CLEC7A

CLEC7A
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2BPD, 2BPE, 2BPH, 2CL8

Идентификаторы
ПсевдонимыCLEC7A, BGR, CANDF4, CLECSF12, DECTIN1, CD369, SCARE2, C-type lectin domain family 7 member A, C-type lectin domain containing 7A
Внешние IDOMIM: 606264 MGI: 1861431 HomoloGene: 49606 GeneCards: CLEC7A
Расположение гена (человек)
12-я хромосома человека
Хр.12-я хромосома человека[1]
12-я хромосома человека
Расположение в геноме CLEC7A
Расположение в геноме CLEC7A
Локус12p13.2Начало10,116,777 bp[1]
Конец10,130,258 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
6-я хромосома мыши
Хр.6-я хромосома мыши[2]
6-я хромосома мыши
Расположение в геноме CLEC7A
Расположение в геноме CLEC7A
Локус6|6 F3Начало129,438,554 bp[2]
Конец129,449,742 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • upper lobe of left lung
Наибольшая экспрессия в
  • right lung lobe

  • mucous cell of stomach

  • subcutaneous adipose tissue
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • MHC protein binding
  • pattern recognition receptor activity
  • связывание с ионом металла
  • связывание с белками плазмы
  • связывание углеводов
Компонент клетки
  • цитоплазма
  • часть мембраны
  • intracellular membrane-bounded organelle
  • мембрана
  • клеточная мембрана
  • нуклеоплазма
Биологический процесс
  • cell recognition
  • immune system process
  • carbohydrate mediated signaling
  • phagocytosis, recognition
  • воспалительная реакция
  • T cell activation
  • defense response to protozoan
  • pattern recognition receptor signaling pathway
  • врождённый иммунитет
  • positive regulation of protein-containing complex assembly
  • positive regulation of interleukin-1 beta production
  • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
  • positive regulation of phagocytosis
  • positive regulation of killing of cells of other organism
  • positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

64581

56644

Ensembl

ENSG00000172243

ENSMUSG00000079293

UniProt

Q9BXN2

V9GXI5

RefSeq (мРНК)
NM_022570
NM_197947
NM_197948
NM_197949
NM_197950

NM_197951
NM_197952
NM_197953
NM_197954

NM_020008
NM_001309637

RefSeq (белок)
NP_072092
NP_922938
NP_922939
NP_922940
NP_922941

NP_922945

NP_001296566
NP_064392

Локус (UCSC)Chr 12: 10.12 – 10.13 MbChr 6: 129.44 – 129.45 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

CLEC7A (англ. C-type lectin domain family 7 member A, лектин С-типа домен семейство 7 член A; CD369), или дектин-1 (англ. Dectin-1) — мембранный белок семейства лектинов типа С. Продукт гена человека CLEC7A[5].

Структура

CLEC7A состоит из 247 аминокислот, молекулярная масса 27,6 кДа. Содержит лектиновый домен типа C и активирующий ITAM-подобный мотив.

Функции

CLEC7A является мембранным белком 2-го типа из семейства лектинов типа С. Внеклеточный лектиновый домен распознаёт β-1,3- и β-1,6-связанные глюканы и, таким образом, служит как рецептор опознавания паттерна глюканов растительного и грибкового происхождения. Участвует во врождённом иммунитете. Связывание лиганда приводит к стимулированию переноса сигнала, опосредованного ITAM-мотивом. CLEC7A может индуцировать как Syk-зависимый, так и Syk-независимый сигнальные пути. Димеризация белка приводит к фосфорилированию киназ семейства Src и рекрутированию тирозинкиназы Syk, которая активирует фактор транскрипции NF-κB. NF-κB отвечает за синтез множества воспалительных цитокинов и хемокинов, включая TNF, IL-23, IL-6, IL-2. Кроме воспалительной реакции это приводит к оксидативному стрессу, образованию метаболитов арахидоновой кислоты, созреванию дендритных клеток и фагоцитозу лиганда[6][7].

Противогрибковый иммунитет

CLEC7A распознаёт виды нескольких родов грибков, включая Saccharomyces, Candida, Pneumocystis, Coccidioides, Penicillium и другие. Распознавание этих патогенов вызывает такие защитные реакции, как фагоцитоз и окислительный стресс, а также образование противогрибковых цито- и хемокинов (TNF, CXCL2, IL-1b, IL-1a, CCL3, GM-CSF, G-CSF и IL-6) и развитие Т-хелперов 17.[7]

Ко-стимулирующая молекула

CLEC7A может играть роль ко-стимулирующей молекулы путём распознавания лиганда на поверхности T-лимфоцитов, что приводит к клеточной активации и пролиферации. Дектин-1 также связывает CD4+ и CD8+ T-клетки.[7]

Тканевая специфичность

Белок экспрессирован на дендритных клетках, моноцитах, макрофагах и B-лимфоцитах[5].

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000172243 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000079293 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. 1 2 Entrez Gene: CLEC7A C-type lectin domain family 7, member A  (неопр.).
  6. Drummond R.A., Brown G.D. The role of Dectin-1 in the host defence against fungal infections. (англ.) // Curr Opin Microbiol : journal. — 2011. — Vol. 14, no. 4. — P. 392—399. — doi:10.1016/j.mib.2011.07.001. — PMID 21803640.
  7. 1 2 3 Huysamen C., Brown G.D. The fungal pattern recognition receptor, Dectin-1, and the associated cluster of C-type lectin-like receptors. (англ.) // FEMS Microbiol Lett : journal. — 2009. — Vol. 290, no. 2. — P. 121—128. — doi:10.1111/j.1574-6968.2008.01418.x. — PMID 19025564. — PMC 2704933.

Литература

  • Drickamer K. C-type lectin-like domains (англ.) // Curr. Opin. Struct. Biol.. — 1999. — Vol. 9, no. 5. — P. 585—590. — doi:10.1016/S0959-440X(99)00009-3. — PMID 10508765.
  • Brown G.D. Dectin-1: a signalling non-TLR pattern-recognition receptor (англ.) // Nat. Rev. Immunol. : journal. — Nature Publishing Group, 2006. — Vol. 6, no. 1. — P. 33—43. — doi:10.1038/nri1745. — PMID 16341139.
  • Adams M.D., Kerlavage A.R., Fleischmann R.D., Fuldner R.A., Bult C.J., Lee N.H., Kirkness E.F., Weinstock K.G., Gocayne J.D., White O. Initial assessment of human gene diversity and expression patterns based upon 83 million nucleotides of cDNA sequence (англ.) // Nature : journal. — 1995. — Vol. 377, no. 6547 Suppl. — P. 3—174. — PMID 7566098.
  • Ariizumi K., Shen G.L., Shikano S., Xu S., Ritter R., Kumamoto T., Edelbaum D., Morita A., Bergstresser P.R., Takashima A. Identification of a novel, dendritic cell-associated molecule, dectin-1, by subtractive cDNA cloning (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 26. — P. 20157—20167. — doi:10.1074/jbc.M909512199. — PMID 10779524.
  • Yokota K., Takashima A., Bergstresser P.R., Ariizumi K. Identification of a human homologue of the dendritic cell-associated C-type lectin-1, dectin-1 (англ.) // Gene[англ.] : journal. — Elsevier, 2001. — Vol. 272, no. 1—2. — P. 51—60. — doi:10.1016/S0378-1119(01)00528-5. — PMID 11470510.
  • Hermanz-Falcón P., Arce I., Roda-Navarro P., Fernández-Ruiz E. Cloning of human DECTIN-1, a novel C-type lectin-like receptor gene expressed on dendritic cells (англ.) // Immunogenetics : journal. — 2001. — Vol. 53, no. 4. — P. 288—295. — doi:10.1007/s002510100326. — PMID 11491532.
  • Brown G.D., Gordon S. Immune recognition. A new receptor for beta-glucans (англ.) // Nature : journal. — 2001. — Vol. 413, no. 6851. — P. 36—7. — doi:10.1038/35092620. — PMID 11544516.
  • Willment J.A., Gordon S., Brown G.D. Characterization of the human beta -glucan receptor and its alternatively spliced isoforms (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 47. — P. 43818—43823. — doi:10.1074/jbc.M107715200. — PMID 11567029.
  • Sobanov Y., Bernreiter A., Derdak S., Mechtcheriakova D., Schweighofer B., Düchler M., Kalthoff F., Hofer E. A novel cluster of lectin-like receptor genes expressed in monocytic, dendritic and endothelial cells maps close to the NK receptor genes in the human NK gene complex (англ.) // Eur. J. Immunol.[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 31, no. 12. — P. 3493—3503. — doi:10.1002/1521-4141(200112)31:12<3493::AID-IMMU3493>3.0.CO;2-9. — PMID 11745369.
  • Grünebach F., Weck M.M., Reichert J., Brossart P. Molecular and functional characterization of human Dectin-1 (англ.) // Exp. Hematol.[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 30, no. 11. — P. 1309—1315. — doi:10.1016/S0301-472X(02)00928-1. — PMID 12423684.
  • Ahrén I.L., Eriksson E., Egesten A., Riesbeck K. Nontypeable Haemophilus influenzae activates human eosinophils through beta-glucan receptors (англ.) // Am. J. Respir. Cell Mol. Biol.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 29, no. 5. — P. 598—605. — doi:10.1165/rcmb.2002-0138OC. — PMID 12689921.
  • Ebner S., Sharon N., Ben-Tal N. Evolutionary analysis reveals collective properties and specificity in the C-type lectin and lectin-like domain superfamily (англ.) // Proteins : journal. — 2003. — Vol. 53, no. 1. — P. 44—55. — doi:10.1002/prot.10440. — PMID 12945048.
  • Clark H.F., Gurney A.L., Abaya E., Baker K., Baldwin D., Brush J., Chen J., Chow B., Chui C., Crowley C., Currell B., Deuel B., Dowd P., Eaton D., Foster J., Grimaldi C., Gu Q., Hass P.E., Heldens S., Huang A., Kim H.S., Klimowski L., Jin Y., Johnson S., Lee J., Lewis L., Liao D., Mark M., Robbie E., Sanchez C., Schoenfeld J., Seshagiri S., Simmons L., Singh J., Smith V., Stinson J., Vagts A., Vandlen R., Watanabe C., Wieand D., Woods K., Xie M.H., Yansura D., Yi S., Yu G., Yuan J., Zhang M., Zhang Z., Goddard A., Wood W.I., Godowski P., Gray A. The secreted protein discovery initiative (SPDI), a large-scale effort to identify novel human secreted and transmembrane proteins: a bioinformatics assessment (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 13, no. 10. — P. 2265—2270. — doi:10.1101/gr.1293003. — PMID 12975309. — PMC 403697.
  • Taylor P.R., Brown G.D., Herre J., Williams D.L., Willment J.A., Gordon S. The role of SIGNR1 and the beta-glucan receptor (dectin-1) in the nonopsonic recognition of yeast by specific macrophages (англ.) // J. Immunol.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 172, no. 2. — P. 1157—1162. — doi:10.4049/jimmunol.172.2.1157. — PMID 14707091.
  • Mantegazza A.R., Barrio M.M., Moutel S., Bover L., Weck M., Brossart P., Teillaud J.L., Mordoh J. CD63 tetraspanin slows down cell migration and translocates to the endosomal-lysosomal-MIICs route after extracellular stimuli in human immature dendritic cells (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2005. — Vol. 104, no. 4. — P. 1183—1190. — doi:10.1182/blood-2004-01-0104. — PMID 15130945.
  • de la Rosa G., Yáñez-Mó M., Samaneigo R., Serrano-Gómez D., Martínez-Muñoz L., Fernández-Ruiz E., Longo N., Sánchez-Madrid F., Corbí A.L., Sánchez-Mateos P. Regulated recruitment of DC-SIGN to cell-cell contact regions during zymosan-induced human dendritic cell aggregation (англ.) // J. Leukoc. Biol.[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 77, no. 5. — P. 699—709. — doi:10.1189/jlb.0904529. — PMID 15728245.
  • Willment J.A., Marshall A.S., Reid D.M., Williams D.L., Wong S.Y., Gordon S., Brown G.D. The human beta-glucan receptor is widely expressed and functionally equivalent to murine Dectin-1 on primary cells (англ.) // Eur. J. Immunol.[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 35, no. 5. — P. 1539—1547. — doi:10.1002/eji.200425725. — PMID 15816015.
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400