LAMP1

LAMP1
Идентификаторы
ПсевдонимыLAMP1, CD107a, LAMPA, LGP120, lysosomal associated membrane protein 1
Внешние IDOMIM: 153330 MGI: 96745 HomoloGene: 4061 GeneCards: LAMP1
Расположение гена (человек)
13-я хромосома человека
Хр.13-я хромосома человека[1]
13-я хромосома человека
Расположение в геноме LAMP1
Расположение в геноме LAMP1
Локус13q34Начало113,297,239 bp[1]
Конец113,323,672 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
8-я хромосома мыши
Хр.8-я хромосома мыши[2]
8-я хромосома мыши
Расположение в геноме LAMP1
Расположение в геноме LAMP1
Локус8 A1.1|8 5.73 cMНачало13,209,161 bp[2]
Конец13,225,338 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • visceral pleura

  • inferior olivary nucleus

  • metanephric glomerulus

  • pancreatic ductal cell

  • germinal epithelium

  • internal globus pallidus
Наибольшая экспрессия в
  • proximal tubule

  • utricle
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • protein domain specific binding
  • virus receptor activity
  • связывание с белками плазмы
  • enzyme binding
Компонент клетки
  • часть мембраны
  • multivesicular body
  • phagolysosome membrane
  • везикула
  • эндосома
  • late endosome
  • мембрана
  • синаптический пузырёк
  • cytolytic granule
  • меланосома
  • часть клеточной мембраны
  • alveolar lamellar body
  • поверхность клетки
  • lysosomal membrane
  • neuronal cell body
  • вакуоль
  • дендрит
  • phagocytic vesicle
  • perinuclear region of cytoplasm
  • Сарколемма
  • лизосома
  • endosome membrane
  • экзосома
  • цитоплазматическая везикула
  • наружная сторона клеточной мембраны
  • цитозоль
  • цитоплазма
  • клеточная мембрана
  • azurophil granule membrane
  • autolysosome
  • ficolin-1-rich granule membrane
  • integral component of synaptic vesicle membrane
  • late endosome membrane
Биологический процесс
  • protein stabilization
  • Golgi to lysosome transport
  • positive regulation of natural killer cell degranulation
  • regulation of organelle transport along microtubule
  • viral entry into host cell
  • вирусный процесс
  • establishment of protein localization to organelle
  • positive regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity
  • granzyme-mediated apoptotic signaling pathway
  • autophagic cell death
  • neutrophil degranulation
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

3916

16783

Ensembl

ENSG00000185896

ENSMUSG00000031447

UniProt

P11279

P11438

RefSeq (мРНК)

NM_005561

NM_010684
NM_001317353

RefSeq (белок)

NP_005552

NP_001304282
NP_034814

Локус (UCSC)Chr 13: 113.3 – 113.32 MbChr 8: 13.21 – 13.23 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

LAMP1 (англ. Lysosomal-associated membrane protein 1) — гликопротеин лизосомальной мембраны. Вместе с другим гомологичным белком LAMP2 составляет около 50 % от всех белков мембраны лизосом. Лизосомами считаются внутриклеточные органеллы, которые содержат эти белки.

Структура

Зрелый белок LAMP1 относится к трансмембранным белкам, содержит 389 аминокислот (сигнальный пептид, направляющий вновь синтезированный белок к лизосомам и позже отщепляющийся, содержит 27 аминокислот). Белковая часть молекулы имеет молекулярную массу около 40 кДа. Однако в клетке белок сильно гликозилирован так, что его полная масса составляет около 120 кДа, поэтому когда он был открыт в 1985—1986 годах его назвали «120-кДа лизосомальный мембранный гликопротеин» (120-kDa lysosomal membrane glycoprotein, lgp120).

Около 90 % белковой молекулы находится во внутреннем пространстве лизосомы и сильное гликозилирование защищает белок от агрессивной кислой и богатой гидролазами среды. Короткий цитозольный фрагмент отличается высоким консерватизмом и сохраняется в практически неизменном виде среди млекопитающих и птиц.

Применение в клеточной биологии

Так как по определению лизосомами считаются внутриклеточные органеллы, которые содержат в своей мембране LAMP1 и LAMP2, белок используется как клеточный маркёр лизосом.

См. также

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000185896 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031447 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

Библиография

  • Eskelinen E.L. Roles of LAMP-1 and LAMP-2 in lysosome biogenesis and autophagy (англ.) // Mol. Aspects Med.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 27, no. 5—6. — P. 495—502. — doi:10.1016/j.mam.2006.08.005. — PMID 16973206.
  • Kornfeld S., Mellman I. The biogenesis of lysosomes (англ.) // Annu. Rev. Cell Biol.[англ.] : journal. — 1989. — Vol. 5. — P. 483—525. — doi:10.1146/annurev.cb.05.110189.002411. — PMID 2557062.
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400