌中尚未发现它们[4][6] 。 已知有超过50,000种不同的CYP蛋白[7]

CYP通常是电子转移链中的末端氧化,大致可归类为含P450的系统英语P450-containing systems(P450-containing systems)。 术语“ P450”是从处于还原状态并与一氧化碳络合的酶的最大特征吸收波长(450 nm)处的分光光度的峰值而得名P450。 大多数CYP都需要蛋白质伴侣来传递一个或多个电子以还原(并且最终还原分子)。

大多数细胞色素P450酶的功能是催化氧化有机化合物。细胞色素P450的受質包括有:如脂质類固醇激素的代谢中间产物,亦有药物与其他毒性化学物质等非生物物质。细胞色素P450类是涉及肝臟药物代谢与生物激活作用的主要酶类,约占到各种代谢反应总数的75%。

由细胞色素P450催化的最常见反应就是单加氧酶反应,例如将氧气中的一个氧原子插入到有机底物(以RH表示)中,而另一个氧原子被还原形成水:

RH + O2 + 2H+ + 2e → ROH + H2O

在P450催化循环。左下角的“Fe(V)中间体”是一种简化:它是带有自由基血红素配体的Fe(IV)。
类固醇生成(Steroidogenesis),显示出细胞色素P450酶执行的许多酶活性[8] 。 HSD:羟基类固醇脱氢酶。

酶活检测

混合探针底物法

该方法可以通过检测非那西丁 O- 脱乙基( CYP1A2) 、 甲苯磺丁脲甲基羟基化( CYP2C9) 、 奥美拉唑 5- 羟基化(CYP2C19) 、 右美沙芬 O- 脱甲基化( CYP2D6) 和咪达唑仑 1'- 羟基化( CYP3A4) 的反应产物确定细胞色素P450 酶的活性。[9]

抑制剂

抑制剂强度分级规则

细胞色素P450 酶的抑制剂强度分级规则[10]如下:

  1. IC50 <1 μmol·L-1为强抑制剂
  2. 1μmol·L-1< IC50 <10μmol·L-1 为中等强度抑制剂
  3. 10 μmol·L-1< IC50 <100 μmol·L-1 为弱抑制剂
  4. IC50 >100 μmol·L-1 ,在临床上产生明显酶抑制作用的可能性较小

相关抑制剂

参见 CYP1A2CYP2C9CYP2C19CYP2D6CYP3A4

细胞色素P450利用氧反弹机制英语Oxygen rebound mechanism,通过“化合物I”(与血红素阳离子结合的铁(IV)氧化物)的作用将碳氢化合物转化为醇。

參見

参考文献

  1. ^ 汉语推荐使用规范名词,“细胞色素P450/cytochrome P450/一类以还原态与CO结合后在波长450nm处有吸收峰的含血红素的单链蛋白质”[1] (页面存档备份,存于互联网档案馆),全国科学技术名词审定委员会
  2. ^ Gonzalez FJ, Gelboin HV. Human cytochromes P450: evolution and cDNA-directed expression. Environmental Health Perspectives. November 1992, 98: 81–5. PMC 1519618可免费查阅. PMID 1486867. doi:10.1289/ehp.929881. 
  3. ^ 3.0 3.1 Cytochrome P450. InterPro. [2020-06-07]. (原始内容存档于2013-05-14). 
  4. ^ 4.0 4.1 Danielson PB. The cytochrome P450 superfamily: biochemistry, evolution and drug metabolism in humans. Current Drug Metabolism. December 2002, 3 (6): 561–97. PMID 12369887. doi:10.2174/1389200023337054. 
  5. ^ Lamb DC, Lei L, Warrilow AG, Lepesheva GI, Mullins JG, Waterman MR, Kelly SL. The first virally encoded cytochrome p450. Journal of Virology. August 2009, 83 (16): 8266–9. PMC 2715754可免费查阅. PMID 19515774. doi:10.1128/JVI.00289-09. 
  6. ^ Sigel R, Sigel A, Sigel H. The Ubiquitous Roles of Cytochrome P450 Proteins: Metal Ions in Life Sciences. New York: Wiley. 2007. ISBN 978-0-470-01672-5. 
  7. ^ Nelson D. Cytochrome P450 Homepage. Human Genomics (University of Tennessee). 2009, 4 (1): 59–65 [2014-11-13]. PMC 3500189可免费查阅. PMID 19951895. doi:10.1186/1479-7364-4-1-59. (原始内容存档于2010-06-27). 
  8. ^ Häggström, Mikael; Richfield, David. Diagram of the pathways of human steroidogenesis. WikiJournal of Medicine. 2014, 1 (1). ISSN 2002-4436. doi:10.15347/wjm/2014.005可免费查阅. 
  9. ^ 郭喻,汪晖. 人细胞色素 P450 同工酶探针底物特异性的研究进展[J]. 中国药理学通报, 2007, 23( 7) : 851 -4.
  10. ^ Parmentier Y,Bossant M J,Bertrand M,et al. In vitro studies of drug metabolism[M]/ / Testa B,van de Waterbeemd H. Comprehensive Medicinal Chemistry Ⅱ - ADME- Tox Approaches. Beijing:Science Press, 2007: 246.

外部連結

  • Degtyarenko K. Directory of P450-containing Systems. International Centre for Genetic Engineering and Biotechnology英语International Centre for Genetic Engineering and Biotechnology. 2009-01-09 [2009-02-10]. (原始内容存档于2016-07-16). 
  • Estabrook R. A passion for P450s (remembrances of the early history of research on cytochrome P450). Drug Metab Dispos. 2003, 31 (12): 1461–73. PMID 14625342. doi:10.1124/dmd.31.12.1461. 
  • Feyereisen R. The Insect P450 Site. Institut National de la Recherche Agronomique. 2005-12-19 [2009-02-10]. (原始内容存档于2014-05-30). 
  • Flockhart DA. Cytochrome P450 drug interaction table. Indiana University-Purdue University Indianapolis. 2007 [2009-02-10]. (原始内容存档于2007-08-30). 
  • Fowler L, Mercer A. Cytochrome P450 Animated Tutorial. School of Pharmacy, London. [2009-02-10]. (原始内容存档于2016-05-17). 
  • Preissner S. Cytochrome P450 database. Nucleic Acids Research. 2010. (原始内容存档于2011-11-03). 
  • Sim SC. Human Cytochrome P450 (CYP) Allele Nomenclature Committee. Karolinska Institutet. 2008-09-04 [2009-02-10]. (原始内容存档于2009-02-08). 
  • Hazai E. Cytochrome P450 enzyme-substrate selectivity prediction. 2012-02-12. (原始内容存档于2011-02-15). 
  • Performance of P450 inhibition Studies (页面存档备份,存于互联网档案馆) The performance of in vitro cytochrome P450 inhibition studies studies including analysis of the data.
  • DDI Regulatory Guidance (页面存档备份,存于互联网档案馆) Request a guide to drug-drug interaction regulatory recommendations.
  • Expanding the toolbox of cytochrome P450s through enzyme engineering (页面存档备份,存于互联网档案馆) Video by the Turner Group, University of Manchester, UK
蛋白质血红素蛋白英语Hemeprotein
珠蛋白
亚基
16号染色体上的
α亚基等:
  • α
    • HBA1
    • HBA2英语HBA2
  • ζ
    • HBZ英语HBZ
  • θ
    • HBQ1英语HBQ1
  • μ
    • HBM英语Mu hemoglobin
11號染色體上的
β亚基等英语Human β-globin locus:
  • β
    • HBB英语HBB
  • δ
    • HBD英语HBD
  • γ
    • HBG1英语HBG1
    • HBG2英语HBG2
  • ε
    • HBE1英语HBE1
发育阶段: HbA英语Hemoglobin A2β2) · HbA2英语Hemoglobin A22δ2) · HbF/Fetal英语Fetal hemoglobin2γ2) · HbE Gower 1英语Embryonic hemoglobin2ε2) · HbE Gower 2英语Embryonic hemoglobin2ε2)
病理状态: HbH英语Hemoglobin H4) · HbS2βS2) · HbC英语Hemoglobin C2βC2)
组成
碳氧血红蛋白 · 氨甲酰血红蛋白英语Carbaminohemoglobin · 氧合血红蛋白/去氧血红蛋白 · 硫血红蛋白
人类其他
非人类
血绿蛋白 · 无脊椎动物血红蛋白英语Erythrocruorin
其他
人类: 肌红蛋白正铁肌红蛋白 · 神经珠蛋白 · 细胞球蛋白英语Cytoglobin
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其他
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细胞色素加氧酶:细胞色素P450(EC 1.14)
CYP1
  • A1英语CYP1A1
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  • B1英语CYP1B1
CYP2
  • A6英语CYP2A6
  • A7英语CYP2A7
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CYP3
  • CYP3A英语CYP3A
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CYP4
  • A11英语CYP4A11
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  • F3英语CYP4F3
  • F8英语CYP4F8
  • F11英语CYP4F11
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CYP5-20
  • CYP5 (A1英语Thromboxane-A synthase)
  • CYP6 (G1)
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  • CYP11 (A1B1英语Steroid 11-beta-hydroxylaseB2英语Aldosterone synthaseB3)
  • CYP17 (A1)
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  • CYP20 (A1英语CYP20A1)
CYP21-49
  • CYP21 (A2英语21-Hydroxylase)
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CYP51-69
CYP101-281
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CYP301-499
  • CYP305M2
  • 萬聖節基因英语Halloween genesCYP302A1CYP306A1CYP307A1CYP307A2CYP314A1英语Ecdysone 20-monooxygenaseCYP315A1